New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4516891 = | 104 (0.880) | 5 (0.050) | 3/282 | 12.9 | 4.9% | coding (827/954 nt) | fecR | anti‑sigma transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA‑bound ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
? | NC_000913 | 4516925 = | 98 (0.880) | coding (793/954 nt) | fecR | anti‑sigma transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA‑bound ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGGGTAAAAAGGACAATCGAAATAAGAATTATTTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCACCAGCGTTCACGATGCGTTTTTGCGCGGGGGCACTGGCGAGAAGCACTTCCACAG > NC_000913/4516727‑4517116 | aGGGTAAAAAGGACAATCGAAATAAGAATTATTTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:289147/200‑1 (MQ=255) cAATCGAAATAAGAATTATTTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:322088/200‑1 (MQ=255) aTCGAAATAAGAATTATTTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:330314/1‑200 (MQ=255) ttattTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctcac > 1:191085/1‑200 (MQ=255) gtggtgAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCg > 1:174625/1‑200 (MQ=255) ggtgAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCt > 1:107023/1‑200 (MQ=255) tATCCAGTACCGCGTAATCGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCGTCGGTATTTTTCGGCGGGACCGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGa < 1:650029/200‑1 (MQ=255) aTCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg > 4:113935/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg > 4:456844/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg > 4:743808/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGAt < 1:149315/200‑1 (MQ=255) 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cAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCCTCCAGCGGTTTCa > 3:530627/1‑132 (MQ=255) aaCGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCAc < 3:615781/132‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGAGCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGGAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCAc < 3:311321/132‑1 (MQ=255) cggcggGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCACCAGCGTTCACGATGCGTTTTTGCGCGGGGGCa > 1:138922/1‑200 (MQ=255) ggcggGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGGGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTc < 2:184124/141‑1 (MQ=255) gcggGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTgcg > 3:377762/1‑132 (MQ=255) gATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAgg < 2:632957/141‑1 (MQ=255) gATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAgg < 2:341703/141‑1 (MQ=255) tCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGc > 4:648613/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGc > 4:244158/1‑150 (MQ=255) tCGCAACGCAGCACACCGTTGCAGTAACGGGATAGCGTGGATATCACCTCACCCAGCGGTATATCCCACAAGCTCAAGATGTCCTTCGTCCAACCTCTACTCTCGTCATCCAGCGGCTTCACTGCGCCAAAc > 3:192259/1‑132 (MQ=255) gcagcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTc < 3:619916/132‑1 (MQ=255) gcagcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAg > 4:384094/1‑150 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTTCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCt > 4:129961/1‑150 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGaa > 2:578150/1‑141 (MQ=255) gcgcagcACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGaa > 2:46589/1‑141 (MQ=255) cagcaCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTg > 2:538483/1‑141 (MQ=255) caCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCGCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCAcc < 4:464568/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCACCAGCGTTCACGATGCGTTTTTGCGCGGGGGCACTGGCGAGAAGCACTTCCACAg < 1:733527/200‑1 (MQ=255) gCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGACTTTCACCAGCGTTCACGATGCGTTTTTGCGCGGGGGCACTGGCGAGAAGCACTTCCACAg < 1:564243/200‑1 (MQ=255) ccGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAAc > 3:763957/1‑132 (MQ=255) ccGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCtt > 2:88161/1‑141 (MQ=255) gCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAg < 3:178857/132‑1 (MQ=255) gCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCAcc > 2:547660/1‑141 (MQ=255) | AGGGTAAAAAGGACAATCGAAATAAGAATTATTTTCCTTACAGTGGTGAAATGTTTATCCAGTACCGCGTAATAGACTGAATTTTAACGGGAAGCGTTTGCGCGATAACGTTCAGGATCGCATCGGTATTTTTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGTCCAGCTTGTACTCTCGTCATCCAGCGGTTTCACTGCGCCAAACTCAGAGGCGCTGAACTGCAGGCTTTCACCAGCGTTCACGATGCGTTTTTGCGCGGGGGCACTGGCGAGAAGCACTTCCACAG > NC_000913/4516727‑4517116 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |