| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 34944 | 765 (0.430) | 703 (0.400) +TAA |
96/246 | 33.3 | 48.5% | intergenic (+48/+118) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH |
| ? | CP016816 | 34945 = | 765 (0.430) | intergenic (+49/+117) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 1323 total aligned reads displayed.
TCTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCT > CP016816/34817‑35071 | tCTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATTCTGAACCAAGTACAATTCTAAGTTAATTTGATGAATAATAAAATATTAAACAAAATAAATTGTTATTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑tt > 1:583166/1‑128 (MQ=255) cTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑g > 2:2998767/1‑128 (MQ=255) cTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACAAAATACAATATGTTTGG‑TATTATTA‑ATA‑A‑‑CT‑A‑ttt > 1:1787887/1‑127 (MQ=255) tACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGATGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGA‑TTTTTTTA‑TTA‑A‑‑CT‑A‑tttata > 1:1740915/1‑124 (MQ=255) tACTTATTATTGAGTTTCAACAAAAAGAGTAACAAATGTTTAACAAAGTTAAATGGTATGGGATGTTGTTTAATAATAAAATATAAAACCAAAAACTTTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑aaa < 1:1458362/128‑1 (MQ=255) tcttTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTTAAGTTAATGAATAATAAAATATTAAACCAAATAAATTAATTTTGT‑TATATTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TT‑‑‑a‑‑‑‑aaaaaaa > 2:2592967/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATTCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGC‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aa > 2:3241444/1‑128 (MQ=255) aTGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaa > 1:3618092/1‑128 (MQ=255) aGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATTAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTAGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑a‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑a > 1:2135190/1‑128 (MQ=255) aGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑a > 1:1048875/1‑128 (MQ=255) aGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACAAAATACATTGTGTTTGT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑a > 1:2360550/1‑128 (MQ=255) gTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAATTGAAGTTGATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATTGTTTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑aa > 2:869529/1‑127 (MQ=255) tttAAAAAAAAACAGTAATAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTTATTAATAAAAAAACATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑aat < 1:3882715/128‑3 (MQ=255) taaaaaaaaaGATTAAGAAATTTTGAAAAAAGTAAAATGATAATTTAAGTTTATTAATAAAAAAATATTAAACAAAAAAAATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑aaata < 1:225336/123‑5 (MQ=255) caacaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTCG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑a‑a‑aaat > 2:932518/1‑126 (MQ=255) aaaaaGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑a‑a‑aa‑a‑ata‑‑aa > 1:705426/1‑127 (MQ=255) aaaaTATTAATAAATGCTTAACCAAGTACAATGCTAATTTAAGTTTATTAATAATAAAAGATAAAACAAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑Att < 1:3059206/128‑1 (MQ=255) aaaaGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTTT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑AT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑a‑a‑aa‑t‑aaa‑‑aaa > 2:1848476/1‑126 (MQ=255) aaaaGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTTTG‑TTATTTAA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑aaaaaaa‑aaaaaa‑a‑‑a‑a‑aaataaaaa > 1:2459113/1‑121 (MQ=255) aattttaataaATGATTAAACAATTAAAATGTTAATTTAAGTTTTTTAATAATAAATTATTAAACCAAATAATTTGTTTTTGG‑TTTTTTTT‑TTT‑A‑‑AT‑ATTT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑Attt < 2:2073634/123‑1 (MQ=255) atagtattaaaTGCTGAACCAATTACAATTCTAATTGAATTTTATTAATAATAAAAGATTAAACCAAATAAATTTTGTTTTG‑TTTTTTTT‑TTT‑A‑‑AT‑ATTT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTg < 1:2722971/120‑1 (MQ=255) gagTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATAAATCCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑a‑‑a‑‑‑aa‑t‑aaa‑‑ataatatg > 2:2430960/1‑122 (MQ=255) agTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTTG‑ATATTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑a‑t‑aa‑t‑ata‑‑aatata > 2:235624/1‑123 (MQ=255) gTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑a‑‑a‑‑‑aa‑a‑ata‑‑atataatttg > 1:3348223/1‑120 (MQ=255) gTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑a‑a‑aa‑t‑aataaaaattaa > 2:265348/1‑117 (MQ=255) gTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTTGG‑TTTTTTTA‑TAT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTgaa > 1:1531826/1‑126 (MQ=255) aaaaaTTCTTAACCATTTAAAATGAAAAGTTAATTTTATTAAAAAAAAAAAAATAAACCAAATAAAATGGGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AA‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATAc < 1:2089079/126‑1 (MQ=255) taaaTGCTTAACAAATTACAATGATAATTTAAGTTGATTAATAATAAAATATTAAACAAAAAACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACtat < 1:3406730/127‑1 (MQ=255) gAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑ATT‑AA‑T‑AAA‑‑Atttaataaata > 2:3673505/1‑120 (MQ=255) cttccgttttaaTGTTAATTTAAGTTTATTAATAAAAAAATATAAAAACAAATAAATTTTTTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAAt < 1:618247/118‑1 (MQ=255) aaCAAAGTAAAATGCTAATTTATTTTTATTAAAAAAAAAATATTAAAACAAATAAATTGTTTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAAt < 1:874348/128‑1 (MQ=255) gTACAATGCTAAGTGAATTTTATTAAAAATAAAATATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AA‑ATTT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGttttt < 1:3815983/128‑1 (MQ=255) tACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑ATA‑‑AATTAAAAACTATAAAAAAATtttttta > 2:1138363/1‑127 (MQ=255) aaaaTGATAATTTAATTTTATTAATAAAAAAATATTAAAACAAATAAATTTTTTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AA‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTc < 1:2609268/126‑1 (MQ=255) cAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAAA‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑AAA‑‑ATATAAATACTAAAAAAAAtttttttta > 2:329037/1‑127 (MQ=255) aaagCTAAGAGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTCATTGG‑TTTTTAAA‑TTT‑A‑‑ATAA‑TT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAACA‑‑A‑A‑AA‑A‑AAA‑‑ATAAGAAAACTATAAAAAAttttaaatcaa > 2:3887524/4‑119 (MQ=255) aGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑A‑ATA‑‑ATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTa > 1:3776740/1‑128 (MQ=255) aGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCAAAATATAAAAAATTGATTTAAAAATAATTa > 1:1270410/1‑128 (MQ=255) gTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGAATAATATAAAAAATTCTTTTTCAAATAAGTAtt > 2:3846615/1‑128 (MQ=255) ttattttttttaataatAAATTATTAAAATAATTAAATTTTTTTTGGTTTTTTTTT‑TTT‑A‑‑TT‑T‑TTAA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATTCTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTAt < 2:2516324/117‑1 (MQ=255) tGAAGTTGATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATTTATATTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTAACAACTAAAAAAAAATTATATTAAAATAATTaaac > 2:3484039/1‑125 (MQ=255) aaGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑A‑AAA‑‑ATTTGAAAAATTAAAAAAATTTTTTTTAAAATaaattataa > 1:465387/1‑121 (MQ=255) ttattattaataaAAAATTAAACAAAATAAATTTTTTTTGT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAg < 1:1973763/121‑1 (MQ=255) tgtttaataaaAAAATTTTAAACCAAAAAAATTTTGTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑T‑‑AT‑A‑TTTAAA‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGa < 2:758823/123‑1 (MQ=255) tcaataatATATGTTTATACAAAATAATTTTGGTTGGG‑TTTTTTTT‑TTT‑A‑‑TT‑T‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑aa < 2:2232537/126‑1 (MQ=255) taaaaaaaaaaaaaTTAAACAAAAAAAATTTTTTTTTT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑aa < 1:1925411/120‑1 (MQ=255) ataataAAATCTTTAAACAATTAAATTTTTTGTTT‑TTTTTTTA‑TTT‑AT‑AT‑T‑TA‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAAttt < 2:611424/128‑1 (MQ=255) taatatAATTTTAAAAAAAATAAATTTTGTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑T‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAAttt < 1:2794104/128‑1 (MQ=255) aataaAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑ATA‑‑AATTTCATAAAAAAAAAAATTATTTATAAAATAAATATAAAAGAAT‑AAAATTa > 1:1213804/1‑128 (MQ=255) ataaAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCATACTATAAAAAATTTTTTTTCAAATAATTATACATGAGT‑AAATTTaaa > 2:1665023/1‑128 (MQ=255) taaAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTTTTTTTCAAATAATTATACAGCttt‑aaatttaaa > 2:3419697/1‑128 (MQ=255) ttttAAACAAATTTAATTTTGTTTTT‑TTTTTTTT‑TTT‑T‑‑AT‑T‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCaa < 2:1274067/126‑1 (MQ=255) gATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑TTA‑‑ATTTGAATTCTATAAAAAATTGTTTTACAAATAAGTTTACATTATT‑AAATTTAAAAAAca > 1:3576723/1‑127 (MQ=255) gATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGAATTAAGTATT‑AAATTTAAAAAAca > 2:310763/1‑127 (MQ=255) aaaaaaaCCAAACACAATGTATTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑A‑ATA‑‑ATTTTAAAAAAATAAAAAATTTTTTTAAAAAAAATTATTAAGAATT‑AAATTTaaaaaaac > 2:1744128/5‑126 (MQ=255) atttaaaaaaaTATATTTTTTTTTT‑TTTTTTTA‑TTTAA‑‑TT‑T‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAATA‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCa < 1:1686232/120‑1 (MQ=255) aTTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑TAAAA‑‑ATTTACATACTATAAAAAATTGTTTTTAAAAAATTTATTAAGAATT‑AAATTAAAAAAACCa > 2:3187862/1‑128 (MQ=255) aTTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑‑AAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AATTTTAAAAAACAAaga > 1:3306592/1‑128 (MQ=255) ttAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAAA‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAAGTATT‑AAATTTAAAAAAcaa > 1:2036674/1‑126 (MQ=255) ttAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTAAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCaa > 1:3218056/1‑128 (MQ=255) ttAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTAAAATAAGTATTCAGGATT‑AAATTTAAAAAACCAaga > 1:1138366/1‑128 (MQ=255) ttAAAAAAAATAAATTTGTTTTGT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑T‑TTTAAA‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCa < 1:3536786/128‑1 (MQ=255) taaaaaaaaaTATATTGTTTTTTT‑TTTTTTTATTTT‑A‑‑TT‑T‑TTA‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCaa < 1:81821/121‑1 (MQ=255) aaaCCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑GA‑T‑ATA‑‑ATTTGAATAATTTAAAAAATTTTTTTTAAAATAAGTATTAAGTATT‑AAATTTAAAAAACAAagt > 1:3720265/1‑127 (MQ=255) aaCCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTCAAATAAGTATAAATTAGT‑AAATTTAAAAAACaaatat > 1:1324607/1‑125 (MQ=255) aaCCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AATT‑ATATTATTTGGAAAAATTAAAAAATTTTTTTTACAATAATTTTTAAAGAGT‑ATATTTAAAAAACaaata > 1:3018849/1‑126 (MQ=255) aaaataaCATTTTGTTTGT‑TTTTTTTT‑TTT‑AATTT‑T‑TT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAttt < 2:3056551/122‑1 (MQ=255) aaaaaTACTTTTTGTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑T‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGtt < 2:2147850/126‑1 (MQ=255) taatttatttGTGTTTTG‑TTTTTTTT‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑AATA‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTta < 2:1020248/120‑1 (MQ=255) ataaaaattttttttGT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑TA‑T‑TT‑‑‑AAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTtat < 2:1943331/116‑1 (MQ=255) aaataaatTTTTTTTTT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGATTtat < 1:950715/128‑1 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAAA‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑AAA‑‑ATTTGAATAAAAAAAAAAATTTTTTTAAAAAAAATTATTAATTATA‑AAATTTaaaaaaaaaaaattaa > 2:1346819/1‑118 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AT‑T‑ATA‑‑ATTTGAAAACTAAAAAATATT‑TTTTTAAAAAAAATAATAAATAATAAAATTAAAAAAACCAAAAGTtat > 1:1628848/1‑128 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑TTTTGCATAATATAAAAAATTTTATTTAAAATAATTATACATAATT‑AAATTTAAAAAAACAATATTtat > 1:763256/1‑128 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑A‑AAA‑‑ATTTGAAAAAAATAAAAAATTTTTTTAAAAATAAAAATTAATTAAA‑AAATTAaaaaaaaaaaaatataa > 2:2801432/1‑117 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑TAAA‑T‑TTA‑‑TTTTGAAAAAT‑TAAAAAAATTTTTTTAAAAAAATTATTAAAGAGT‑AAATTTTAAAAACAAAAATTtata > 1:2962765/1‑128 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGG‑‑TTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑AAA‑‑ATTTGCATAATATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTAAGGATT‑AAATTTAAAAAACAATTATTTATaa > 1:2311590/1‑128 (MQ=255) aaTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑A‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTAAAAAATGTATACAGTAGA‑AAAATAAAAAAACCaactttaata > 2:2028864/1‑120 (MQ=255) aTACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCATAATATAAAAAATTTTTTTAAAAATAATTATTCAGGAGA‑AAATTTAAAAAACCAACATTTAaaaa > 2:3750009/1‑128 (MQ=255) aTAAATTTTTTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑T‑TTTTAA‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCATGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTtata < 1:3478911/128‑1 (MQ=255) tACATTTTGTTTGG‑TTTTTTTA‑ATT‑A‑‑AA‑ATTT‑‑‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGATTTATaact < 2:335610/128‑3 (MQ=255) tACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCATAATATAAAAAATTGTTTTTCAAAAAATTATTAAGGAGT‑AAATTTAAAAAACAAATAGTTATaatt > 2:819247/1‑126 (MQ=255) caCAATGTATTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑G‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATAATAATAAAAATTTTTTTTAAAATAAATATAAAGTAGT‑ATAATAAAAAAACCAAGAATAATaaa > 1:2666297/2‑128 (MQ=255) aaaaTTGTTTTTTT‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CA‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGATTTATaac < 1:532231/125‑2 (MQ=255) aaaTTTTGTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAAt < 1:1580909/126‑1 (MQ=255) aCAATGTATTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑AAA‑‑ATTTAAAAAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATAATAAAATATT‑AAATTTAAAAAAAAAATATTTAAAAAt > 1:1374733/1‑128 (MQ=255) aCAATGTATTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTAAATAAATAAAAAATTTTTTTATAAAAAATATTTTAATTTT‑AAAATTAAAAAAACAATAGTTATaaaaat > 1:1868847/1‑125 (MQ=255) cATTGTGTTTTG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTAAA‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAAt < 2:2892236/128‑1 (MQ=255) cATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAAGGAGT‑AAATTTAAAAAACAAATAGTTTAAAAta > 1:3103161/1‑127 (MQ=255) aatttttttttG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑AT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATc < 1:3674021/121‑1 (MQ=255) aTTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATAATAAAAAAATTTGTTTTTCAAAAAAGTATTCAGAATT‑AAATTAAAAAAACCAAAAGTTATAAATCt > 1:2414688/1‑128 (MQ=255) tgtgTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAATTATTCAGTAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTAATaaagattg > 1:2897864/1‑123 (MQ=255) tgtaTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTTCATACTATAAAAAATTTTTTTTCAAATAATTATAAATAAGT‑AAATTAAAAAAACAAATATTTATTAATAttt > 1:2521567/1‑127 (MQ=255) gtatttGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAA‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGAATAATATAAAAATTTTTTTTTAAAATATTTATTAAGATAT‑TAATTTAAAAAAAAAAATTTTATAAATCtttg > 1:1001909/4‑126 (MQ=255) tttgtgttttttA‑TTT‑T‑‑AT‑A‑TT‑‑‑T‑‑‑‑AAAAAAATAAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAATAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGtttt < 2:3547678/122‑1 (MQ=255) tttg‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑TT‑A‑TTTA‑A‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGtttt < 2:1458817/125‑1 (MQ=255) tGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GA‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑A‑AA‑T‑AAA‑‑ATTTGCATAATAAAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAAGTATT‑AAATTTAAAAAACAAAAATTAAAAAATAtttttttttt > 2:159594/1‑128 (MQ=255) tGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAATTATTCAGTAGT‑AAATTTAAAAAACAAAGATTTATAAATCTTTGttttttt > 2:452831/1‑127 (MQ=255) gg‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑GAAAAAAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑A‑ATA‑‑ATTTGCATAATAAAAAAAATTTTTTTTAAAATAATAATTAAGTATT‑AAATTTAAAAAACAAATATTTATAAATATTGTtttt > 1:3175351/1‑128 (MQ=255) t‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCt < 2:1191620/128‑1 (MQ=255) | TCTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGG‑TTTTTTTA‑TTT‑A‑‑CT‑A‑TT‑‑‑G‑‑‑‑AAAAAAA‑AAAAAA‑A‑‑A‑T‑AA‑T‑ATA‑‑ATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGT‑AAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCT > CP016816/34817‑35071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |