| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,875,521 | 0 | T→C | 15.2% | 17.9 ‑10.7 ‑0.0 | 134 | A28A (GCT→GCC) | yidX | putative lipoprotein |
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/0): ref base (59/53): total (79/55) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.33e-05 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.89e-01 | ||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAA > NC_000913/3875346‑3875718 | ggaaGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAATATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGt < 2:165929/197‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGc < 2:249884/200‑1 (MQ=255) cTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGa > 2:58448/1‑200 (MQ=255) tAAACAGGAGGAAAAGAAGAATATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGac < 2:498983/200‑1 (MQ=255) ggAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTGTCGTTTGCTATAACAAAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTg > 2:446329/1‑200 (MQ=255) ggAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGt > 3:72041/1‑141 (MQ=255) ggAAAGAAGAGTATGCATTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGATGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATag < 1:147916/150‑2 (MQ=255) gAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGTtt > 3:685400/1‑141 (MQ=255) gAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGtt > 3:684757/1‑141 (MQ=255) aaaGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑c > 2:99710/1‑196 (MQ=255) aagaagATAATTCTTTCAACGGCGTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTGTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGc < 2:797290/200‑1 (MQ=255) gaagaGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGTCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCaa > 1:32294/1‑150 (MQ=255) gaagaGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGctc > 4:537608/1‑132 (MQ=255) gaagaGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCACCA‑CTGGGCTa > 2:528166/1‑200 (MQ=255) agagTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCAt < 3:139572/141‑1 (MQ=255) agagTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGTCTCCCAt > 3:477206/1‑141 (MQ=255) gagTATTCTTGCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAgg < 1:678892/150‑1 (MQ=255) gagTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCg > 2:472347/1‑200 (MQ=255) gTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGtt > 4:385231/1‑132 (MQ=255) gTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCa > 2:39077/1‑200 (MQ=255) tATGCTTTAAAAGGGTTAGGTACTCGTTTAAAGGATTAAGCATTAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTACCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCg < 3:667774/141‑1 (MQ=255) gCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGCTTTGCTCGAACACAAAGAAAAAATCAGTCAAGTAACAAGTGCAAACAGGCACTATCA‑CTGGGCTATCGCCggaa > 2:658164/1‑198 (MQ=255) cTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTGAAGGTATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGTCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTc < 1:383302/150‑1 (MQ=255) ttCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGTTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAg > 1:92327/1‑150 (MQ=255) aacgaattAGATACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAGTGGATTGTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTTTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGaa < 1:191552/144‑1 (MQ=255) cGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGTTTCCTTTACAGAAAAGGGTAGt > 3:145523/1‑141 (MQ=255) ggCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTGTTTTCCCTGACCGAAAAGGGTTGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATAA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGt > 2:121900/1‑200 (MQ=255) gCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCaaa > 4:283109/1‑132 (MQ=255) gCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTAATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGTAAAGTa > 1:313580/1‑150 (MQ=255) gCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTCTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCACGTATGCTCTGGCTTCCCATACCGCaaa > 4:58751/1‑132 (MQ=255) tAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAg > 1:595449/1‑130 (MQ=255) tAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAg < 2:595502/130‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGacac < 1:290461/150‑1 (MQ=255) ggATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACAcc > 1:221143/1‑150 (MQ=255) ggATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGTCTCCCATAACTCAAAGGCTAGTTCAGGAAAGTATCAATCCCCGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGCTAGTAATGGAACAAAAGGCTATGt > 2:72246/1‑200 (MQ=255) ggATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTGGTTTCCCTTACCCCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGAATCCATGGCAg > 3:137922/1‑141 (MQ=255) ggATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCGTCGTTTGCCTGAAAAAAAAAAGTAGATCAGGAAAATATCAATCGCAGTCAGACACCGTCA‑CTGGGCTATCACAGGCAAAAGAGAGAAATGGAACAAAAGGCTAAGt > 2:655265/1‑200 (MQ=255) 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ggCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCT‑CTGTGCTATCGCAGGCTAAAGATAGTAATGGAACaaa > 4:49075/1‑132 (MQ=255) cgcTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCCCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGttt > 3:598952/1‑141 (MQ=255) gATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTa > 4:666834/1‑132 (MQ=255) gCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAgg > 3:187273/1‑141 (MQ=255) cTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTc < 4:452982/53‑1 (MQ=255) cTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGaa > 3:91218/1‑58 (MQ=255) cTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGtt > 4:545780/1‑132 (MQ=255) cTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGAtt > 2:230371/1‑154 (MQ=255) cTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTCGTTTCCCCTACCGCAAACGGTAGTTCAGGAACGTATCAATCTCACTCACACACCTTCA‑CTGGGCTATCGCAGACAAAAGATAGTAATGGAACCAAAGGCTATTtt > 4:296113/1‑132 (MQ=255) ttCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGa > 3:317953/1‑141 (MQ=255) tCAGGCTGTATCTCGTATACTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGTTAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATcc < 2:411478/200‑1 (MQ=255) cAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGAtt < 1:230355/150‑1 (MQ=255) gCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTAcc > 1:688533/1‑150 (MQ=255) cTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCt < 1:58444/150‑1 (MQ=255) gTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTc > 2:524998/1‑43 (MQ=255) gTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTc < 1:524947/43‑1 (MQ=255) gTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAGTTACAAATCGAAGTAAGACACC‑TCATCTGGGCTATCGCAGCCAAAGGATGTAAATGGAACAAAGGGTATTGTTTTGGTGggga > 4:408231/1‑131 (MQ=255) gTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTgg > 3:548720/1‑141 (MQ=255) aTCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTaa > 2:622612/1‑200 (MQ=255) tctcGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAAGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCACCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCa < 1:528115/150‑1 (MQ=255) ctcGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATc > 4:365784/1‑132 (MQ=255) ctcGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCAc < 1:130707/150‑1 (MQ=255) ctcGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCAc > 1:122284/1‑150 (MQ=255) ctcGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCAc < 1:42074/150‑1 (MQ=255) cGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTCTGTTTTTGTAGGGGAATCGc > 4:4495/1‑132 (MQ=255) cGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTg > 1:367488/1‑150 (MQ=255) cGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTAACAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCgg > 2:701286/1‑200 (MQ=255) aTGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATg > 1:12181/1‑150 (MQ=255) | GGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCA‑CTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAA > NC_000913/3875346‑3875718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |