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AAGT‑TGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAAT < 2:1111013/128‑1 AGT‑TGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTTTACAGTTATTATTAATTTTTATTATACATCATTATGTTGGATAATATATATAAATT > 2:1842523/1‑128 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTA‑GTT‑C‑C‑‑A‑AAAAAAAAAA‑AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a‑aaaaaaaaaa‑aaGT‑TGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |