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ctgcCCTGATCG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGACAACTACATGCGCGTTATCTATAGCaa > 2:308902/1‑301 (MQ=255) cccTGATCG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTAAATGCACGTAACCTAAAGCAAAAc > 1:409486/1‑301 (MQ=255) aTCG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCCGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACAGAAAAAAACTACAAACGCGATaaccaaagacaaaacaccc > 1:285440/1‑283 (MQ=255) aTCG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCAGTAAACGTAATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATACGGACAACACTGAAGAAAACTAACTCCACGTTATCTAAAGACAAACcgcgc > 1:173347/1‑301 (MQ=255) cG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAACCTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGAGCGt > 2:590831/1‑301 (MQ=255) aGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCtataagatcggaagagcaca > 2:627700/1‑285 (MQ=255) cactcgtctaCTCTGCTAAACGACGACTTTGTGTATGAATCATATATGCGCAGGGGTAAATCTTCCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGTAAGTCATGTCATAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAgg < 2:173544/292‑1 (MQ=255) ggCTACACGGCGACGTTGTGGATTAATCAGATATGCGCAGGGGTAATGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAGGCTGCCGCGCAgtg < 1:464871/300‑1 (MQ=255) gCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAGGCTGCCGCGCAgtgt > 2:360926/1‑301 (MQ=255) acgacgacgTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAGGCTGCCGCGCAGTGTTCCgg > 2:258833/1‑301 (MQ=255) ttGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAGGCTGCCGCGCAGTGTTCCGGGATTctggc < 2:410049/301‑1 (MQ=255) | ACAGTAAGGTAATCGGGGCGAAAAGCCCGGCTTTTGCGATGAATTTAGAAAAAATCAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGT‑TAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCGACGTCCAACTGATCAATCAGTTAGGCTATTACATCGTCAGCGGCGGCGGTAAACGTATTCGTCCGATGATTGCTGTACTGGCTGCACGAGCTGTTGGCTATGAGGGAAATGCGCATGTCACCATTGCTGCCCTGATCG‑AGTTTATCCA‑CACGGCGACTCTGCTACACGACGACGTTGTGGATGAATCAGATATGCGCAGGGGTAAAGCTACCGCCAACGCCGCATTTGGCAATGCCGCCAGCGTGCTGGTAGGCGATTTTATTTATACCCGCGCTTTCCAGATGATGACCAGCCTCGGTTCGCTCAAAGTGCTGGAAGTCATGTCAGAAGCCGTAAACGTCATCGCAGAAGGTGAAGTTCTGCAACTGATGAACGTTAACGATCCGGACATCACTGAAGAAAACTACATGCGCGTTATCTATAGCAAAACCGCGCGTCTGTTTGAGGCTGCCGCGCAGTGTTCCGGGATTCTGGC > NC_000913/3333672‑3334266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |