New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3579387 | 106 (1.030) | 3 (0.030) | 3/286 | 12.2 | 3.1% | coding (259/696 nt) | yhhW | quercetinase activity in vitro |
? | NC_000913 | = 3579470 | 86 (0.900) | coding (176/696 nt) | yhhW | quercetinase activity in vitro | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CTCGCGCATCCGGCGAGAGCACCAGCTGTTTGCCCTGTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAGTTGGCAAA > NC_000913/3579195‑3579570 | ctcGCGCATCCGGCGAGAGCACCAGCTGTTTGCCCTGTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc < 4:196710/200‑1 (MQ=255) tCCGGCGAGAGCACCAGCTGTTTGCCCTGTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCttt > 4:52214/1‑200 (MQ=255) cTGTTTGCCCTGTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCt > 4:415036/1‑200 (MQ=255) gTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCAGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGATCAACa > 4:696631/1‑200 (MQ=255) ggCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAc < 4:215479/200‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGAGGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTGGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGaa < 3:211467/150‑1 (MQ=255) cTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAgg < 4:696000/200‑1 (MQ=255) gTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCtt > 3:196409/1‑150 (MQ=255) gTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTc > 4:457556/1‑200 (MQ=255) aaTAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAt < 3:624386/149‑1 (MQ=255) acggcgagTAATAACGGTTTCTTCAGGCATGAACCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGctc < 1:514410/134‑1 (MQ=255) 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ggCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTCTTGCCCATGCTg > 2:368021/1‑132 (MQ=255) ggCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc > 1:566863/1‑141 (MQ=255) ggCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGcc > 4:392219/1‑200 (MQ=255) aTGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTcc < 2:106386/132‑1 (MQ=255) aTGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTcc < 2:285999/132‑1 (MQ=255) 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aCGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATaa > 4:859271/1‑200 (MQ=255) cGAATACCCGTACCAGCACTCCTAATCTGGCACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTCATTGCCCATGCTGTCCTGACGCGCAACAGTACCTTCCATCACTTTGGCGAACATTACCATATCTTTACGCggggca > 2:227276/1‑129 (MQ=255) aaTACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATaaaag < 4:78536/200‑3 (MQ=255) aCCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGcc > 2:52230/1‑132 (MQ=255) cccGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCgg > 4:265666/1‑200 (MQ=255) cccGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCgg > 4:288079/1‑200 (MQ=255) tACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTg < 1:13218/59‑1 (MQ=255) tACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTg > 2:13217/1‑59 (MQ=255) tACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAgc > 2:578301/1‑132 (MQ=255) tACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGccctgccctg > 1:625779/1‑141 (MQ=255) aGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGTAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAAt < 4:785274/200‑1 (MQ=255) cACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAg < 4:652122/200‑1 (MQ=255) cACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAg > 4:240592/1‑200 (MQ=255) cACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAg < 4:830017/200‑1 (MQ=255) cTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATc < 1:39014/141‑1 (MQ=255) cTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATc > 1:544704/1‑141 (MQ=255) cTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATc > 1:620951/1‑141 (MQ=255) aTCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCa > 2:104074/1‑132 (MQ=255) aTCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCAcgtcg > 1:138503/1‑141 (MQ=255) aTCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAGTTGGCaaa > 4:196870/1‑200 (MQ=255) | CTCGCGCATCCGGCGAGAGCACCAGCTGTTTGCCCTGTACGGCATCGAAGCGACGCTGTTCATAACGCGGCGTAATACCGTTTTCTTCAGGCATGATCCAGATCTGATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGCGGGTGAGTGCCGAAGCCCTGCCCTGCTTCAATCACGTCGTCGTTAATCACGCGCAGCGCGGAGAAGCCCATAAAGTTCGGATCGTAATAGTTGGCAAA > NC_000913/3579195‑3579570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |