| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2937424 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/284 | 11.7 | NA | intergenic (+65/‑44) | fucI/fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase |
| ? | NC_000913 | 2937452 = | NA (NA) | intergenic (+93/‑16) | fucI/fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GACCAAAGTGTATCGTCCTTCTGCCTGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGC > NC_000913/2937257‑2937650 | gaCCAAAGTGTATCGTCCTTCTGCCTGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGGACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTg < 4:562531/200‑1 (MQ=255) gcACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTgg < 4:124721/200‑1 (MQ=255) ggATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACt > 4:261150/1‑200 (MQ=255) atatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGTACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACtgt > 4:654111/1‑200 (MQ=255) ggCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGAc > 4:390282/1‑200 (MQ=255) gATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATAtt > 1:757392/1‑141 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTc < 4:130720/200‑1 (MQ=255) ttACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGCACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCa > 4:586257/1‑200 (MQ=255) gcgcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAg < 1:191120/141‑1 (MQ=255) cgcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGGTGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTatat < 3:628201/132‑1 (MQ=255) tGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCa > 3:508687/1‑132 (MQ=255) tGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATcgc > 4:186033/1‑200 (MQ=255) gCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTa < 1:603606/141‑1 (MQ=255) aaCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGaaa > 1:383141/1‑141 (MQ=255) cTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGAt > 3:455178/1‑132 (MQ=255) cTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTAt > 2:874854/1‑150 (MQ=255) 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cGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTc > 1:288209/1‑141 (MQ=255) cGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTc > 1:68316/1‑141 (MQ=255) cGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGgc > 2:677775/1‑150 (MQ=255) gTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATcc < 3:30504/132‑1 (MQ=255) gTTAATACATTACGGCTGGATGTGATGCACGGTCGCTGGGGCTACCGGGCATGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCAGGATAAGCAATGTTATCCGGATATATGGCAGGAGCGATTATGAAAGAAGAAGTTAGcc < 3:410909/132‑1 (MQ=255) tAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGGTCCGGCTACCTGGCCTGAACAAGGAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGGGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGAc < 1:657749/141‑1 (MQ=255) tAAGACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGAc < 1:168580/141‑1 (MQ=255) aTACATTACTCCCTGATGTGCTGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCACTGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGCTTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACACGACTGTGGcgcgcc > 2:906806/1‑148 (MQ=255) aTACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGt > 3:171049/1‑132 (MQ=255) tACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTa < 3:62356/132‑1 (MQ=255) aCATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTAc < 3:188187/132‑1 (MQ=255) aCATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGcc > 4:755274/1‑200 (MQ=255) cATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTgg > 1:200101/1‑141 (MQ=255) aCTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTc > 2:417536/1‑150 (MQ=255) cTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCa > 2:615608/1‑150 (MQ=255) tCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAg > 2:254231/1‑150 (MQ=255) 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aTGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATcgcg < 2:182963/150‑1 (MQ=255) aTGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATcgcg > 2:770213/1‑150 (MQ=255) gTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTaa > 3:324015/1‑132 (MQ=255) gTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACCGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGTGGTTAATTGGCAGGGCAAAATTGTTGCCGGCGCCACAACGCCTAATGCCAGCgt > 1:418170/1‑140 (MQ=255) ttATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCACGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGaa > 1:57996/1‑140 (MQ=255) tATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCttt < 4:80421/200‑1 (MQ=255) tATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCttt > 4:189216/1‑200 (MQ=255) ggCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCACGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGc < 3:75136/132‑1 (MQ=255) gCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAaaca > 2:478258/1‑150 (MQ=255) cTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCAATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGAtt < 4:417566/200‑1 (MQ=255) atatTGCCGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGTCACAATTGTTGCCCGCGCCTCCCCGCCTAATGCCAGCTatc > 3:530044/1‑131 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGTCATCGCGGTTAATTGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCGAATGCCAGCGata > 3:154443/1‑132 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGata > 3:492454/1‑132 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATgg > 1:634934/1‑141 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAacaaca > 2:737279/1‑150 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCCGTGGGCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGc > 4:679771/1‑200 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGc > 4:506020/1‑200 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGc > 4:806986/1‑200 (MQ=255) atatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGc > 4:203138/1‑200 (MQ=255) tatTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGa > 1:514529/1‑141 (MQ=255) | GACCAAAGTGTATCGTCCTTCTGCCTGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCGGCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAGTTATCCTGGTACTCGACTGTGGCGCGACCAATGTCAGGGCCATCGCGGTTAATCGGCAGGGCAAAATTGTTGCCCGCGCCTCAACGCCTAATGCCAGCGATATCGCGATGGAAAACAACACCTGGCACCAGTGGTCTTTAGACGCCATTTTGCAACGCTTTGCTGATTGC > NC_000913/2937257‑2937650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |