Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,508,894 | 0 | G→A | 10.5% | 11.6 ‑4.9 0.0 | 96 | A307V (GCA→GTA) | yhfW | phosphopentomutase‑related metalloenzyme superfamily protein |
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/1): ref base (38/47): total (48/48) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.63e-03 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
GTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCAGCACGGTTGGCACGC > NC_000913/3508696‑3509083 | gtgCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGc > 1:528378/1‑200 (MQ=255) gAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTg > 1:551323/1‑200 (MQ=255) gCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGa > 1:12426/1‑200 (MQ=255) gCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGa > 1:696489/1‑200 (MQ=255) ttGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGttt < 1:267986/200‑1 (MQ=255) ggCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAAt > 1:119770/1‑200 (MQ=255) cTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGtctt > 2:346689/1‑150 (MQ=255) gcgGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGc < 2:83412/150‑1 (MQ=255) ggTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGTCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATg > 2:266026/1‑150 (MQ=255) ggTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGtc > 4:401110/1‑141 (MQ=255) ggTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGAt > 1:486462/1‑200 (MQ=255) tATGGTGACTGAGACCAAGGGGCGGATCGTGGCCATGAGCCACCGTCACAACCAGGCAAACATCTGGCGGCATCACCGCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGAAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGAAAGAc < 2:343708/150‑1 (MQ=255) tggtggCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAATCGGATTCCTGAATGTTGGTTACACTAAACGACGTCGTCTGGgt > 1:737277/1‑200 (MQ=255) tggtggCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATCACGTGTGCCGTCTTCTGCATGACCACCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGgt > 1:736995/1‑200 (MQ=255) tggtggCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTGCTGCATGACCa > 2:197384/1‑150 (MQ=255) ggtggCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGgtg > 1:415901/1‑200 (MQ=255) gCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATCTCGTATGACGTCTTCTGCATGACAAAAAAAATCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTaa > 1:813762/1‑200 (MQ=255) gCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTaa > 1:573707/1‑200 (MQ=255) tgtgACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 1:346718/200‑1 (MQ=255) tgtgACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 1:811568/200‑1 (MQ=255) gtgACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAtt > 1:595722/1‑200 (MQ=255) gACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAATCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGCCCACCGAGGTCgg > 2:623502/1‑150 (MQ=255) cAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGACATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGATAGGTTACAGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTACATGACCAGCGAGGTCGGttt < 2:610090/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGa > 3:232325/1‑132 (MQ=255) aTGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTATGACGTCTTCTGCATGAAAAACAAAGTAGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGGGTTAAATTCGTGGAg > 1:801146/1‑200 (MQ=255) tGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGAc > 3:275894/1‑132 (MQ=255) tGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGAc < 3:401743/132‑1 (MQ=255) ggTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGTGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTc > 4:557433/1‑141 (MQ=255) gTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGa < 2:536206/150‑1 (MQ=255) ggATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCg < 3:23714/132‑1 (MQ=255) gATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATATCGTATGACGTCTTCTGCATGACCAGCAAGGTCGGttt > 4:240298/1‑141 (MQ=255) tCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGGGCGACGGTTTATGCATGACAAGCGTgg > 3:284204/1‑132 (MQ=255) gcGTGACCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATg < 4:572969/140‑1 (MQ=255) cGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATc < 1:595441/200‑1 (MQ=255) gTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAATCGGTTTACTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATcc > 1:818870/1‑200 (MQ=255) tGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTCCCTGAATGTTGGTGCAAATa > 2:584626/1‑150 (MQ=255) tCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGATGCAGCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGa < 3:566358/132‑1 (MQ=255) ccGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGc < 4:245315/141‑1 (MQ=255) gCCATCACGACCAGGGAATCATCTGGCTGCATCGCCTGAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTGCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCt < 1:181311/200‑1 (MQ=255) 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tcataTGGCTGCATCGCCGCAACAAGCCGGGCAAGGTAACGGTCAACGCCCTGCAAACGTTCGGCATAACGGGAGGCGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCGGAATGTTGGTGCTAATTAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 2:119213/150‑1 (MQ=255) catcTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTCCGTCGTCTTCTGCATGACCAGAGGGGTTGGTTTCCAGAATGTTGGCGCAAAGAAACGCCGTCGGTTggg > 4:438125/1‑141 (MQ=255) tGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTGTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGtt > 2:712503/1‑150 (MQ=255) ggCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCAc > 1:72639/1‑200 (MQ=255) cTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTaaa < 4:494800/141‑1 (MQ=255) tGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 4:275905/141‑1 (MQ=255) gCATCGCCTCAACGAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAATCGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAtt < 4:447710/141‑1 (MQ=255) atggagtCAACAGGCCGGGGAAGGTTACGGGCAACGACCTGCGAAGGTTCGGCGTAACGGGCGACGTCTTCTGGATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGgtg < 3:613967/126‑1 (MQ=255) cGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAg < 1:142328/200‑1 (MQ=255) gCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATATCGTACGCCGTCTTCTGCATGACCAACAAAGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGTGGGTGATATCCATAATCCGCTGTCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAgg > 1:383203/1‑200 (MQ=255) gCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAgg > 1:660550/1‑200 (MQ=255) ccgcaacaaGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGGGCTGCAAACGTTCGGCATAGCGGGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGGCGTTTTCCTGAATGTTTGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTAAGTTTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGa < 1:440301/197‑1 (MQ=255) ccTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGa < 1:216249/200‑1 (MQ=255) ccTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGa < 1:545660/200‑1 (MQ=255) ccTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTACGCCGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGa > 1:307179/1‑200 (MQ=255) ccTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTGCGGCATAACGTGCGACGTCGTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGatat < 2:372934/150‑1 (MQ=255) cTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATc < 2:528322/150‑1 (MQ=255) tCAACAGGCCGGGCAAGGATACGGTCAACGACCTGCAAACGGTCGGCATGACGTGCGTAGTATACTGCAAGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATcc < 2:337349/150‑1 (MQ=255) tCAACACGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 3:69435/132‑1 (MQ=255) tCAACAAGCCGAGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAGCGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGATGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAt < 3:502249/132‑1 (MQ=255) caacaaGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAGCGTGCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCGGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAAtt < 3:195990/132‑1 (MQ=255) acgaaGGCGGGCAAGCTTGCGGTAAACGACCTGCAGACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGTATGTTGGTGCAAATGAGCGCCGACGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCAt < 2:281605/147‑1 (MQ=255) aGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGata > 4:39057/1‑141 (MQ=255) gCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATcc < 2:509013/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGatat > 1:15452/1‑200 (MQ=255) aGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATc < 4:243965/141‑1 (MQ=255) ggTTACGGTCAACGACCTGCAACCGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCATGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATcc < 4:440877/141‑1 (MQ=255) ggTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCTACTAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGatat > 3:310723/1‑132 (MQ=255) ttACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCAc < 1:266049/200‑1 (MQ=255) aCGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCAt < 3:115621/132‑1 (MQ=255) aCGGGCAACGACATGCAAACGTTCGGGAGAACGTGCGACGACGACAGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAAGGGTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCAt < 3:169369/132‑1 (MQ=255) gTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAg > 2:661198/1‑150 (MQ=255) gTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGCTTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCTACCTTAc > 1:105158/1‑200 (MQ=255) gTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGa < 1:661264/175‑1 (MQ=255) gTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCCTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGCGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCt > 4:201409/1‑141 (MQ=255) tCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATc < 3:374538/132‑1 (MQ=255) cGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACccacc < 1:578579/200‑1 (MQ=255) ccTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATccacca > 4:421520/1‑141 (MQ=255) ccTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGcc < 2:595662/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCGGc < 1:206285/200‑1 (MQ=255) gCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGAt < 4:399921/141‑1 (MQ=255) gTTCGGCATAACGTGCGACGTCGTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGcc < 4:323899/141‑1 (MQ=255) tgcgggagaaCGGGCGACATCTTCTGCAGGACCCGCGAAGTCGGTTTCCTGGATGTTGGTGCAAATAGACGCCGTGGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAg < 3:85218/124‑1 (MQ=255) gtCGGAATAACGTAGGACGTCTTCTGCATGACCAGCGGTGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAGACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATGCATAATCCGGTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGcc < 2:690302/149‑1 (MQ=255) ggCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCAGCACGGTTGGCACGc > 1:161306/1‑200 (MQ=255) ggCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATATTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGATGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGAtt > 3:462118/1‑132 (MQ=255) gCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTc > 4:460145/1‑141 (MQ=255) aTAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAgg < 2:160365/150‑1 (MQ=255) gCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGAttgttg < 2:573650/150‑1 (MQ=255) | GTGCGCACACCGAGCTGCGTAGCGATCATCCCTTGCTGATAAACCAGCACTGGCACCACTTCGCGGGTATGGTGGCTGTGACCAATGGTCGGATCGTTGCCGTGATCCGCCATCACGACCAGGCAATCATCTGGCTGCATCGCCTCAACAAGCCGGGCAAGGTTACGGTCAACGACCTGCAAACGTTCGGCATAACGTGCGACGTCTTCTGCATGACCAGCGAGGTCGGTTTCCTGAATGTTGGTGCAAATAAACGCCGTCGGATGGGTGTTAAATTCGTTGAGGGTGATATCCATAATCCGCTGGCTATCCACCAGATTTTGCCAGCTCACGCCATAAGGATTGTTGACGATATCTGCCACCTTACCCACCAGCACGGTTGGCACGC > NC_000913/3508696‑3509083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |