| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP016816 | 202,462 | 0 | C | A | 34.2% | 679.4 / 98.7 | 485 | intergenic (+240/‑435) | JCVSYN2_00840/JCVSYN2_00845 | hypothetical protein/lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (202/116); new base A (28/137); total (230/255) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-23 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 520 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |