New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CAGAACTGGTTCCAGGTGAACTCATACAGAATGCCTGCGGCGATATCGAAGCGGAAGCTGTCCAGCGCTTCGCGGTACGCTTTGATGGTCTGGTTGAACTCCGCCAGAATCCAGCGGTCCGCCAGCGACAGCGTCATTTCGCCGCCGTTGAAGCCGCAATCCTGACCTTCTGTGTTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTGCGGCTGCATCATATTGCCGGTACG > NC_000913/4481700‑4482097 | caGAACTGGTTCCAGGTGAACTCATACAGAATGCCTGCGGCGATATCGAAGCGGAAGCTGTTCAGCGCTTCGCGGTACGCTTTGATGGTCTGGTTGAACTCCGCCAGAATCCAGCGGTCCGCCAGCGACAGCGTCATTTCGCCGCCGTTGAAGCCGCAATCCTGACCTTCTGTGTTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGtt > 4:667409/1‑200 (MQ=255) caGAACTGGTTCCAGGTGAACTCATACAGAATGCCTGCGGCGATATCGAAGCGGAAGCTGTCCAGCGCTTCGCGGTACGCTTTGATGGTCTGGTTGAACTCCGCCAGAATCCAGCGGTCCGCCAGCGACAGCGTCATTTCGCCGCCGTTGAAGCCGCAATCCTGACCTTCTGTGTTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGtt > 4:704749/1‑200 (MQ=255) 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(MQ=255) gtgtTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCa > 2:324646/1‑150 (MQ=255) gtgtTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAg > 4:715116/1‑200 (MQ=255) gtgtTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAg > 4:279201/1‑200 (MQ=255) gtTCATCAGCACAAAGCGACTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATccc < 2:17668/77‑1 (MQ=255) gtTCATCAGCACAAAGCGACTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATccc > 4:17669/1‑77 (MQ=255) tcatcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAc < 2:458468/150‑1 (MQ=255) tcatcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAc < 2:667345/150‑1 (MQ=255) catcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTAc > 3:137029/1‑134 (MQ=255) catcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAcc > 2:281074/1‑150 (MQ=255) tcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTAc < 1:596686/132‑1 (MQ=255) tcaGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTAc < 1:137026/132‑1 (MQ=255) gCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTGCGGCTGc > 4:201014/1‑200 (MQ=255) acaAGGCGGCTGGCGGTACACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCACAGTGGATGTCGCGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGc < 1:82153/132‑1 (MQ=255) acaAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTGCGGCTGcat < 4:1081564/200‑1 (MQ=255) caAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAc < 3:223951/141‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAc < 1:824353/132‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCACAGCTTGGTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATAc < 1:661440/132‑1 (MQ=255) gCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAAc > 3:737737/1‑141 (MQ=255) gCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTGCGGCTGCATCATATTGCCGGt > 4:168132/1‑200 (MQ=255) ttCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTAc > 4:45396/1‑112 (MQ=255) ttCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGc > 3:574903/1‑141 (MQ=255) | CAGAACTGGTTCCAGGTGAACTCATACAGAATGCCTGCGGCGATATCGAAGCGGAAGCTGTCCAGCGCTTCGCGGTACGCTTTGATGGTCTGGTTGAACTCCGCCAGAATCCAGCGGTCCGCCAGCGACAGCGTCATTTCGCCGCCGTTGAAGCCGCAATCCTGACCTTCTGTGTTCATCAGCACAAAGCGGCTGGCGTTCCACAGCTTGTTACAGAAGTTACGGTAACCTTCCAGACGCTTCATATCCCAGTTGATGTCACGACCGGTAGACGCCAGCGCCGCCAGGGTGAAGCGCAGCGCGTCAGTACCGTGCGGCTCAATACCGTTCGGGAACTGCTTCTCGGTGCGCTTACGGATTTTGTCCGCCAGCTGCGGCTGCATCATATTGCCGGTACG > NC_000913/4481700‑4482097 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |