| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 202486 | 203 (0.060) | 361 (0.110) | 82/250 | 42.4 | 61.9% | intergenic (+264/‑411) | JCVSYN2_00840/JCVSYN2_00845 | hypothetical protein/lipoprotein |
| ? | CP016816 | 202490 = | 242 (0.070) | intergenic (+268/‑407) | JCVSYN2_00840/JCVSYN2_00845 | hypothetical protein/lipoprotein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/202360‑202486‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATATATAATACT > CP016816/202490‑202613 GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCTTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑A > 1:6177513/1‑128GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑A > 1:5722921/1‑128GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑‑AAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AA > 2:6217486/1‑128GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTATTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAACCCAT‑T‑A > 2:2654948/1‑128GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATACTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTATAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑A > 2:2474492/1‑128 TTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAACCAAACCCCT‑T‑AA > 2:3189894/1‑128 TAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCAT‑T‑AAA > 1:5511466/1‑128 TAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCACAT‑T‑AAA > 1:6243280/1‑128 TGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATACTCGTTATCTATTTTTTTATTTCTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAACCACT‑T‑AAAAA‑T > 1:4610710/1‑128 GTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑A‑AAAAAat > 1:1738215/1‑126 TAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATATTTTTATTTGTATAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATAACCT‑T‑AAAAA‑Tta > 2:765509/1‑126 AATAATAGAGTTAAGTTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTACATACTCGTGATCTAATTTTTTATTTGTTTAT‑ATTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAAAACCT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAA > 1:6421407/1‑128 AATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCTTTATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑‑AAAAAAAAACAATAAACA‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAA > 2:5636304/1‑128 AATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATACTCGTGATCTATTTTTTTATTTATTTAT‑CTTAACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATAAAAA‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAA > 2:6860506/1‑128 ATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCTTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATAAAAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAA > 2:3527322/1‑128 ATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTATTATAATGTAGATCATCTTTATATATTTTTTTATTTATTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAACCAAT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAA > 2:1199312/1‑128 TAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTATTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAA > 2:5913687/1‑128 TAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATACTCGTGATCTATTTATTTATTTTTATAT‑CTTCAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAATAAAAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAA > 2:2357289/1‑128 AATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAA > 1:793970/1‑128 AATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCACCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAA > 1:5807475/1‑128 AATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTAACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCAACT‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAA > 1:3404926/1‑128 ATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAA > 1:6036393/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTATATCCTCGTGATCTATTTTTATATTTGTTAAT‑CTTCACAAAA‑AAAAAAAAAACAATCCAAT‑A‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAA > 2:3629491/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTATATACTCGTGATCTATTTATTTATTTATTTAT‑ATTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATACAAA‑T‑AAAAA‑A‑‑A‑AAAAAAAA > 1:156869/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCTTAATCTATTTTATAATTTGTTTAT‑ATTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATACAAA‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAA > 1:2189418/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAA > 1:700466/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAA > 1:5958517/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAAACCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAA > 1:5426165/1‑128 TAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAA‑AATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAA > 1:7221197/1‑128 GTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCATCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCAAAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAA > 2:6949940/1‑128 TTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAA > 2:6134497/1‑128 TAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑‑AAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:7028118/1‑128 TAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑ATTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAACAA‑T‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAA > 1:3476645/1‑128 TAAAGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTTATTAT‑CTTCAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAACAT‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAA > 2:915778/1‑128 AAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCTTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCCCAT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:3646160/1‑128 AAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAA > 2:5727149/1‑128 AAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCCCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:5688014/1‑128 AGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTATATCCTCTTTATCTATTTTATTATTTGTATAT‑ATTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAACACAT‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAA > 2:4566314/1‑128 AGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCAGCT‑A‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAATAAAATAA > 1:6124841/1‑128 AGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATAAAAT‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAA > 1:371090/1‑128 AGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCATCGTGATCTATTTTTTTATTAGTTTAT‑CTACACAAAT‑AAAAAAAAAACAATAACCT‑T‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAA > 2:5991862/1‑128 GGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAACACAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:4002740/1‑128 GGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAACAAA‑T‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:6630617/1‑128 GGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTAATATTTAATTTGTTTAT‑CTTCACAAAA‑AAAAAAAAAACAAACCCCT‑A‑AAAAA‑A‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:2994449/1‑128 GTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATAACCA‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:2534535/1‑128 TAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTTTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATAAACA‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:2096177/1‑128 AATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAa > 2:5526332/1‑127 AATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAAAACAT‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAa > 2:6543912/1‑127 AATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTATTATTTGTTTAT‑CTTCAAAAAT‑AAAAAAAAAACAATAACATAA‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 2:2274444/1‑128 AATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCATCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAATAAAAAAAAAAACAAACCACT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:6469794/1‑128 ATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATTTAGATACTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑ATTAAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAATAAACT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaa > 1:685581/1‑126 TTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTTTTTAT‑CATCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAACAAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaa > 2:6490392/1‑125 TAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAACCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaaa > 2:5851356/1‑124 TAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAAACCACT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaat > 1:7124475/1‑124 AAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaaaa > 1:3828056/1‑123 AAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCACT‑T‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaaaa > 1:4120590/1‑123 AAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTAATATGTTTAT‑CTACACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAAACAT‑A‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaaaa > 2:1772678/1‑123 AAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCACCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 2:5692697/1‑128 AAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATACCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:103862/1‑128 AATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 2:6097161/1‑128 AATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCCCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:2415245/1‑128 TAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTATTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCCCCT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAACAAAaa > 2:6326970/1‑126 AACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGATTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑A‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAATAAACAAAAAAACAAACAAAAAACTaa > 1:6393316/1‑126 ttTTTTTTTATTTTTTTAT‑ATAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAACCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTT < 2:4858293/126‑1 TATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTAAAAAAT‑AAAAAAAAAA‑AATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTT < 2:1421095/128‑1 ATTTTTTTATTTTTTTAT‑ATAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAATACCCT‑TAAAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTT < 2:6717095/128‑1 aTTTTTATTTTTTTTAT‑AATAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTA < 2:1356920/127‑1 TTTTTTTTTTTTTTTAT‑AATTAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAATCCCCT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTA < 2:2991353/128‑1 TTTTTATATTT‑TTTAT‑CTTCACAAAA‑AAAAAAAAAAAAATAACAT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTA < 2:5059144/128‑1 TTTTTTTTTTTTTTAT‑TTTAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAACCCCA‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAA < 1:4961623/128‑1 TTTTTTATTT‑TTATT‑CTTCAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAACCCCT‑T‑AAAAA‑TA‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAA < 1:5539050/128‑1 TTTTATTTTTTTTT‑ATTAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAACCCT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAA < 1:6288051/128‑1 TTTTATTTTTTTAT‑ATTAAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAATACACT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAA < 2:2585224/128‑1 TATTTTTTTATATTTCAAAAAT‑AAAAAAAAAAAAAATCCTA‑T‑AAAAT‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATA < 1:1889556/128‑1 tTTTTTTTAT‑ATTAACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAACCCCT‑T‑AAAAA‑A‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAG < 1:1704121/127‑1 ATTTTTTTAT‑ATT‑AAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAACCCCT‑T‑AAAAA‑TA‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAG < 2:242526/128‑1 tttttataaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAACCT‑T‑AAAAA‑A‑‑ATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATT < 1:6543912/118‑1 tatttttaaaAAAT‑AAAAAAAAAAAAATACCAT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCACTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATT < 2:5250119/118‑1 ttaaTTCACAAAT‑AAAAAAAAAAAAAAACCATAA‑AAAAA‑TA‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATT < 2:409383/124‑1 atattaaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAACCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACA < 2:1655257/120‑1 atattaaAAAA‑AAAAAAAAAACAAAGACCT‑A‑TAAAA‑T‑‑T‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACA < 1:5494773/121‑1 tttaaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAATCCCAT‑A‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACAT < 1:4229600/122‑1 attaaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAATACCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATA < 1:3548446/122‑1 ttaaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAATAAACT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACAT < 1:4870206/123‑1 aaaAAAT‑AAAAAAAAAAAAAACCCCA‑T‑AAAAA‑‑‑‑A‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATA < 2:192180/125‑1 aaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAATCACCA‑T‑AAAAA‑TTAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATA < 2:7026761/125‑1 aaaAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAACCCT‑T‑AAAAA‑TTAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATA < 2:6435599/125‑1 aaAAAA‑AAAAAAAAAAAAATAAAAT‑A‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAAT < 1:6949940/126‑1 aAAAA‑AAAAAAAAAAAAATACCAT‑TAAAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATA < 1:6735849/127‑1 AAAT‑AAAAAAAAAACAATAACCT‑T‑AAAAA‑T‑‑‑‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATA < 2:793970/128‑1 aaAAAAAAAAAAAAATACCAT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATA < 1:916106/126‑1 T‑AAAAAAAAAACAAAAACATAA‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATA < 2:7186048/128‑1 T‑AAAAAAAAAAAAATAACAT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCATATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATA < 2:3371531/128‑1 AAAAAAAAAAAATACCCT‑T‑AAAAATT‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATC < 2:4442371/128‑1 AAAAAAAATCCCCA‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑TAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATA < 2:3741340/128‑1 aaaaaaaccaT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATAT < 2:4137551/118‑1 aaaAATACCCA‑T‑AAAAA‑TA‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATA < 1:91047/125‑1 attaatT‑T‑AATAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTATTAAAATTCACTATTATATAACATTTTATTTTTAAAATAATATATTGACATAATATATATCTAATATATATAA < 1:2674813/122‑1 caaT‑T‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATATATAATAC < 2:3463703/125‑1 caaaT‑AAAAA‑T‑‑T‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATATATAATAC < 1:2794743/124‑1 GTTAGTGTAAATAATAGAGTTAAGGTTAATTAAAATACCATAAACTTAATAATTCTTATAATGTAGATCCTCGTGATCTATTTTTTTATTTGTTTAT‑CTTCACAAAT‑AAAAAAAAAACAATCCCCT‑T‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/202360‑202486‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAA‑T‑‑A‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAAAACAAACTCTATTTCTTAAAATTCCCTATTATACCACATTTTATTTTTAAAATAAGATATTGACATAATATATATCTAATATATATAATACT > CP016816/202490‑202613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |