| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 34945 | 417 (0.520) | 275 (0.310) +AAA |
83/214 | 21.2 | 37.8% | intergenic (+49/+117) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH |
| ? | CP016816 | 34946 = | 452 (0.500) | intergenic (+50/+116) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
TTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/34819‑34945‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34946‑35072 |||| TTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAATAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAATATG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTTGTTTTTTTATTTACTATTG‑AA > 2:1258815/1‑128 TTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTTGGATTTTTTATTTACTATTG‑AA > 2:425757/1‑128 TCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATTAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTT‑AAAAAAA > 2:1328843/1‑128 CTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTATGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAA > 2:1128606/1‑128 TTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAATTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTGGTTTATTTATTTACTATTT‑AAAAAAAAA > 1:367513/1‑128 TTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAA > 2:1902086/1‑128 TTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGATGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATTAATAATAAAAGATTAAAACAAATACATAGTGTTTTGTATTTTTATATAATAATA‑AAAAAAAAA > 2:1296728/1‑128 ATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAA > 2:601727/1‑128 TGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAA > 2:764636/1‑128 AGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAATTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:551276/1‑128 AGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:1809530/1‑128 AGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATAAATTGTGTTTGTTTTTTTTATTTACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAA > 2:808256/1‑128 CAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAat > 2:1585676/1‑126 CAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATAAATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAtaaa > 1:1237586/1‑124 CAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAAACAAATACATTGTTTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAtaat > 1:1040229/1‑124 CAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTTTTTTTTTTATTTACTAATT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAaa > 1:1054884/1‑126 CAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑ATAAAAAAAAAAAAAA‑Ataaaat > 1:1636123/1‑122 CAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTATTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAATAATAAa > 1:507417/1‑127 AAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAtaaataaa > 1:1587328/1‑120 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGAATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑AATATA > 1:1670439/1‑128 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑Ataaaaaaa > 1:1773228/1‑120 AGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAaataaaaatt > 1:1548190/1‑118 GAGTAATAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATTGTTTTTGGTTTTTTTATTTACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAataaaattaaa > 1:1824464/1‑117 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATTAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTTTTTTGTTTTTTTATTTAATAAT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATAAAATTataa > 2:328503/1‑124 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTTTTTGATTTTTTTATTTAATATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAATAAAAATTta > 2:1340282/1‑126 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAaaattttcaa > 2:291886/1‑118 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑AATATAATaaaaagaaa > 1:623945/1‑119 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑‑AATATAATTTACAaaaat > 1:1719592/1‑123 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAATTAGCAaaat > 1:1983866/1‑124 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAA‑TTGCATAaaa > 2:970406/1‑125 AAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAAAAATTTtaaaaaa > 1:1620732/1‑121 AAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑‑AATATAATTatcaaaataa > 1:1737397/1‑118 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTGAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAATTaaaaaaata > 1:1882595/1‑119 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAATTTGCATACTATA > 1:1477549/1‑128 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATAAATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTaaaaaatata > 1:730567/1‑118 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAACACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑AATATAATTTGAATAATATA > 1:229798/1‑128 ATGATGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑AAGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑‑AATATAATTTaaataaaataa > 2:1446328/1‑117 TGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAATTTtaataaaataa > 2:1961945/1‑117 TGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAAACAAATACAATTTGTTTTGTTTTTTTAATTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAATAATTTAAATACaaaa > 1:351750/1‑124 GAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATAATTTAAATAATAAAAAAAA > 2:861172/1‑128 AACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATAAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTAATTTAAAATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑AA‑AAAATTTAAATAATATAAAAAATT > 2:1853247/1‑128 CCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATACTATAAAAAATTt > 2:1022162/1‑127 CCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTACATACTTTAAAAAATTt > 1:885195/1‑127 CAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAT‑ATATATTTTATAAAATAAAAAAAATTtt > 2:1678278/1‑126 AAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AA‑AATAAAATTTTAATAAAAAAAAAAATTtta > 2:918366/1‑125 AGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTACAAACTATAAAAAATTTTTT > 2:1725390/1‑128 GTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑‑AATATAATTTTAATA‑AATAAAAAAATTTTTTTa > 1:1923744/1‑127 GTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATTTAATTTGAATATAATAAAAAATTTTTTT > 2:478510/1‑128 TACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑A‑‑AATATAATTTAAAAAATATAAAAAAataatataa > 1:330114/1‑119 CTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAATAATTTAAATAAAATAAAAAATTTTTTTTAAAATA > 1:98788/1‑128 CTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑ATTAAAAAATTTTGCATAATATAAAAAATATTTTTTAAAATAA > 1:1868905/1‑128 TAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑TAAAATA‑AATTT‑CAAAAAATAAAAAATTTTTTTTAAAATAAtt > 1:585148/1‑126 AAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATAGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTTAATACAATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCA > 2:1011460/1‑128 ttattAATAATAAAATATTAAACAAAATACATTGTTTTTGGTTTTTTTATTTAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAG < 2:1548190/123‑1 ttAATAATAAAAGATTAAACAAATTTAATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAA < 2:1497025/126‑1 ATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTTCAAACTATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTCATTATTAAATT > 1:1104313/1‑128 ATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTAAATAATAAAAAAAATTTTTTTTCAAAAAATTATTAATGATTAAATT > 1:1513316/1‑128 AAATATTAAAAAAAATAAATTTTGTTTGGTTTTTTTATTTAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAA < 2:1771756/128‑1 AAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATTTAATTTTAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTTTTAATGTTTAAATTTAAAA > 1:1257182/1‑128 AAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAATATATTTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAATTATTAAATTTAAAA > 2:105032/1‑128 TAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTTCTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAAGTATTAAATTTAAAAAAaaaaa > 2:1113369/1‑123 AAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTAAAAAAAATTATTAAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGA > 1:1596196/1‑128 aaaaaaatttttTTTGTTTTTTTTATTTAAAAATT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGATTTA < 2:392843/116‑1 AAATACTTTGTGTTTGTTTTTTTTATTTAAT‑TTT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTAT < 2:1983866/128‑1 AAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTTTTTTACAAATAAGTATAAATGATTAAATTTAAAAAACAAAaattaat > 2:773561/1‑121 AAATAATTTGTGTTTGGTTTTTTTATTTAAT‑TTT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTAT < 1:1128606/128‑1 AAATAAATTTTTTTTTTTTTTTTTATTTAAAATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTA < 1:1113457/128‑1 tATACATTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTA‑TATTT‑TTAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATA < 1:389079/127‑1 aaaaaATTTTGTTTTGTTTTTTTATTTAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATA < 2:687598/123‑1 aaaaaATTTTGTTTGGTTTTTTTATTTTATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATA < 1:1293028/123‑1 AATAAATTTTGTTTGGTTTTTTTATTTAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATA < 1:67624/128‑1 ATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAATATAAAAAATTGTTTTTCAAATAATTATTCATTATTAAATTTAAAAAACCAAAAGTTAAAA > 2:152926/1‑128 atttttttttttTTTTTTTATTTAATATTT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTTCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAAT < 1:290991/116‑1 ATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTAAAAATAATTATTCAGTAGTAAATATAAAAAACAAAGAGTTATAAATCT > 2:544167/1‑128 TTGTTTTTTTTTTTTTAATTAAAATTTA‑AAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGATTTATAACTCT < 2:1620732/128‑1 GTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAATATAAAAAATTTTTTTTCAAATAAGTATTAAGGATTAAATTTAAAAAACAAATATTTATAAATATTtt > 2:253282/1‑126 tttGTTTTTTTATTTA‑TAATT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATACTATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCACGAGTTATAACTCTTGGTTTT < 2:1423725/125‑1 TTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGAATAGTTTAAAAAATTTTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACAAAGAGTTATTAAAATTTGTTTT > 2:359562/1‑128 TTTTTTTAATTTAAATTT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGGTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTG < 2:624790/128‑1 TTTTTATTAAATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTT < 1:857551/128‑1 TTTTATTTAAT‑TTT‑TAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTA < 1:1022162/128‑1 atttaaattttAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATATGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATT < 1:1961945/117‑1 atatttaaaAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTA < 2:1802895/119‑1 ttataatttAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTAT < 1:462319/119‑1 taattatttAAAAAAAAAAAATAA‑TATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTAT < 2:557854/119‑1 ttaatatttAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATT < 1:764636/119‑1 taatatttAAAAAAAAAAAATAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATT < 2:639494/120‑1 CTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATTTAATTTGCATAATTAAAAAAATTGTTTTTAAAATAATTATTAAGGATTAAATTAAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAT > 2:1269262/1‑128 tatatttAAAAATAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTA < 1:1379292/121‑1 ttttatAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATATTATAAAAATTTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGTAGTAATTTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAT < 1:40511/122‑1 aatatttAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAT < 2:1161060/121‑1 aatatttAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTAT < 2:1950969/121‑1 tattgAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAATTATTCAGTAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTTTTATTT > 2:503781/6‑128 ttgAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATAATATAAAAAATTTTTTTTCAAATAATTATTCAGGATTAAATTTAAAAAACAAAGATTTTTAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTtt > 1:916414/4‑126 tAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTC < 1:947172/127‑1 tAAAAAAAAAAAAAA‑TATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCT < 2:1205563/127‑1 AAAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCT < 2:384323/128‑1 AAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATATTTTGCATTCTATAATAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT < 1:1211599/128‑1 AAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT < 2:855435/128‑1 AAAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT < 1:1330423/128‑1 |||| TTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTG‑ATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTTACTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/34819‑34945‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34946‑35072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |