Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 384543 | 385053 | 511 | 40 [38] | [39] 41 | [yaiS] | [yaiS] |
GTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCATAACAAGACAGGGGAGCAGACAATCATGGCAATTTCATCGCGTAACA > NC_000913/384955‑385253 | gTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATAATCTGTGc > 2:621028/1‑200 (MQ=255) gatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGttttt > 4:89562/1‑132 (MQ=255) gatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatca > 1:788419/1‑150 (MQ=255) gatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa < 2:788485/162‑1 (MQ=255) aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAgtgt < 1:291737/59‑1 (MQ=255) aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAgtgt > 2:291762/1‑59 (MQ=255) taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGa < 4:153153/51‑1 (MQ=255) taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGa > 3:153157/1‑51 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTACGAATAAAATCATCt > 4:106385/1‑132 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCt > 4:731074/1‑132 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAAtt > 1:584779/1‑150 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCATAACAAGACAgg > 2:134871/1‑200 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTctt > 4:293652/1‑98 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATGTTCCCAATGGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTGTTTTTGCTAAGAATACAATCATCTGTGCGATAACGACTAAtt > 1:588946/1‑150 (MQ=255) aaaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt < 2:800269/84‑1 (MQ=255) aaaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATAtt > 1:800202/1‑84 (MQ=255) aaaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTCATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTTTGCg > 4:268502/1‑132 (MQ=255) aaaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa < 3:268510/136‑1 (MQ=255) aaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTa > 1:394644/1‑150 (MQ=255) aaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCATAACAAGAc < 2:394691/191‑1 (MQ=255) aTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTaa > 3:729565/1‑141 (MQ=255) aTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc < 2:731506/144‑1 (MQ=255) aTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc > 1:731447/1‑144 (MQ=255) tctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAat > 3:159899/1‑119 (MQ=255) tctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAat < 4:159895/119‑1 (MQ=255) tctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaat > 1:428865/1‑150 (MQ=255) ctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc < 4:682805/127‑1 (MQ=255) ctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc > 3:682835/1‑127 (MQ=255) ctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa > 4:162522/1‑132 (MQ=255) ctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa > 4:79655/1‑132 (MQ=255) tAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaatgaatg > 1:432415/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa > 4:711620/1‑123 (MQ=255) aTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa < 3:711651/123‑1 (MQ=255) gtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAat > 2:26146/1‑110 (MQ=255) gtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAat < 1:26144/110‑1 (MQ=255) gtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaat > 3:14944/1‑141 (MQ=255) gtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAc > 2:781708/1‑163 (MQ=255) gCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTAt < 3:731107/141‑1 (MQ=255) cATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAc < 1:781642/150‑1 (MQ=255) cTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCATAACAAGACAGGGGAGCAGACAATCATGGCAATTTCATCGCGTAaca > 2:474238/1‑200 (MQ=255) cTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGttct > 4:120375/1‑130 (MQ=255) | GTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCATAACAAGACAGGGGAGCAGACAATCATGGCAATTTCATCGCGTAACA > NC_000913/384955‑385253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |