| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 34945 | 554 (0.350) | 779 (0.450) +AAA |
138/216 | 15.1 | 56.3% | intergenic (+49/+117) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH |
| ? | CP016816 | 34946 = | 608 (0.340) | intergenic (+50/+116) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 1467 total aligned reads displayed.
TTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTTT > CP016816/34819‑35073 | ttACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTATTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a > 1:1583528/1‑128 (MQ=255) tACTTATTATTGAGTTTCAACAAAAAGAGTAACAAATGTTTAACAAAGTTAAATGGTATGGGATGTTGTTTAATAATAAAATATAAAACCAAAAACTTTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑a < 1:1458362/128‑1 (MQ=255) ttttttTGATTTTCAACAAAAATTGATATAAATTCTTAACCAATTAAAATTTAAATTTTATTTTATTAAAAATAAAATATAAAACAAAATACATTTTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaa < 1:1693690/126‑1 (MQ=255) tcttTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaa > 1:2118938/1‑128 (MQ=255) cttTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATTCTAAGTTAAGTTTATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATATTTTTAGATTTATTTATAT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaa > 2:2736154/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACCTTGTGTTAGGTTTTGTTATTT‑ACT‑A‑A‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaa > 1:2511162/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaa > 2:1311456/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaa > 1:3478862/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaa > 1:3345269/1‑128 (MQ=255) tttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTATTTTTTTTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaa > 2:1384056/1‑128 (MQ=255) ttATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGATAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATTGTAATATGTTTTTATATTT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaa > 2:3837283/1‑128 (MQ=255) aTGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaa > 1:1959987/1‑128 (MQ=255) aGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aa > 1:1048875/1‑128 (MQ=255) aGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTCTGTATTATATTATTATAT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aa > 2:80834/1‑128 (MQ=255) caacaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTCGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaat > 2:932518/1‑126 (MQ=255) caacaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACAAATTGTTTGTATTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaa > 2:2592317/1‑126 (MQ=255) caacaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAAAGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaa > 2:2153668/1‑126 (MQ=255) aaaaaaaattataataaATTCTTAACCAATTAAAATTATAAGTGAATTTTTTTAAAAATAAAATATTAAAACAAATAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTT‑AAT‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑Aataata < 1:1814608/117‑1 (MQ=255) acaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaaat > 1:3781697/1‑124 (MQ=255) acaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTATTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaa > 1:383855/1‑124 (MQ=255) acaaAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACAATTTGTTTTGTTATTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaa > 2:1507873/1‑124 (MQ=255) agTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTTGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaataatataa > 1:2774042/1‑116 (MQ=255) gTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GA‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑AAAttttaat > 2:3317864/1‑124 (MQ=255) gTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑Aaaaataataaaaattaa > 2:265348/1‑117 (MQ=255) aaGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTTGGATTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAAAA‑TAAttttaata > 1:3724358/1‑123 (MQ=255) taaaTGCTTAACAAATTACAATGATAATTTAAGTTGATTAATAATAAAATATTAAACAAAAAACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACtat < 1:3406730/127‑1 (MQ=255) aaTGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAAtttatataattt > 1:1643103/1‑119 (MQ=255) ggtGAAACAAGTAAAATGCTAAGTTAATTTTATTAAAAATAAAATTTTAAACCAAATAAATTTTTTTTGGTTTTTTTATTT‑AAA‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATaaaa < 1:3101542/126‑1 (MQ=255) gAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTTGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑AGA‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑AAATTTACAAACAAAAAAAAAt > 2:1156235/1‑128 (MQ=255) ccAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAAAA‑TAATTTACATAATATAAAAAATTg > 1:89899/1‑128 (MQ=255) ccAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAATA‑AAATTTTAATAATATAAAAAAttt > 1:1263905/1‑127 (MQ=255) ccAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAATTAATTTTAATTATATAAAAAAtttt > 1:411030/1‑126 (MQ=255) aaGTACAATGGTAAGTGAATTTGTTGAATAATTAATTATTAAAACAAAAACATTTTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAA‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGttt < 1:3669180/128‑1 (MQ=255) aaGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAAAA‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTTAATACTATAAAAAATAGt > 1:322509/1‑128 (MQ=255) aaagCTAAGAGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTCATTGGTTTTTAAATTT‑AATAA‑T‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAACAAAAAAA‑AAATAAGAAAACTATAAAAAAttttaaatcaa > 2:3887524/4‑119 (MQ=255) ttaagttaagtTGATGATTAATAAAATTTTTAAACAATTAATTTTTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATaa < 1:965112/127‑1 (MQ=255) cTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAAAA‑AAATTAAAAAAATAAAAAAAATTATTTTT‑Aaaaaaa > 1:2659635/1‑128 (MQ=255) aGTGAATTTTATTAAAAATAAAATATTAAACAAAAAAAATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAA‑A‑T‑TTAAAAAA‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATa < 1:64025/128‑1 (MQ=255) attttattaataatAAAATTTTAAACAAAATAAATTTTTTTTGGTTTTTTTTTTT‑AAT‑T‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAg < 2:1617197/120‑1 (MQ=255) tttttttaaaaataaAAAATTAAACAAAATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAT‑T‑T‑TA‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAgg < 1:782357/118‑1 (MQ=255) ttttctttaaaataaAAAATTAAAACAAAATATTTTTGTTTGTTTTTTTTATTTAATT‑T‑T‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGa < 2:2423539/118‑1 (MQ=255) gtagatgaATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑AAATTTTAATAAAAAAAAAAATTTTTTTT‑Aaaaaaataattaaat > 2:1760350/4‑119 (MQ=255) gTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTTAATAAAATAAAAAATTATTATT‑AAAAAAAATaaaaaaa > 1:1324154/1‑122 (MQ=255) tattaataatAAAATATTAAACCAAATATATTTTGTTTGGTTTTTTTTTTT‑ATT‑T‑T‑TTTA‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAg < 2:3742146/124‑1 (MQ=255) atgaATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑TAATTTTAAAAATAAAAAAAATTTTTTTT‑AAAAAAAGTAttaattataa > 1:833982/1‑120 (MQ=255) ttataaaaaaaaTATTAAAAAAAAAAATTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTT‑ATT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTaa < 2:3196382/120‑1 (MQ=255) ttaattatAATATATTAAAAATAATACAATTTTTTTTGTTTTTTTAATT‑AAT‑T‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGtta < 1:2861444/126‑3 (MQ=255) tcaataatATATGTTTATACAAAATAATTTTGGTTGGGTTTTTTTTTTT‑ATT‑T‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTaa < 2:2232537/126‑1 (MQ=255) gtaataatAAAATTTAAAACAAAAATAATTTTGTTTGTTTTTTTTTTTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTaa < 1:2060363/126‑1 (MQ=255) aataaAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑AATAAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATAATAAAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATAAGGGAGTAAATTTa > 2:3495210/1‑128 (MQ=255) ataaAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATATTT‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑AAAATAAGTATTAAGTAGTAAATTTaa > 1:362347/1‑128 (MQ=255) taaAATATTAAACCAAATACATTTTTTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑T‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTaaa < 1:3003192/128‑1 (MQ=255) atttttAAACAAAATAATTTGTTTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑TTAA‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTaaaaa < 2:3145139/124‑1 (MQ=255) aaGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAAAA‑AAATTTAAATAATAAAAAAAATTTTTTTT‑CAAATAATAATTAAGGATAAAATTTaaaaaa > 2:3021206/1‑128 (MQ=255) aaGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTAAGTAGTAAATTTAAAAAAcc > 1:2395974/1‑128 (MQ=255) aGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑TAAATTGCAAAAAATAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATTATAAATGATAAAATTTAAAAAAc > 2:3439953/1‑128 (MQ=255) tttttaaCAAAATATATTTTTGTGGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑TAT‑‑‑‑‑‑T‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAATATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAATTTTAAAAAACCa < 2:1963582/123‑1 (MQ=255) aTTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAATTTTAAAAAACAAaga > 1:3306592/1‑128 (MQ=255) ttAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑AAAATAAGTATTCAGGATTAAATTTAAAAAACCAaga > 1:1138366/1‑128 (MQ=255) ttAAAAAAAATAAATTTGTTTTGTTTTTTTTATTT‑AAT‑T‑T‑TTAA‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCa < 1:3536786/128‑1 (MQ=255) ttaaataattaaaTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTT‑TTT‑T‑T‑T‑‑‑‑‑‑TAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAAAA‑TAATATGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CTAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAag < 2:2035769/116‑1 (MQ=255) tAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATTATA‑TAATTTAGTTA‑AAAAAAAAATTATTTTTAAAAATAATTTTAAAGGTTTAAATTTAAAAAAACata > 2:565830/1‑126 (MQ=255) tAAACCAAATAAATTGTTTTTGTTTTTTTTATTT‑AAT‑T‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAag < 1:2592317/128‑1 (MQ=255) aaCCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATTATA‑TTTTTTGATTTATATAAAAATTTTTTTTT‑AAAAAAATTAATAATGATTAAATTTAAAAAACaaatat > 1:1538626/1‑125 (MQ=255) aaCCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GA‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGAATAAAATAAAAAATTTTTTTT‑TAAAAAATTATTAAGTATTAAATTTAAAAAACaaaaata > 2:3084621/1‑124 (MQ=255) aaaaataaatTTTGTTTGTTTTTTTTTTTT‑AAT‑T‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAttt < 1:1754855/126‑1 (MQ=255) cAAACACAATGTATTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATc > 2:1677071/1‑128 (MQ=255) aaaTACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAATA‑AAATTTTAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATTATTAATTAATAAAATTaaaaaaaaaatatttaa > 2:2360165/1‑117 (MQ=255) aaaTAATTTTTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTtat < 2:3251704/128‑1 (MQ=255) aaaaCAATGTTTTTGGTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTtata < 1:598319/125‑1 (MQ=255) aaTAAATTGGGTTTGGTTTTTTTTTTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTtata < 2:3374449/128‑1 (MQ=255) aCAATGTATTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAATA‑AAATTTAAAAAATATAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATAATAAAATATTAAATTTAAAAAAAAAATATTTAAAAAt > 1:1374733/1‑128 (MQ=255) aattttttttGTTTTTTTTAATT‑AAT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑T‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCtt < 1:480221/121‑1 (MQ=255) gtatttGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGAATAATATAAAAATTTTTTTTT‑AAAATATTTATTAAGATATTAATTTAAAAAAAAAAATTTTATAAATCtttg > 1:1001909/4‑126 (MQ=255) tgtTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAAAA‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTTAATAATAAAAAAAATTTTTTTT‑AAATAAATTATTAATGATAAAATTTAAAAAAAAAAAATTTAAAAATCTTgt > 1:2345682/1‑127 (MQ=255) tgtTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAATAGTTTTAAATCTTGGt > 1:3048984/1‑128 (MQ=255) tatttGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑AAATTTTAATAAATAAAAAAATTTTTTTT‑CAAAAAATTAATATGAAGTAAATTTAAAAAAAAAATATTTATAAAtataagt > 1:2297198/3‑122 (MQ=255) ttttGTTTTTTTTATTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATTATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGtt < 2:2508695/127‑1 (MQ=255) ttttGGTTTTTTTATTT‑ACT‑T‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGTAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGtt < 2:2087638/127‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTTTATTT‑ACT‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGttttt < 1:720796/128‑1 (MQ=255) tGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGGATACTATAAAAAATTATTTTT‑AAAAAAAGAATTCAGGATTAATTTAAAAAAACCAAGATTTTTAACTATTGAttttt > 1:2455103/1‑128 (MQ=255) tGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑TATTTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATTATTAAGTAGTAAATTTAAAAAACCAAGAATTATAAATATAGGatttt > 2:1213069/1‑128 (MQ=255) tGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑TAATTTTAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATTATTAATTATTAAATTTAAAAAAAAAATATTTAAAAATATtttttttt > 2:2849125/1‑128 (MQ=255) tGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAATTATTCAGTAGTAAATTTAAAAAACAAAGATTTATAAATCTTTGttttttt > 2:452831/1‑127 (MQ=255) gttttttttATTT‑AAA‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGtttttt < 2:1078423/126‑1 (MQ=255) ggTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTTCATAATATAAAAAATTTTTTTA‑AAAAAAATTATTAAGTATTAAATTTAAAAAAAAAAGAGTAATAAATATTGGtttttt > 1:542610/1‑128 (MQ=255) ttttttttttT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGt < 2:863011/128‑1 (MQ=255) ttttttATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAAAA‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑AAAATAAGTATTAAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGCTTTATAAATCTTGATTTTTTGt > 1:3171704/1‑128 (MQ=255) tttttATTT‑AAT‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTta < 1:1217918/128‑1 (MQ=255) tttttATTT‑AAT‑A‑T‑TTA‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGttt < 1:3576943/128‑1 (MQ=255) ttttATTT‑ATT‑ATT‑T‑‑‑‑‑‑A‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTtat < 1:2954143/128‑1 (MQ=255) tattt‑aCT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑GAA‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGAATAATTTAAAAAATTTTTTTT‑AAAATAATTATTAAGGAGTAAATTTAAAAAAAAAAAATTTATAAATATTGTTTTTTTTTatatat > 1:2221652/1‑128 (MQ=255) tttaatattttaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTAtatta < 2:2919043/116‑1 (MQ=255) tttttaaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAATTTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATattattatt < 2:3672779/121‑1 (MQ=255) tttttaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCATGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAttt < 2:3583330/122‑1 (MQ=255) tttttaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAttt < 1:1903662/122‑1 (MQ=255) atttaaa‑a‑‑aaaaaaaaaat‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAttt < 2:1874051/122‑1 (MQ=255) ttttaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTTCATTATATAAAAAATTGTTTTT‑TAAATTATTATTTATGTTTAAATTTTAAAAAACAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTg < 1:2702630/123‑1 (MQ=255) aaa‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTATTA‑TAATTTTCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGATATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCt < 2:744410/126‑1 (MQ=255) a‑a‑‑aaaaaaaaaaa‑aaTAATA‑TAATTTGCATACTATTAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCttt < 1:2017242/128‑1 (MQ=255) | TTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACT‑A‑T‑T‑‑‑‑‑‑G‑‑‑A‑A‑‑AAAAAAAAAAA‑AATAATA‑TAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTT‑CAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTTT > CP016816/34819‑35073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |