| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2987087 = | 134 (1.790) | 4 (0.050) | 4/598 | 9.2 | 2.9% | intergenic (+11/‑449) | yqeG/yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 2987122 = | 136 (1.820) | intergenic (+46/‑414) | yqeG/yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTCGTCAAAACAACACTACAGCAGGTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAACATAATCATATTTGATAACG > NC_000913/2986789‑2987385 | gtcgtcAAAACAACACTACAGCAGGTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTtgtg < 1:515399/299‑1 (MQ=255) caacaCTACAGCAGGTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCaaaa > 2:469270/1‑301 (MQ=255) cTACAGCAGGTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCCACGTATCTCATCCCGTCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTTCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATGAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTg > 1:5369/1‑299 (MQ=255) ggTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAAtttt > 2:668460/1‑301 (MQ=255) ggTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAAtttt > 2:301662/1‑301 (MQ=255) tGGTTTAAAGAAAAGTCGTGCAGTTAACCGCGCACTATCAATGATGTTGGTAGCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTCACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGaa < 1:610642/301‑1 (MQ=255) gtgtACAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCGGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATAGCTGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTCGAAc > 2:569135/1‑300 (MQ=255) tgtAAAGAAAAGTCGTTCATTTAACCGCCCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCCTTGCCATGATACTTTTTATCATGCCTACCCTGTCCACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCCTCGGAAATCTGATTACCCTGATCGTGGGTCTCCTGTGCGTATCGGGAATGTTTTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑AGTGGTCAAAATTGTTACAATTTTgtaaca > 1:519219/1‑296 (MQ=255) gtAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAAccat > 2:405901/1‑301 (MQ=255) aaaGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTTGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAAccattc < 1:668449/301‑1 (MQ=255) tCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTc < 1:85216/300‑1 (MQ=255) tCGTGCATTTAACCGCGCAATATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTTTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa < 1:210497/301‑1 (MQ=255) cttGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTATTTGTTGCATTAACCCGAGCGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGACGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCat < 1:333289/299‑1 (MQ=255) cATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCataatt > 2:203833/1‑300 (MQ=255) aTTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGTTTACCTTCATTGTTTGTTGCATTACCCCGAACGCGATTTCGATGATCTACGCGATCATCGGCCCGCTCATTGCCATGTTACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTCTCTCCTCCCGGCGCTTAAACCCTTGCGTTCCATCGGATATCTGATTACGCTGTTCGTTGGTATCCTGTGCTTTTCGGTAATGTTCTTTAGCTAAGATCAGTTGTTG‑CTGCTTCAATATTGCTACAATTTTGAACCATTACATTTTTCatatttt > 1:154302/1‑297 (MQ=255) tttAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCTCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGAGTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCGGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGAATGGTTCAAAATTGTAGCAATTTTGAAccatccacaactgatattagc < 1:648115/301‑18 (MQ=255) cgcgCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGA‑TACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCCCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACTCTGTCAACGTACCCTATCCCGCCGCTCAAACCCTGGCGTTCCATCGATAATCTGTTTACGTTGATCGTGGGTATCCTGTCGTTATCGGTAATGTTCTTTTGCTACTATCAGTTGTGG‑ATGGTTCATAATTGCTACAATTTCGATCCATTCCATTTTTCATATTATCTAttttt > 2:147209/1‑299 (MQ=255) ccgcACTATCAATTAAGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCAATAGCCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGGTCAGCAGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCCACGGATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGt < 1:112244/300‑1 (MQ=255) tCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTc < 2:366267/301‑1 (MQ=255) aaTTATGTTGGTATCGCTTATTACCTTCATTGGTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCTATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCa < 1:531799/301‑1 (MQ=255) tATGTTTGTATCCCTGATTACCTTCAATGTTTGTTGCATTCACGCGAACGCGAGTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCACTCATTGCCAGGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCGTCCCTGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTTTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc < 1:54932/301‑1 (MQ=255) tATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCAccc < 2:123836/301‑1 (MQ=255) 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aTGTTCTTGAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGGTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACACTATCACTTCTCTAGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTg < 1:61802/301‑1 (MQ=255) tttttAGGTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATAATCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGACATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAAATCTAAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCGTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTATCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAAc < 1:662978/299‑1 (MQ=255) ttAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGACACATa > 1:524900/1‑301 (MQ=255) atCAGTTGTGG‑ATGGTTCGAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCTTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTTAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAACATAATCATAttt < 2:444424/301‑1 (MQ=255) atCAGTTGTGG‑ATGGTTAAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAACATAATCATAttt < 2:289168/301‑1 (MQ=255) tgG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAACATAATCATATTTGATAACg < 2:159595/300‑1 (MQ=255) | GTCGTCAAAACAACACTACAGCAGGTTGGTGTAAAGAAAAGTCGTGCATTTAACCGCGCACTATCAATTATGTTGGTATCGCTGATTACCTTCATTGTTTGTTGCATTAACCCGAACGCGATTTCGATGATTTACGCGATCAGCGGCCCGCTCATTGCCATGATACTTTTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTACAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTAGATTCGCAAGATATCTTCTGGTCATTCAAAAACAATTTGCGATATAGATATTCTTATACCATGAGATAGTTATCTGGACCGCTCTCAACCATGCAAGATTAAATCAGTGAAACATAATCATATTTGATAACG > NC_000913/2986789‑2987385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |