| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,440,087 | C→T | G315S (GGC→AGC) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,440,087 | 0 | C→T | 100.0% | 389.0 | 102 | G315S (GGC→AGC) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) cGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGatat < 4:103263/150‑1 (MQ=255) cGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTcc < 2:590711/200‑1 (MQ=255) aTGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTCTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGt > 3:253396/1‑132 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTAc < 3:258241/132‑1 (MQ=255) gCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTg < 4:457201/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTg < 4:50916/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTAcc < 3:91435/132‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 4:654058/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGatat < 1:203637/141‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGCACGCTGTACCAGAt < 3:420460/132‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAGTTATCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTGATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGATTAGGCGTTTTAAGGGGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGAt < 3:515666/132‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAGTTTTCCAGGAGCATGCTCAGAGAAAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGc < 4:54016/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAAc < 2:442137/200‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCAAGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGAt < 1:140799/141‑1 (MQ=255) gTTTTCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCgca > 2:455533/1‑200 (MQ=255) ttttCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAg < 3:125659/132‑1 (MQ=255) ttttCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAg < 3:374847/132‑1 (MQ=255) tttCCAGGCGCATGCTCAGGGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCtt < 1:415805/141‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTACTCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTCGGCGTTTTCAGGAGCTCAACATCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTg > 3:437339/1‑132 (MQ=255) tCCAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTgg < 3:37247/132‑1 (MQ=255) ccAGGCGCATGCTCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGc < 4:148716/150‑1 (MQ=255) gcgcATGCTCAGAGCCAGTCCACGGTCATCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGc < 3:542580/132‑1 (MQ=255) | GTCGTCTTGATGATTTCATGACGAACCAGTGAACCTGCCATATTGCGGAACATAGCCTGGCGATGGCTGCTGTTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCA > NC_000913/3439890‑3440269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |