| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 311148 | 470 (0.400) | 273 (0.190) +TATA |
74/192 | 12.2 | 30.3% | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | 311149 = | 704 (0.480) | intergenic (‑72/‑242) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 972 total aligned reads displayed.
TGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311021‑311275 | tGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcattcat > 2:3100022/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcattcat‑‑‑‑t > 2:2542799/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcattcat‑‑‑‑t > 1:2216263/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcatacat‑‑‑‑t > 1:640671/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAAGATTCAAAACATATATAACATAcaatcat‑‑‑‑t > 2:793782/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTAATAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcaatcat‑‑‑‑t > 2:2950401/1‑128 (MQ=255) tACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑ta > 2:1514023/1‑128 (MQ=255) aCCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tat > 1:453763/1‑128 (MQ=255) aCCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tat > 1:3075154/1‑128 (MQ=255) gcAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATAAACTTTTTCATTTTACACACCCATAATTAAAAAATAAAATACTTCTTACATACGATTCAATACATATATTACATACATTCAT‑‑‑‑tata > 1:1615080/2‑128 (MQ=255) aGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatata > 2:1164885/1‑128 (MQ=255) tGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATAAATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatat > 1:273837/1‑128 (MQ=255) gTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatata > 2:2754549/1‑128 (MQ=255) aaCTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatat > 1:3107273/1‑128 (MQ=255) atAATCAAAATGAATTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCACTTATTAAAAAATAAAATATTTGTTAAATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatat < 1:1890817/127‑1 (MQ=255) tAATCTAAATGAAATTAAAATTGTTAAAAACAATATCAATTTAAACACCCCTTATAAAAAAATAAAATACTATTTAAATATTATTCAAAACATATATAACATACAATCAT‑‑‑‑tatatatatatatatata < 2:1921316/128‑1 (MQ=255) tAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatata > 1:1308612/1‑128 (MQ=255) ataaaaaTTAACTTAAAATTTTAATTAAATTTTTCATTTTAAACACACATTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAATATTCAAAACATATATAACATACATTAAT‑‑‑‑tatatatatatatatatata < 1:1589590/124‑1 (MQ=255) aTCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACTATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatata > 2:1382219/1‑128 (MQ=255) tCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATAAAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatat > 1:2483555/1‑128 (MQ=255) ccAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatata > 1:1006824/1‑128 (MQ=255) cAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatat < 2:392900/128‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATTAAAATTGTAATTGACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTTTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatat < 1:2628952/127‑1 (MQ=255) aatagAAATTAATATTGTAATTAACTTTTTTTTTTTACACACACATAATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAAGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatata < 2:302045/124‑1 (MQ=255) aaTGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatatat > 1:864750/1‑128 (MQ=255) aTGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACTATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatatata > 2:2988099/1‑128 (MQ=255) tGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATa‑a > 1:509934/1‑128 (MQ=255) cTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCa > 2:305112/1‑128 (MQ=255) tAAAATTGTTATTAAATTTTTTATTTTAAACACAATTTATTAAAAAATAAAATACTTTTTATATACGATTCAAAACATATATAACATATATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑atat < 1:2273018/128‑1 (MQ=255) aaaaTTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatat > 2:2471136/1‑109 (MQ=255) aaaTTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑Gt > 1:789612/1‑128 (MQ=255) aaaTTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGAATCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑tatatatatatatatatatatatatatatatatat > 1:2668224/1‑119 (MQ=255) aaTTTTTATTAAATTTTTAATTTTAAACAAACCTTATTAAAAAATAAAATAATTTTTACATAATTTTCAAAAAAAATATATCATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑g < 1:2141144/128‑1 (MQ=21) ttGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATa‑aaaatatattta > 1:1121819/1‑117 (MQ=255) ttGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑TATCA‑ATAT‑‑CTa > 2:1051030/1‑128 (MQ=255) aaTTAACTTTTTCATTTTACACACCACTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGaaaa < 1:1945899/128‑1 (MQ=255) ttAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAata > 2:2649053/1‑128 (MQ=255) tAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTATAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAat > 1:1185209/1‑128 (MQ=255) aaatttttAATTTTACACACAAATTATTAAAAAATAAAATAATTTTTACATACTATTAAAAAAATATATAACATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGaaaa < 2:1796454/125‑1 (MQ=37) cTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑AATCA‑ATAT‑‑GTATATAAAAata > 2:2300486/1‑128 (MQ=255) tttACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑A‑A‑GCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGTTataatat > 2:2829521/1‑127 (MQ=255) tttACACACACTTTTTTAAAAAATAATATATTTGTTTCATAAGATTCAAAAAATATATAACATATATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAg < 1:258574/128‑1 (MQ=255) ttACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGTTataatatc > 2:3195374/1‑126 (MQ=255) ttAAACACACATTATTAAAAAATAAAATACTTGTTATATACTATACAAAACATATATAAAATATATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTataata < 2:1595115/128‑1 (MQ=38) atACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGAATCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATAGATATATATATATTTATATA‑ATTAA‑ATAT‑‑TTATAAGAAAATATgtaattaac > 1:983434/2‑120 (MQ=255) acacacCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATTTTatattata > 1:1924964/1‑126 (MQ=39) cacacCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTAA‑ATAT‑‑TTAAATAAAAATATTTTATAATAgaa > 1:2954036/1‑126 (MQ=38) cacCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATTAAAATATTGTATAATAGaaaact > 1:2784746/1‑125 (MQ=255) acCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTA‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATACA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATGTTATAATATCaa > 1:385170/1‑128 (MQ=255) ccccTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAATTGAAAATTTGGTATAAGAGCAACCg > 2:1252061/1‑128 (MQ=255) ccacTTATTAAAAAATATAATAATTGTTTCATAATATTAAAAAAATATATAAAATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCg < 2:1658033/125‑1 (MQ=37) cTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTtat < 1:105175/128‑1 (MQ=255) cTTATTAAAAAAAAAAATAATTTTTAAATAATATTCAAAACATATATAAAATAAATAAAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGttt < 1:2108651/128‑1 (MQ=37) ttattaAAAAATAAAATATTTTTTAAATATTATTATAAAAATATATATAATATATTATT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTta < 1:1408378/128‑1 (MQ=255) tattaAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTAA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACATTTtat > 1:3170931/1‑128 (MQ=39) tattaAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTtat < 2:2132810/128‑1 (MQ=255) tattaAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑ATAAATGAAAATATGTTATAATAGCACACGTTtat > 1:1354469/1‑128 (MQ=255) aaaaaaTAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATTCA‑ATAT‑‑ATAAAAGAAAATATTGTATAATATAAACCTTTTATAAAGTa > 2:2049635/1‑128 (MQ=255) aataaaataCTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTA‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATTTTATAATAGCAACATTTTATAAAGTa > 1:2332288/1‑128 (MQ=38) ataaaaaaCTAGTTAAATACTATTAAAAAAATATATAAAATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTaaaa < 1:2414081/128‑1 (MQ=38) aaaataCTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGTAAATGAAAATATTTTATAATAGAAACAGTTTAGaatttat > 2:718329/1‑123 (MQ=255) aaaataATTGTTAAATACGATTCAAAACATATATAAAATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAg < 2:452338/128‑1 (MQ=255) ataCTTTTTATATAAGATTCAAAAAATATATATCATAAATT‑A‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGt < 1:688649/128‑1 (MQ=255) taattGTTAAATAAGATTCAAAAAATATATAACATATATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAg < 1:1740300/125‑1 (MQ=39) cTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGTTATAATAGAAACATTTTATAAAGTAAAAAAATATTa > 2:2430465/1‑128 (MQ=39) cTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCT‑ATAT‑‑GTAAATTAAAATATTGTATAATATCAAACGTTTATAAACTAAATAAATAgaa > 1:3210982/1‑126 (MQ=38) ttGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑GAAAATAAAAATATTTTATAATATCAAGAGATTATAAAGTAAAAAAATa > 1:59091/1‑128 (MQ=25) tcttACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑AATATATATATATATATATATAAATA‑ATGCA‑ATAT‑‑ATAAATAAAAAAATGTATTAATATCAACAGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTaaa > 1:2051566/3‑128 (MQ=255) tttACATAATATTATAAACATATATAAAATAAATTTAT‑‑‑‑TTTATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTGAAAAAATAGTAAat < 2:1719069/127‑1 (MQ=255) ttAAATACTATTCAAAAAATATATAAAATAGATTAATTA‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTaaa < 1:3015716/128‑1 (MQ=255) ttAAATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAata < 1:759340/128‑1 (MQ=255) cATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑AAAAA‑ATAT‑‑ATAAAATAAAATATTGTATAATAACAAGCTTATATATATTAAAAAAATTAtatatataa > 1:2906858/1‑127 (MQ=255) aTACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATTATATAATATCAACATTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATAtact > 2:2218841/1‑128 (MQ=39) aCGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGTTATAATAGCAACAGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATAtactac > 2:532265/1‑128 (MQ=255) aCGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAataagtagtatattt < 2:3139012/128‑13 (MQ=255) ctattaaaataatatatAAAATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATactact < 1:1777815/117‑1 (MQ=39) cGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑AATAA‑ATAT‑‑TTAAATTAATATTTTATATAATAAAAAAATTATATAAATAAAAAAAATATAAtatataaaaaa > 1:1664213/1‑123 (MQ=255) cGATTCAAAACATATATAAAATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATactact < 1:146999/128‑1 (MQ=255) tCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTAA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATGTTATAATATAAACAGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTAattatt > 2:671953/1‑128 (MQ=38) atatatAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑TATCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGTTATAATAGCAACATTTTATAAAGAAAAAAAATATTAAATATACTACTTATTTaataat > 2:1102550/1‑128 (MQ=255) atatatAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGAAACCTTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATATAATAATTATTTACtaat > 2:1871430/1‑128 (MQ=39) atatatAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATAAA‑A‑‑AA‑ATAT‑‑ATAAAAAAAAAAATTTTATAATATAAAAAGTTTATAAATAAAAAAAATATAAAAtataataataatataataataa > 2:1742689/1‑128 (MQ=255) tatataACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑GTAAATAAAAATATGTTATAAAAGCAACAATTTATAAATTAAAAAAATAGTAAATATAATACTTATTTaat > 1:562613/1‑126 (MQ=25) tatataACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATTTTATAATATCAACCTTTTATAAATTAAAAAAATAGTAAATATAAAACTTATTTAAaaata > 1:2859186/1‑128 (MQ=37) tatataAAATACATTCTT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACtaata < 2:286082/128‑1 (MQ=255) atataACATATATTCAT‑‑‑‑AATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACtaataa < 1:1843243/128‑1 (MQ=255) atataACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATTAAAATATGGTATAATAGCCACAGTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATATACTAATTATTtaataataa > 1:913368/1‑128 (MQ=39) atataAAATAAATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACtaataa < 1:2531711/128‑1 (MQ=255) tataACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTAA‑ATAT‑‑TTAAATGAAAATATGGTATAATATCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATATAAGAATTATTTTCT‑ATaaaa > 1:2011985/1‑128 (MQ=37) ataACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATaaaa > 2:61786/1‑128 (MQ=255) ataACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGAA‑ATAT‑‑TTAAATTAAAATATTGTATAATAGCAACCGTTTATAAATTAAAAAAATATTAAATATTCTACTTATTTAATAATaaaa > 1:1246551/1‑128 (MQ=38) aaCATACATTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATTAAAATATGTTATAATAGCAACATTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATAATACTTATTTACTAATAAAAtata > 2:234853/1‑128 (MQ=255) acatacatTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATTCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATACTGTATAATAGCAACCTTTTATAAAGTAAAAAAATAGAAAATATAATACTTATTAACTAATAAAATCt > 2:2085370/1‑128 (MQ=38) atacatTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATATCAACCGTTTATAAATTAAAAAAATAGTATATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTAt > 2:1327886/1‑128 (MQ=255) atacatTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACAGTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATATAATACTTATTTACTAATAAAATATAttt > 1:1523268/1‑128 (MQ=255) tacatTCAT‑‑‑‑AATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTAtt < 1:2820185/128‑1 (MQ=255) tacatTCAT‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATTGTATAATATCAACATTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATATAATAATTATTTAATAAAAAAATATAtttt > 2:858570/1‑128 (MQ=255) cattcat‑‑‑‑tATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATTAAAATATTGTATAATAGCAACATTTTATAAAATAAAAAAATATTAAATATAATAATTATTTACTAAAAAAATATAtttt > 2:1985882/1‑128 (MQ=37) ttcat‑‑‑‑tATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAATATATTTTATAATAGAAACATTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTAATTATTTACTAATAAAATCTATTttta > 2:1422726/1‑128 (MQ=38) tcat‑‑‑‑tATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTtttat < 2:2610591/128‑1 (MQ=255) | TGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCAT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑ATGCA‑ATAT‑‑GTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311021‑311275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |