New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1740872 = | 81 (0.790) | 3 (0.030) | 3/290 | 10.6 | 3.5% | coding (962/1212 nt) | ydhC | putative arabinose efflux transporter |
? | NC_000913 | 1740913 = | 90 (0.920) | coding (1003/1212 nt) | ydhC | putative arabinose efflux transporter | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
CGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGT > NC_000913/1740685‑1741059 | cgcgccgcgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCtt < 2:138616/200‑1 (MQ=255) gccgcgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTccc < 2:812013/200‑1 (MQ=255) cAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAAc < 2:86572/200‑1 (MQ=255) ccGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAacac < 2:4572/200‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTGCTGTTGGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTc < 2:25743/200‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAAc < 2:191568/200‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTg < 2:114194/200‑1 (MQ=255) tGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCt < 2:548588/200‑1 (MQ=255) tGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCt < 2:428967/200‑1 (MQ=255) tCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTGGCCATATGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCcac < 3:459781/141‑1 (MQ=255) gCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACg > 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ccTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGc < 4:305223/132‑1 (MQ=255) cTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCa < 4:501140/132‑1 (MQ=255) aTTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACg > 4:388520/1‑132 (MQ=255) aTTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCaccaccacc < 1:72372/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACGCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCa < 2:440055/200‑1 (MQ=255) tgttgtCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGcc < 4:4883/132‑1 (MQ=255) ttgtCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGt < 2:16314/200‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATg < 1:325945/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTcacc < 4:149893/132‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTcacc < 4:498850/132‑1 (MQ=255) | CGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCACCACCACCAGCGTGATGTTATCAACAGTAGTGCTGGTCGCGCTGGGTTACATGATGCAACGT > NC_000913/1740685‑1741059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |