| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 87902 | 592 (0.590) | 228 (0.210) +TTT |
64/216 | 13.9 | 25.7% | intergenic (+29/‑831) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 |
| ? | CP016816 | 87903 = | 678 (0.600) | intergenic (+30/‑830) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/87776‑87902‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTA > CP016816/87903‑88029 ||| TGTGTAACAATAGTGGTATTTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCAGGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGATAAGCTGATTTAAAAGGAATATTAAGCAATACAT > 1:1310959/1‑128TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGTATAATTAAACAATCCAT > 2:1591542/1‑128TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAT > 2:1938411/1‑128 GTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTT > 2:576165/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATATTAAAATTTATATTCATGGAAAGTCAAATTAATATTTAGATTTTGAATATATTATTTAAATGTATTATTAAACAATACATTATT > 1:562249/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 2:92320/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 1:677940/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 1:1770010/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 2:1274079/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGATGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTT > 1:2100747/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGATGATTTAAATGGATTATTAAAAAATCCATATTT > 2:1453637/1‑128 TAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATAATCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTAGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCAATTata > 1:1545555/1‑125 AACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATTTATTATTAAACAATCAATTTTTT > 1:73162/1‑128 AACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTT > 1:1393556/1‑128 AACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTT > 1:846123/1‑128 ACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTT > 2:1375526/1‑128 cgAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTCATTATAAAATTGAAATTCAGGAAAAGTCAAATGATTATTAAGATATTGAATAGCTCATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 2:186136/3‑128 CAAAAGTGGTTATTTAGTTTCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTTAAAAGCTTAATTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT < 1:1189006/128‑1 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 2:312801/1‑128 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 2:101855/1‑128 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 1:1898915/1‑128 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 1:772920/1‑128 CAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTT > 1:2019312/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTT > 2:1142964/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGATGATTTAAATGTATAATTAAAGAATCCATTTTATTTT > 2:1213886/1‑128 AAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAACTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGCTTATTAAACAATCCATTTTTTTTT < 1:215461/128‑1 AAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTT > 1:1083159/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTT > 1:167731/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTATT > 1:497223/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCAATTTTTTTTTTTT > 1:2424120/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATACATTTTTATTTTTT > 1:924318/1‑128 AGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGATGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTATTTTTTATT > 1:403032/1‑128 GTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTT > 2:874805/1‑128 GTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTT > 1:1821735/1‑128 GTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTATTTTTTATT > 1:706631/1‑128 TGGTTATTGTGTTTCAATTAAAGTTTAAATTGATAATAAAATTTATATTCATGGAAATTCAAATGAATATTTATATTTTGAATATCTGATTTAAATTGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTT < 2:278890/128‑1 GGTTATTGAGTTGTAAGTAAATTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTT < 2:2392258/128‑1 GGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATCGAAAGTCAAATGAATATTTAGAATATGAATAGCTGATTTAAATGGACTGTTTAATAATCCATTTaaatcagctatt < 1:348270/128‑13 GTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGAGTATTAAACAAGGCAGTATTTTTTTTTTata > 2:2211177/1‑125 TTATTTAGTTGCAAGTAAATTTCAAATTGATAATAAAATTGATTTTAATGGAAAGTCAAATTAATATTTAGATTTTTAATAGCTTATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTa < 2:1362590/128‑2 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTa > 2:1390516/1‑127 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTa > 1:1924873/1‑127 TTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTATGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAAT‑CATTTTTTTTTTTTTTTTaa > 1:1719671/1‑126 TATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTT‑Ta > 2:2305087/1‑127 TATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGAATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaa > 1:1598970/1‑126 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGTATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTataattaata > 2:851622/1‑118 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaat > 2:71104/1‑125 ATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaat > 1:1999580/1‑125 TTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTatta > 2:1532627/1‑124 TTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaata > 1:144670/1‑124 TTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaata > 2:1304019/1‑124 TGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaataa > 1:689320/1‑123 TGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaataa > 2:2330523/1‑123 TGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaataa > 1:2339253/1‑123 TGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaaata > 1:1256674/1‑123 TGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaaaaa > 1:1503180/1‑123 GAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGGATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTTaataaa > 1:1276681/1‑122 GAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCAATTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATA > 1:1987689/1‑128 GAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATACATTTTTTTTTTTTTTTTATTAAT > 2:357937/1‑128 GAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTCATTTAAATGGATTATTAAAGAATCAATTTTTTTTTTTTTTTTattaaa > 2:2246814/1‑122 AGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTATTTTTTTTTTTTaaataaaa > 2:1190596/1‑120 AAAGTTGAAATTGATAATAAAATTGATTTTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGAGTATTAAACAATACA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACt < 1:2173810/128‑2 GTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGTATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAtaataaaaaaa > 1:911872/1‑117 CAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATAATCAAATAAtta > 2:952120/1‑125 ATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACATTCCA‑TATTTTTTTTTTTTT‑TTATTAA‑AAGGAATCACATAAGTtatg > 2:1670563/1‑124 ATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTA‑ATAAAAATAAAGACTTAAATTAGTctatta > 2:1084028/1‑122 ATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTT‑T‑‑ATAA‑AAATACACAAATAATTTTGTAAATTTCTATTATTTAA > 2:1217990/1‑128 ATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATAATAAAATAAGTGAATAAATTGAAATTATTTAATTATT > 1:2285937/1‑128 GGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATACTAAAATAATTGATACAATTGATATTATTTAATTATTAA > 1:753597/1‑128 AAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAAACTAACATATGTTATACAATTACGATTATTTATATATTAATT > 2:731408/1‑128 ttatattAATATTTAGATTTTGAATTTATTTTTTAAATGGATTATTAAAAAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTC < 2:642080/121‑1 AAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATAATAAAATATGTTAATAAATTTAGATTATTTAATTATTAATTATTATT > 1:332753/1‑128 AATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAATTAATTCAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTATTT > 1:2307814/1‑128 attAATTTTTATATTTTTAATATATTATTTAAATTGATTATTAAAAAAT‑AAATTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTG < 1:1666013/125‑1 TGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATACTCAAATAAGTTAGAAAATTGCGTTTATTTAATTATTAATTATTATTTGA > 2:2050350/1‑128 tAATATTTTTATTTTTAATTGATGATTTAAATGTTTTATTAAAAAAT‑CA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATG < 1:520055/127‑1 TGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACGCACATAAGTGATTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTATTTGATGAACTATTTACCTT > 1:2232403/1‑128 AGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGAATCACATAAGTGAGTAAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTAACCTTTATTT > 1:1906981/1‑128 TTTAAATTTATTATTTAAAAAT‑TAATTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAGTTACCTaaagaaaggtaa < 1:1632265/128‑13 TTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCAAATAATTTATTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTATTTGATGAACTATTTACATTTCTTTAGGTAAa > 1:631868/1‑127 tAATTGATTATTTAACAATCCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTA < 1:1892964/127‑1 ttttTTATTAAAAAATTCA‑TTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATT < 2:1256674/124‑1 attataaaattATTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTAC < 1:1325610/117‑1 ttttttattttaTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAT‑AAAGAATTAGATAAGTGAGTAAATTTCGATTATTTTATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACC < 2:1737526/116‑1 aatcaattaaTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑TAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTA < 2:2107018/118‑1 taataatccaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTTTTTATTTATTTATTATTATTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTTGGTAACTATTTAATTACCTta > 1:2448214/11‑126 aaactatacaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATTAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAA < 2:513101/118‑1 aaaaattcaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAT < 1:1005494/119‑1 tattttTTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAATATTCTCATATGTGAGTAAATTGATATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATA < 2:388418/122‑1 aaaattcaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATA < 2:296763/120‑1 taatccaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATTAACTATTTACATTTCTTTAGATAAATAATAAATTACCTAATAT > 1:2037868/8‑128 aaaaacaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATAT < 1:286482/121‑1 tataaaTTTTTTTGTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGAATCATTTAAGTGAGTCTATTTCGATTATTTAATTAATAATTATTCTTTTATTAACTATTAACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATT < 1:487133/122‑1 tttTTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑TAAGACTATAATAAGTGAGTAAATTGAGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTA < 2:1483209/125‑1 tccaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTTTTAATTATTCTTTGATGAAATATTTACCTTTCTTTAGGTAAATAATTAATTACATAATATTAT > 1:978744/5‑128 ccaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTAAATTGCGATTTTTTTATTATTAATTATTCTTTGATGAAATATTTACATTTATTTAGGTAACTATTTAATTACATAATATTATT > 2:1915654/4‑128 caTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTATTTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTT < 2:2266887/126‑1 cTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑ATAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTT < 2:456132/127‑1 aaTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTT < 1:880252/126‑1 TTTTTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGAATCTCATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTT < 1:472538/128‑1 ||| TGTGTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/87776‑87902‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTT‑TTAATAA‑AAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTA > CP016816/87903‑88029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |