| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2021646 = | 72 (0.700) | 3 (0.030) | 3/288 | 12.3 | 4.0% | coding (143/366 nt) | fliO | flagellar biosynthesis protein |
| ? | NC_000913 | 2021683 = | 78 (0.810) | coding (180/366 nt) | fliO | flagellar biosynthesis protein | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
CCGATATCATTACTCCGTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCTGCACCAACGGAAGAGATACCGC > NC_000913/2021455‑2021813 | ccGATATCATTACTCCGTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCg > 4:722330/1‑200 (MQ=255) atCATTACTCCGTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAAc < 4:373409/200‑1 (MQ=255) gTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCg < 4:200158/184‑1 (MQ=255) gTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATATCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGaaact > 4:221403/1‑198 (MQ=255) gccTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 4:61902/200‑1 (MQ=255) aGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCAc < 3:495659/150‑1 (MQ=255) gTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGa > 4:475153/1‑200 (MQ=255) gaATAACCCCGCTACTGTGCACTCTTCCGCGCCGGTTTCTTCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAggg < 4:335308/200‑1 (MQ=255) gaATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGt > 3:101481/1‑150 (MQ=255) gaATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAggg > 4:93926/1‑200 (MQ=255) aaCCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAAc < 3:200374/150‑1 (MQ=255) ccACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTgg > 1:392537/1‑141 (MQ=255) ccACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTgtgg < 4:575928/200‑1 (MQ=255) ccACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTgtgg < 4:402738/200‑1 (MQ=255) cTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTa > 1:399454/1‑141 (MQ=255) aCTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGcccc > 2:590349/1‑129 (MQ=255) aCTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAAc < 1:434359/141‑1 (MQ=255) cTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAt < 4:211816/200‑1 (MQ=255) gtgCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAAtt > 3:744193/1‑150 (MQ=255) gtgCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTACTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAtgt > 4:791175/1‑200 (MQ=255) cAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAgc < 3:793475/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAg < 1:48769/141‑1 (MQ=255) gcCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCGGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGc < 4:632861/200‑1 (MQ=255) cGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 3:844740/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 1:655428/141‑1 (MQ=255) gcgcCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTACACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAACATTAGCGCCatt > 2:357765/1‑130 (MQ=255) gcCACTGCTGCAGGTGGGCGGCGCACTCATCGCCATTCTTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGGCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAGATTAGCGCCAGTGc < 2:50036/132‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTCACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCt > 2:152986/1‑132 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTAc < 4:780622/200‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTAc < 4:558287/200‑1 (MQ=255) ctgctgCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCa > 2:653123/1‑132 (MQ=255) ctgctgCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGgcgcg > 1:236540/1‑141 (MQ=255) tgctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 2:432892/132‑1 (MQ=255) tgctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCAc < 2:291299/132‑1 (MQ=255) gctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACt > 2:108274/1‑132 (MQ=255) gctgcAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACt > 2:660536/1‑132 (MQ=255) gTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAgg < 1:46765/141‑1 (MQ=255) gcgcACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAtg > 3:452245/1‑150 (MQ=255) cTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTc > 1:415749/1‑141 (MQ=255) tCGCCATTATTGCCCTGATCCTGGCTGCTGCCTGGCTGGTAAGACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTgtgg < 2:157014/132‑1 (MQ=255) ccATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAACGGGTTGtggtgg > 2:117806/1‑132 (MQ=255) ccATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACtt > 4:316441/1‑200 (MQ=255) ccATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACtt > 4:608380/1‑200 (MQ=255) attattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACgg > 3:607842/1‑150 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCg > 2:3979/1‑132 (MQ=255) ttattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAg > 1:502023/1‑141 (MQ=255) tattGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTcccc < 4:796221/200‑1 (MQ=255) gCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTg > 3:95710/1‑150 (MQ=255) gCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTc > 4:600305/1‑200 (MQ=255) gCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGCCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGAtgtg > 2:439581/1‑132 (MQ=255) cccTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCt > 4:478913/1‑200 (MQ=255) gATCCTCGCTGCTGGCTGGGTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGa < 2:202152/132‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTGCCTGGCTGGAAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTg < 1:563974/141‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGc > 1:496531/1‑141 (MQ=255) tgctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCTGCACCAACGGAag < 4:772413/200‑1 (MQ=255) ctgcCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCTGCACCAACGGAagag < 4:196656/200‑1 (MQ=255) gctggTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCTGCACCAACGGAAGAGATACCGc < 4:221328/200‑1 (MQ=255) gctggTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGAGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGc < 1:234357/141‑1 (MQ=255) gTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAaatcaat > 3:840490/1‑150 (MQ=255) gggATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATct < 1:116925/141‑1 (MQ=255) ggATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGCAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCCCGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCaa > 2:498348/1‑132 (MQ=255) ggATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCaa > 2:322368/1‑132 (MQ=255) ggATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCaa > 2:485523/1‑132 (MQ=255) ggATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATaaa > 3:839793/1‑150 (MQ=255) ccccTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGAGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATa > 1:42913/1‑141 (MQ=255) ccTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAACGGGATGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATctg > 2:432262/1‑132 (MQ=255) ccTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATctg > 2:154637/1‑132 (MQ=255) ccTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATctg > 2:594658/1‑132 (MQ=255) cTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAGAATTAGCGCCAGGGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATctgc < 2:559255/132‑1 (MQ=255) cTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCtt > 3:199365/1‑150 (MQ=255) tAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACt < 1:152989/141‑1 (MQ=255) gtgaagCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTCCACTGGCCGCGCGTGCAAGGGCTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCCGCGTTACCGCCGGCCCAATCAATCCGCTGCATCAACt > 1:651000/6‑141 (MQ=255) aCGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTcc > 1:245044/1‑141 (MQ=255) | CCGATATCATTACTCCGTCTGAGCGAATGCGCCGCCTGAGCCGTTAGTGATGAATAACCACGCTACTGTGCAATCTTCCGCGCCGGTTTCTGCTGCGCCACTGCTGCAGGTGAGCGGCGCACTCATCGCCATTATTGCCCTGATCCTCGCTGCTGCCTGGCTGGTAAAACGGTTGGGATTTGCCCCTAAACGCACTGGCGTTAACGGTCTGAAAATTAGCGCCAGTGCTTCACTGGGCGCGCGTGAAAGGGTTGTGGTGGTCGATGTGGAAGATGCACGGCTGGTGCTCGGCGTTACCGCAGGTCAAATCAATCTGCTGCATAAACTTCCCCCTTCTGCACCAACGGAAGAGATACCGC > NC_000913/2021455‑2021813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |