| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 165,222 | G→A | intergenic (+186/‑356) | JCVSYN2_00665 → / → JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 165,222 | 0 | G | A | 99.0% | 11173.8 / 69.8 | 3697 | intergenic (+186/‑356) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (2424/1215); minor base . (11/26); total (2437/1260) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 3793 total aligned reads displayed.
CTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAA > CP016816/165097‑165348 | cTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTaaaaaa > 1:9309212/1‑128 (MQ=255) tttAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAaat < 2:10325317/128‑1 (MQ=255) ttAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAaatt > 2:1983683/1‑128 (MQ=255) ttAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAaatt < 2:10141370/128‑1 (MQ=255) aaTTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAaattaa > 2:1415480/1‑128 (MQ=255) tGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAAttt < 1:6107900/128‑1 (MQ=255) tGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAAttt < 1:4861850/128‑1 (MQ=255) gTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTg < 1:6426734/128‑1 (MQ=255) aTTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTaa > 1:3826283/1‑128 (MQ=255) aTTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGaa > 2:775151/1‑128 (MQ=255) aTTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGaa < 1:3656642/128‑1 (MQ=255) ttactttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAc > 2:1215758/1‑128 (MQ=255) actttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACtt > 2:6208238/1‑128 (MQ=255) tttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTGt > 1:9477213/1‑128 (MQ=255) tttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGt > 2:867295/1‑128 (MQ=255) tttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGt > 1:5254373/1‑128 (MQ=255) tttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGt > 2:8208705/1‑128 (MQ=255) tttactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTCTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGt > 1:5752770/1‑128 (MQ=255) tactAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTaa < 1:7887082/128‑1 (MQ=255) actAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTTTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTGTaaa > 2:3124354/1‑128 (MQ=255) actAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTaaa > 1:1973594/1‑128 (MQ=255) aGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATTAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTaaaaaa > 2:6741322/1‑128 (MQ=255) aGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAAATTGATCTTGTaaaaaa > 2:4480338/1‑128 (MQ=255) aGTTGATAATATTTAGTTTAATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTaaaaaa < 2:7112884/128‑1 (MQ=255) gTTGCTAATATTTAGTATCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTaaaaaaa < 2:979791/128‑2 (MQ=255) ttGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATa > 2:8506146/1‑128 (MQ=255) gATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGc > 2:1045882/1‑128 (MQ=255) taataTTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑tt > 1:142081/1‑128 (MQ=255) atatTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAATTGTAAAAAATAGA‑tttt > 2:1774894/1‑128 (MQ=255) atatTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTAGAACTTGTAAAAAATAGC‑tttt > 2:9653150/1‑128 (MQ=255) tttAGTTTCATTAAATTAACCCACTTTTTATAATTACTAATAAACTAAAACTATTATCTTTTTATAAA‑TTTTTTGTATAAGCAAAATTTTAAAAAAATAATTTTAACATGTAAAAAAAACC‑ttttt‑tt < 1:2650095/128‑1 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttt > 2:1570490/1‑128 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttt > 2:382448/1‑128 (MQ=255) aGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑ttttt > 2:329979/1‑128 (MQ=255) gTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATAGa‑ttttt‑attttt > 2:2611863/1‑128 (MQ=255) gTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑attttt > 2:8068054/1‑128 (MQ=255) ttatttatttATCGCACTTTTATGAATTAGTAAGAAAATAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTTTAAAAAAAAGC‑ttttt‑ttttttttt < 2:517027/126‑1 (MQ=255) tCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑ttttttttt > 2:9491971/1‑128 (MQ=255) tAATTTAACGCAATTTTTTTAATTATTAATAAAAAAAAAAAATTTTATTTTT‑TATATTTTTTTTTTTATTCAAATTTTTAAAAAAATAATTTTAAATTGAAAAAAAAAGC‑ttttt‑ttttttttttttt < 1:3237410/128‑1 (MQ=255) aaTTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttttttttttttt > 1:8369650/1‑128 (MQ=255) tttATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTATATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAATTTTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttttttttttttttt > 1:5408762/1‑126 (MQ=255) tttATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTtat > 2:7321055/1‑128 (MQ=255) aTCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTCTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttttttttttatataatt > 2:5667797/1‑120 (MQ=255) ccccattGTATCTATTAGTAAGAAACAAAAAATATAAT‑ATATTATTTATTTTTTTTTAATTGAAAAATTTAAAAAAATTTATTTTTACTTGTAAAAAATACC‑GTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATgg < 1:1244203/123‑1 (MQ=255) cGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTtaataata > 2:8965009/1‑122 (MQ=255) cTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑ttttt‑tttttttttttttttaatataaatt > 1:4117252/1‑117 (MQ=255) cTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTAGAAAAAAATAGC‑ttttt‑tttttatttttttaaattaaaattt > 1:2387282/1‑116 (MQ=255) ttGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTT‑TAATTTAAatat > 1:7548803/1‑128 (MQ=255) ttGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAA‑AATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATTGAAatat > 2:8327537/1‑128 (MQ=255) tttattaattattaatAAAATAAAACTATTATATTTTTATATA‑TTTTTTTTATATTAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTTTAAAAAAAATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAatat < 1:982814/126‑1 (MQ=255) gTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTTTAATGGaataata > 1:7330006/1‑123 (MQ=255) tATTAATTAGTAATTAATTAAAAATTTTTTTTTTTTATTTA‑TTTTTTTTTTATTTAAATTTTTTAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAAAAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATaa < 2:7541935/128‑1 (MQ=255) tATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTtttataatttatttta > 2:9345998/1‑116 (MQ=255) tATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTTTTATTTAAAAATaa > 1:10007984/1‑128 (MQ=255) tATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGTAAATTTaa > 2:8838753/1‑128 (MQ=255) aTGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAAttaatataaatat > 2:6564453/1‑116 (MQ=255) gAATTATTAATAAAATAAAAATATTTTTTTTTTTTATA‑TTTTTTTTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATAG‑‑GTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAAttt < 2:4808112/128‑1 (MQ=255) tattattattaaactaaaaattTTTTTTTTTTTTTTA‑TTTTTTGTTTTTGCAAATTTTTAAAAAATTTATTTTAACTTTTAAAAAAT‑TC‑GTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAAtttt < 2:7916576/118‑1 (MQ=255) aGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAGTTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTA‑AATTGTAATATAAATTTTattat > 1:5053098/1‑124 (MQ=255) aGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTAAATATATTAAATATAAATTTTAgg > 1:451867/1‑128 (MQ=255) gttaccataaaaaactaTTTTTGTTTTTGATA‑TTTTTTGTATATTCAAAATTTTAAAAAATTTATTTTTACGTTTAAAAAATATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGt < 1:6668064/118‑1 (MQ=255) gTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATTTAAATATAAATTTTattt > 2:4665644/1‑125 (MQ=255) taataaAATAAAAATATTATTTTTTTATATA‑TTTTTTGTATATTTAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAATTTTAAAAAATATCTTTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGt < 2:3664969/128‑1 (MQ=255) tAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGCTTTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGTAAAAATAAATTTTattt > 2:2136843/1‑125 (MQ=255) aaGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTAGTATAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTATTTTTTTATTATAATCTAAATAAAAAttaaattaatt > 2:2315806/1‑119 (MQ=255) attaaataaaaattTTTTTTTTTTTGTTT‑TTTTTTTTTTATTTAAATTTTTTAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATA‑T‑GTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTAttt < 1:5546781/122‑1 (MQ=255) aaactaaaactaTTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTA‑AAT‑TAAATAAAAATTTTTAGtttttttt > 1:10169656/1‑126 (MQ=255) aactaaaactaTAATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGTAAATATAAATTTTatataatattt > 2:5866727/1‑118 (MQ=255) taaaataTTATCTTTTTTTTTT‑TTTTTTTTATTTTTAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTTTTTAAAAT‑‑‑‑TGATT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTa < 1:7087232/127‑1 (MQ=255) aaaaattTTATCTTTTTATTTA‑TTTTTTTTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTtgttgt < 2:9134226/128‑1 (MQ=255) actaTTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGTAAATATAAATTTTATTTATttttttttaaa > 2:5006724/1‑123 (MQ=255) aatattatTTTTTTATATA‑TTTTTTTTATTTTTAAATTTTTAAAAAATTTATTTTTAATTTTTAAAAATTTC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTa < 2:6385166/126‑1 (MQ=255) aaattatATTTTTTTATA‑ATTTTTTTATAATAAAATTTTTAAAAAATTTATTTTAAATTTTAAAAAATATG‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTaa < 2:5322778/126‑1 (MQ=255) tattatCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTAAAAATGAAAATAAAAATTTTATTTATtttttttaaaaat > 2:3485579/1‑121 (MQ=255) ttatCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATTGAAATAAAAATTTTATGTATTTTTTTTTATaataat > 1:3033852/1‑124 (MQ=255) atCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAAAATAAATTTTAGTTATTTTTTTTTATAATTAta > 1:8743580/1‑127 (MQ=255) ttttAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGCTTTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATTTAAATATAAATTTTAGTTATTTTTTTTTATAATTATATaa > 2:5486006/1‑128 (MQ=255) ttttAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑TTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGTTATTTTTTTTTAAAATTATATaaaaa > 1:1744264/1‑128 (MQ=255) ttAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTTATTTTTTTTTTTTTTATAATTTAAAAAAAAATTATATTTATTTTTTTTTCTAATTATaaaaaa > 1:8195657/1‑128 (MQ=255) tttata‑tTTTTTTTATATTAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATATC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTaaaaaaa < 2:29650/125‑1 (MQ=255) tAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATATTGTAAATATAAATTTTTGTTATTTTGTTTAATAAGTAGATaaaaaaa > 1:9122901/1‑128 (MQ=255) gaaaatttttGTATAAGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAAATTTAAAAAAATTC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAAt < 1:9622929/123‑1 (MQ=255) ata‑tTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTAAAATTTAAAAATAATTTTTATTTATTTTTTTTTATAATTAaaaaaaaaaaaa > 2:246327/1‑126 (MQ=255) attttttttttATAAGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTTTTAAAAAAAGT‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTAACTAAAAAAATa < 1:6853015/125‑1 (MQ=255) a‑tTTTTTTTATATTTAAAATTTATAAAAATTAATTTTTATATTTTAAAAATATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGa < 2:6906615/128‑1 (MQ=255) a‑tTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGTAAATATAAATTTTAGTTATTTTTTTTTATAATTATATAAAAAAATata > 2:6041921/1‑126 (MQ=255) ttttttttATGAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTTTAAAAAATATCTTTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGaaa < 1:3462863/128‑1 (MQ=255) ttttttatGAAAATTTTTAAAAAATTATTTTTAACTTTTAAAAAATATC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGaa < 1:1072304/123‑1 (MQ=255) ttGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGTTATTTTGTTTTATATTTATATAAAAAAATatatagta > 1:2858367/1‑121 (MQ=255) gttttttgaaaTTTTTAAAAAATTTATTTTAACTTTTAAAAAATATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGaaa < 1:8533238/120‑1 (MQ=255) tttatttaaaTTTTTTAAAAATTAATTTTTAATTTTAAAAAATTTT‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGaaaa < 1:2198150/121‑1 (MQ=255) tttatttaaaTTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTTTAAAAAATATC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGaaaa < 1:1037795/121‑1 (MQ=255) ttttaaaTTTTTAAAAAATTTATTTTTTTTTTTTAAAAATATT‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAat < 1:4694065/124‑1 (MQ=255) attcAAATTTTTAAAAAATTTATTTTTACTTTTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAat < 1:9966008/125‑1 (MQ=255) cAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTTTAATGGAATTATTATTTTTTGGTTTTTTTTTTTCTATGTATCT‑AAAAAATAGAAAGTAAAAATTTTTg > 2:4067853/1‑128 (MQ=255) aaaTTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTA‑ATTGAAAATAAAATTTTTTGTTTTTTTTTTGTAAAATAAAAAAAAAAATTAAAAAGTAAAAAAAAtttt > 1:894930/1‑126 (MQ=255) aaTTTTTAAAAAATTAAGTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TGTTT‑TTTTTTTTTTTTTTTAAATGGAAATAAAAATTTTTGTTATTTTTTTTGATATTTTACAAAAAAAAAAAAAATTAAAAAATAttat > 1:589489/1‑126 (MQ=255) aTTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTTTTGTCTAAGTATCAAAAAAAATATAAAGCAAAAAATTTTGtt > 1:8060085/1‑128 (MQ=255) aTTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATTTAATTATAAATTTTAGTTTTTTTTTTTTATAATTATATAAAAAATTAAAAATGAAAAAATTTTGTTa > 2:4294069/1‑128 (MQ=255) taaaaaaTTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTAAAATGTAAATTAAATTTTTAGTTATTTTTTTTTATATTTTTATAAAAAAAATAAAATAAAAAAATATTGTAaaaat > 2:2778701/2‑127 (MQ=255) | CTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATA‑TTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑TTTTT‑TTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAA > CP016816/165097‑165348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |