New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 307356 = | 96 (0.810) | 5 (0.040) | 5/284 | 11.5 | 5.4% | coding (1977/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
? | NC_000913 | 307385 = | 85 (0.760) | coding (1948/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
TATCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAACAG > NC_000913/307169‑307555 | tatCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATg > 1:629497/1‑200 (MQ=255) tatCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATg < 1:444884/200‑1 (MQ=255) 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gtgtTGACTATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTCGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTACCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGa > 4:347359/1‑150 (MQ=255) gtTGAATATCACCCCGGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTAt < 1:601682/200‑1 (MQ=255) gtTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTTCCAGCCGCCGCTGCCATTGGCGGTCACGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTTACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGc > 4:779104/1‑150 (MQ=255) gtTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGc > 4:142486/1‑150 (MQ=255) ttGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCg < 2:580489/141‑1 (MQ=255) atatCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGc > 3:401796/1‑132 (MQ=255) atatCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGa > 4:476259/1‑150 (MQ=255) atCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAAt < 4:387242/150‑1 (MQ=255) cACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATtg < 4:817447/150‑1 (MQ=255) cccccAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATATTTTTACCCTGCCAGCCGGCGCTGCCGTTGGCGGTGAAGTTGGAATGAACGTAGCCGTCCGCCGCGCAGTTGACGTGCAGCGTTCCACTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGAt < 1:231532/199‑1 (MQ=255) aCCCCGGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCg < 3:21722/132‑1 (MQ=255) aCCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGAt < 1:692654/200‑1 (MQ=255) cAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGa < 2:227411/141‑1 (MQ=255) cAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCcgccgc > 4:251727/1‑150 (MQ=255) cAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGgaga < 1:251733/183‑1 (MQ=255) aGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATtg < 3:829478/132‑1 (MQ=255) aGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGc < 2:631418/141‑1 (MQ=255) aGTCCGCCAGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATtg < 3:322894/132‑1 (MQ=255) ccgcccgcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCAc < 1:600611/200‑1 (MQ=255) cgtcggcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCAcc > 1:613051/6‑200 (MQ=255) tcggcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGt > 4:524713/4‑150 (MQ=255) ccgcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAAc < 1:447981/200‑1 (MQ=255) ccgcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAAc < 1:381549/200‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGCCGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAACAg < 1:860038/200‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAACAg < 1:665097/200‑1 (MQ=255) | TATCGTAACTGTCGAGTGAGTTTTTGCTGTTCTGTAACTCCACCTCATATCTTCCATAGGGAGAGAGCGGGAGATAGTTACGCTTGCCGTTAAGCGGGAAAATCCGCCCGTTGATTTTGGCGCTGATCTGACCGTCGTCCTCCAGCCCGGTGTTGAATATCACCCCAGCGTTGCCATCAGTCCGCCCGCTGGCAGCAATGTTTTTACCCTGCCAGCCGACGCTGCCATTGGCGGTCAAGTTGGTATTGACGTAGCCGTCCGCCGCGCTATTGACGTTCAGCGTTCCGCTGGCGTAACGAGCGTCGAATTGTGCATACGCCCCGCCGCTGAGGGTTTTGTCATCACCGGTATCGCCGGAGATGGCACGTGACAGATTGGCACCAACAG > NC_000913/307169‑307555 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |