| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1329792 | 85 (0.900) | 4 (0.040) | 4/292 | 10.2 | 4.9% | coding (461/1050 nt) | sohB | inner membrane protein, S49 peptidase family protein |
| ? | NC_000913 | = 1329859 | 73 (0.800) | coding (528/1050 nt) | sohB | inner membrane protein, S49 peptidase family protein | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
GGGCGAGGTGGCAACTGACAGTAAACCCCGCGTCTGGGTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGTTCCATTGGCGTGGTGGCGCAAATGCCCAACTTTAACCGCTTCCTGAAAAGCAAAGATATTGAT > NC_000913/1329607‑1329991 | gggCGAGGTGGCAACTGACAGTAAACCCCGCGTCTGGGTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACGCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGGGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGc < 1:122181/200‑1 (MQ=255) cAGTAAACCCCGCGTCTGGGTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATaaaa > 1:240523/1‑200 (MQ=255) aGTAAACCCCGCGTCTGGGTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGC‑GGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAAc > 1:253113/1‑200 (MQ=255) aaaGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGt < 1:427386/200‑1 (MQ=255) aaaGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGt < 1:666512/200‑1 (MQ=255) ggCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAg < 2:667617/150‑1 (MQ=255) ggATGCCCATGTAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGTCTGTACTCGCAGCCTTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTTCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTc > 3:171169/1‑132 (MQ=255) gACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGCGCATGGTTCCGGGCTGGCGGCGTCGCAACTGCAGCGTcgttgc > 2:756242/1‑145 (MQ=255) cGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCg < 4:414070/141‑1 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAAc > 3:209688/1‑132 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTc > 4:399435/1‑141 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATa > 2:568934/1‑150 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGt > 1:173039/1‑200 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGt > 1:349964/1‑200 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGt > 1:362820/1‑200 (MQ=255) cccATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTACGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGt > 1:789821/1‑200 (MQ=255) 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gtTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCATCGTTTGCTATTGTGGGTTCCATTTGCGTGGTGGTGCAAATGCCCAACTTTAACCGCTTCCTGAAAAGc > 1:614304/1‑200 (MQ=255) gtTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTa > 4:389087/1‑141 (MQ=255) gtTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGtt > 2:743844/1‑150 (MQ=255) ttACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTAt < 4:563136/141‑1 (MQ=255) ttACGGGCTGGCGGCTTCGCAACGGCGGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAGCTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAGTTGTTTCCGCACCGTTTGCTAt < 4:171175/141‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGTTCCAt > 2:778232/1‑150 (MQ=255) ggCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTAAACTGTTACGGTAGACAAAGTCTCTGCCAGCGGCGGTTACATGCTGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCTTTTGCTATTGTGGGTTCCATTg > 2:235966/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGt < 4:429969/141‑1 (MQ=255) ggcggcTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTAt < 3:373641/132‑1 (MQ=255) ggcggcTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTAt < 3:291529/132‑1 (MQ=255) cggcTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGTTCCATTGGCGTGGTGGCGCAAATGCCCAACTTTAACCGCTTCCTGAAAAGCAAAGATATTGat < 1:811566/200‑1 (MQ=255) cggcTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGTTCCATTGGCGTGGTGGCGCAAATGCCCAACTTTAACCGCTTCCTGAAAAGCAAAGATATTGat < 1:799142/200‑1 (MQ=255) | GGGCGAGGTGGCAACTGACAGTAAACCCCGCGTCTGGGTGCTGGATTTTAAAGGCAGCATGGACGCCCATGAAGTGAACTCGCTACGTGAAGAGATAACGGCTGTACTCGCAGCATTCAAACCGCAGGATCAGGTTGTGCTCCGTCTGGAAAGCCCTGGTGGCATGGTGCATGGTTACGGGCTGGCGGCTTCGCAACTGCAGCGTCTGCGCGATAAAAACATTCCTTTAACTGTTACGGTAGACAAAGTCGCTGCCAGCGGCGGTTACATGATGGCCTGTGTGGCGGACAAAATTGTTTCCGCACCGTTTGCTATTGTGGGTTCCATTGGCGTGGTGGCGCAAATGCCCAACTTTAACCGCTTCCTGAAAAGCAAAGATATTGAT > NC_000913/1329607‑1329991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |