| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3671463 | 176 (1.720) | 4 (0.040) | 4/290 | 9.9 | 2.3% | coding (432/603 nt) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional response regulator |
| ? | NC_000913 | = 3671507 | 178 (1.820) | coding (388/603 nt) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional response regulator | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTGCACCACGGTTTTTTGC > NC_000913/3671310‑3671700 | ttGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGCCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGctcg > 2:364838/1‑197 (MQ=255) gccTGTGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGCTTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAgcggga < 2:624676/200‑6 (MQ=255) gccTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTcc > 2:65482/1‑200 (MQ=255) gtgTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTGCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGACGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGc < 2:135675/198‑1 (MQ=255) ggTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCa < 2:527403/200‑1 (MQ=255) cTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATcccc > 2:150302/1‑200 (MQ=255) cGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATcgccgc > 2:332307/1‑200 (MQ=255) aTACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTAt < 2:519419/200‑1 (MQ=255) gggATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTAcc < 2:392360/200‑1 (MQ=255) ttCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCg > 1:92712/1‑150 (MQ=255) cgcTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCg > 3:279823/1‑141 (MQ=255) cgcTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTcc > 1:336939/1‑150 (MQ=255) cTTTTACCTTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGTTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCTGGCGCTTACCGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAg > 1:753539/1‑150 (MQ=255) cTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGcc > 3:308628/1‑141 (MQ=255) ttttACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTA‑TTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAg < 3:703477/141‑1 (MQ=255) ttCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTTATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAAca > 1:24543/1‑150 (MQ=255) ttCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCTGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAg > 3:253655/1‑141 (MQ=255) ttCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGcc > 4:410544/1‑132 (MQ=255) ttCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGtt > 2:581378/1‑200 (MQ=255) ccGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAg < 4:336451/132‑1 (MQ=255) cTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATcccc > 1:574766/1‑150 (MQ=255) cTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATcccc < 1:74344/150‑1 (MQ=255) cTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACg > 2:773966/1‑200 (MQ=255) cTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACg > 2:457425/1‑200 (MQ=255) gATATTCAGTGCTCTGCCGTTCTCCTTATTTGATTCGCACGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCTCTTAACGATTTGAGATCTTTTATGTCCTTTTCTTGCGTCGTCCGCCAGTTTCCTGGCAGAAACATCATCCCCAt > 1:403679/1‑150 (MQ=255) atatTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGc < 4:226048/132‑1 (MQ=255) tatTCAGCGCTCTGCTGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGc < 2:125612/200‑1 (MQ=255) atTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGca > 2:313456/1‑200 (MQ=255) gcgcTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGACACAATg > 2:168061/1‑200 (MQ=255) cgcTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATgg < 2:573737/200‑1 (MQ=255) cgcTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATgg < 2:717348/200‑1 (MQ=255) ctctGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTAt < 1:529668/150‑1 (MQ=255) ctGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACatcatc > 4:544900/1‑132 (MQ=255) gCCGATTTCCTTATTTGATTAGCCCGCCGCTAACATGGTTACAGTCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATccc < 4:373712/132‑1 (MQ=255) gCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTCACGCTTGTCGATCGTTAATGTCCTTTTCCCGAGTCGTCCGACACTCTCCAGGCAGCAACATCATccc > 4:713654/1‑132 (MQ=255) 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gcgcTTTAATGTCCTCTTCCGGCGTCGTACGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTaa < 4:96512/129‑1 (MQ=255) gaTCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTaa < 4:201369/132‑1 (MQ=255) gaTCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTa > 1:278041/1‑150 (MQ=255) gtCTTTAATGTCCTTTTACGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAAc < 3:57973/140‑1 (MQ=255) tCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACt > 3:454322/1‑141 (MQ=255) tCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGaaa > 2:820927/1‑200 (MQ=255) cTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACtt > 3:634435/1‑141 (MQ=255) cTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAacc < 1:313429/150‑1 (MQ=255) cTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTAGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCGGCACAATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAacc < 1:206330/150‑1 (MQ=255) ttAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTcc > 3:357675/1‑141 (MQ=255) ttAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAaccac > 1:484911/1‑150 (MQ=255) ttAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTg > 2:791404/1‑200 (MQ=255) ttAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTg > 2:741971/1‑200 (MQ=255) tAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTGc < 2:419885/200‑1 (MQ=255) aTGTCCTTTTCCGGCAGCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCGGCACTAGTGACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATa < 4:177036/132‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAAc > 4:565911/1‑132 (MQ=255) cGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTaa < 4:379291/132‑1 (MQ=255) gCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTAt < 3:544059/141‑1 (MQ=255) gtcCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGt > 4:520232/1‑132 (MQ=255) gtcCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAAcc > 2:37550/1‑168 (MQ=255) | CATCATTGCCGCCTGGGTGCGATTTTTCACTTCCAGACGGCGATACAGGGATTCCAGATGCGCTTTTACCGTTCCGGTACTGATATTCAGCGCTCTGCCGATCTCCTTATTTGATTCGCCCGCCGCTAACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTCCGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCACTATTTACCGCCAACGCAAATGTCTCGACGGTTGAATCACGAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTGCACCACGGTTTTTTGC > NC_000913/3671310‑3671700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |