Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3360839 | 3361288 | 450 | 40 [37] | [38] 40 | [gltF] | [gltF] |
CTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTCAGTCGACCA > NC_000913/3361126‑3361488 | cTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGggc < 2:250641/200‑1 (MQ=255) aatTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTCTGGGATAc > 2:296191/1‑200 (MQ=255) gTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATAccc > 3:36556/1‑141 (MQ=255) gTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTCTGGGAAAcatcat > 2:533514/1‑200 (MQ=255) tattaAGGATATGTTCATATGTTTTTCAATAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGAGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCt > 3:646318/1‑141 (MQ=255) ggATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTgc > 2:733743/1‑200 (MQ=255) ggATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTgc > 2:370476/1‑200 (MQ=255) gATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCAt > 3:563234/1‑141 (MQ=255) gctCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGTCGAGTATACCCCTGGTGCATGTAACCCAgttgtt > 1:671847/3‑150 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGt > 4:647127/1‑132 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTAcc > 3:337263/1‑141 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTAcc > 3:267663/1‑141 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAgttgtt > 1:652278/1‑150 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGaa > 2:610265/1‑200 (MQ=255) gTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCAGGTAcc > 3:72492/1‑141 (MQ=255) ttCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTa > 1:640705/1‑150 (MQ=255) aGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTa < 4:646291/132‑1 (MQ=255) ccTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATAcccc < 2:302536/105‑1 (MQ=255) ccTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATAcccc > 1:302510/1‑105 (MQ=255) gctgctATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACt > 2:377232/1‑200 (MQ=255) tATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGCCTATGGGAAACATCATaa > 1:604627/1‑150 (MQ=255) aCTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAAca > 4:549748/1‑132 (MQ=255) cTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCCACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGTAAACATGATAACAGTGCGCTGCAt > 1:161616/1‑150 (MQ=255) ttCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACAt > 2:103703/1‑200 (MQ=255) cTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATa > 4:71392/1‑132 (MQ=255) gcagcaTTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGACACATCATAACAGTGCGCTGAAt > 3:270146/1‑141 (MQ=255) gcagcaTTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAAt > 3:396022/1‑141 (MQ=255) aTTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAAc > 2:202981/1‑198 (MQ=255) aGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCACTGCATCCGACCGGTaaaat > 4:631025/1‑131 (MQ=255) gactCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGTGAGTATACCTCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGTCGGCGGCATTGTCGACTATGGGAACCATCATAACAGTGAGCTGAATCCGACCGGTaaacct > 4:15348/4‑129 (MQ=255) gATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTACGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATCAACTg > 3:263844/1‑141 (MQ=255) cTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAAc < 4:396010/132‑1 (MQ=255) gATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTg > 4:148985/1‑132 (MQ=255) gAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGc > 1:109246/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAata > 1:723076/1‑150 (MQ=255) atcGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGc > 2:620746/1‑169 (MQ=255) cGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAAc < 1:202965/150‑1 (MQ=255) gTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTCAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGtac > 4:687752/1‑132 (MQ=255) gTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTCAGTCGACCa > 2:518747/1‑200 (MQ=255) gTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTCACTATGGGAAACATCATTACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTCGGCCGCAACAACAGcac > 4:390449/1‑132 (MQ=255) | CTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCAAGGATAACCGTCAGTCGACCA > NC_000913/3361126‑3361488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |