| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 957583 | 153 (1.220) | 3 (0.030) | 3/284 | 12.7 | 2.1% | intergenic (+129/‑70) | ycaP/serC | UPF0702 family putative inner membrane protein/3‑phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase |
| ? | NC_000913 | = 957595 | 135 (1.130) | intergenic (+141/‑58) | ycaP/serC | UPF0702 family putative inner membrane protein/3‑phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CAATTATGTCCGCGCTGTGCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTACGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGC > NC_000913/957389‑957781 | cAATTATGTCCGCGCTGTGCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGaataa < 4:756993/200‑1 (MQ=255) aTTATGTCCGCGCTGTGCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATg < 4:50633/200‑1 (MQ=255) tcaccgcTGTGAAAAGCCAGAATGAACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACAGATAACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGGGAGATTCATTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGTTAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTAc < 4:1085836/196‑1 (MQ=255) tCCGCGCTGTGCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTAc < 4:848854/200‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTGCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTAcc < 4:368180/200‑1 (MQ=255) gtgCAAATCCAGAATGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTc > 4:425900/1‑200 (MQ=255) tGGACGAAGGCAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGAcc < 4:30748/200‑1 (MQ=255) cAAGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAAt < 4:200404/200‑1 (MQ=255) aGTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAg < 4:304792/200‑1 (MQ=255) gTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAgc < 4:599630/200‑1 (MQ=255) gTCGGGCAAAACGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAgc < 4:156524/200‑1 (MQ=255) aaCGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATg < 2:111891/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGt < 2:55744/150‑1 (MQ=255) gTGACCTGACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACgtggtg < 4:48948/200‑1 (MQ=255) tGACAGTAAAAACATCGTCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGGGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCtgtg < 2:667230/150‑1 (MQ=255) gACAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGaa < 4:343975/200‑1 (MQ=255) aCAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTACTACCTGTGGt < 2:253843/150‑1 (MQ=255) cAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGaat < 1:525533/132‑1 (MQ=255) cAGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAAt > 4:214192/1‑200 (MQ=255) aGTAAAAACATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATg > 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1:275686/1‑132 (MQ=255) aCATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCaaa > 4:361501/1‑200 (MQ=255) cATCGGCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGAt > 2:293299/1‑150 (MQ=255) ggCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCtg < 1:664938/132‑1 (MQ=255) ggCTTTTTGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCtg < 1:427401/132‑1 (MQ=255) ttttGCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGt < 1:774331/132‑1 (MQ=255) gCTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGa > 3:13703/1‑141 (MQ=255) cTAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGAc < 3:275697/141‑1 (MQ=255) aataatCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAAt < 2:801280/150‑1 (MQ=255) taacCCGAGAGATTCTTTTTTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTGCTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTGCCTGTGGTCTCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAg < 2:333397/150‑1 (MQ=255) aatCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGAt < 1:487506/132‑1 (MQ=255) atCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGAtt > 1:549460/1‑132 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1:497077/1‑132 (MQ=255) gTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAAttt > 3:569706/1‑141 (MQ=255) gTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTgg > 2:729799/1‑150 (MQ=255) gTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTgg > 2:141540/1‑150 (MQ=255) tttACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATATATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTgcgc < 4:794961/200‑1 (MQ=255) aTTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAAttt > 1:11671/1‑132 (MQ=255) 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(MQ=255) gtgtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATg > 3:375415/1‑141 (MQ=255) gtgtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTgg > 4:416860/1‑200 (MQ=255) tgtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTc < 1:13703/132‑1 (MQ=255) gtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGGAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTa < 4:771066/200‑1 (MQ=255) gtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTa < 4:484846/200‑1 (MQ=255) ggcACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTa < 4:323031/198‑1 (MQ=255) tCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCagag > 2:435528/1‑150 (MQ=255) cACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTACg > 4:611804/1‑200 (MQ=255) ggATAATACCGTTAGCCACAGCAATAATTTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGAGCGGGGGTTAATAGCAACGCAACGGTGTGGCGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCGACCGGCAGAGTTGCTTaa < 2:189778/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |