| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3973849 = | 125 (1.110) | 3 (0.030) | 3/298 | 12.8 | 2.4% | coding (242/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
| ? | NC_000913 | 3973867 = | 126 (1.150) | coding (260/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCG > NC_000913/3973670‑3974065 | aTCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGgcgc < 4:727650/200‑1 (MQ=255)aTCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGgcgc < 4:461614/200‑1 (MQ=255)aTCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGgcgc < 4:863546/200‑1 (MQ=255) aaGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGc < 4:690391/200‑1 (MQ=255) aGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGcc < 4:775382/200‑1 (MQ=255) aGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATCTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGcc < 4:740775/200‑1 (MQ=255) aCTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTa > 4:663992/1‑200 (MQ=255) tGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatc < 4:309938/200‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatc < 4:125575/200‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatcat < 4:346252/200‑1 (MQ=255) aGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcctt > 4:847401/1‑200 (MQ=255) aTGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATgg < 4:18029/200‑1 (MQ=255) aCTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACct > 4:262141/1‑200 (MQ=255) aTCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttct > 4:168482/1‑200 (MQ=255) 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atcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAg < 4:528656/200‑1 (MQ=255) tcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTa < 1:577168/141‑1 (MQ=255) tcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACC‑TCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGa > 4:46465/1‑200 (MQ=255) caCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATgg < 1:126982/141‑1 (MQ=255) caCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATgg < 1:595588/141‑1 (MQ=255) 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ggAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgggg < 4:316990/164‑1 (MQ=255) atGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGc > 3:325036/1‑132 (MQ=255) atGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGACGGGGCGACGGTTTTTTGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCttt > 4:182583/1‑200 (MQ=255) cGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCa < 3:166373/132‑1 (MQ=255) aCAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg < 2:383248/150‑1 (MQ=255) gcctagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTCTCATCGGTGAACCCTCCCTTAATGGTGACCCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATACCATCTTCTCCGGTAACGGCTTCAGCCCGACGCCGCGTCATGTTgc > 3:621793/1‑132 (MQ=255) gcccagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgcgccc > 1:114123/1‑139 (MQ=255) gcccagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCAc > 1:365933/1‑141 (MQ=255) cccagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCGCCGAAGGGGCGACGG‑TTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAg < 4:577994/200‑1 (MQ=255) agcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACCTCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcggcg < 3:567969/132‑1 (MQ=255) gcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAg > 1:523290/1‑141 (MQ=255) cccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg < 1:39551/141‑1 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAg > 3:400869/1‑132 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACgg > 1:33283/1‑141 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACgg > 1:593088/1‑141 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCt > 2:498515/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAt > 4:136022/1‑200 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAt > 4:188063/1‑200 (MQ=255) tCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg < 3:683480/132‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTGCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgggg < 3:619548/132‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGttttt > 1:729552/1‑141 (MQ=255) cgcAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAgg < 2:745417/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTAATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAgg < 2:562912/150‑1 (MQ=255) | ATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCG > NC_000913/3973670‑3974065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |