| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 165253 = | 2161 (0.690) | 411 (0.150) | 114/218 | 34.9 | 18.5% | intergenic (+217/‑325) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | = 165249 | 1733 (0.630) | intergenic (+213/‑329) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 855 total aligned reads displayed.
ATTTTATGTTTTATTTAAGTTTTAATTAACA‑TTAAATAATTTTAGTATTACTTTTAACAATATTTTTTCCTTTCTATTTTTTTAGATACTTAGACAACAAAATACCTAAAATTTATATTTCCATTA‑T‑‑AA‑AAAA‑AAAAAA‑AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/165395‑165253‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aa‑aaaa‑aaaaaa‑aaaaGC‑T‑AT‑TT‑TTTA‑CAAGTTCAAATTAATTCTTTTAAAATTTGCATATACAAAAAATATCTAAAAAGATAATAGTTTTAGTTTCTTACTAATTCATACAAGTGCGATAAATTAATGAAACTAAATATTAT < CP016816/165249‑165123 ATTTTATGTTTTATTTAAGTTTTAATTAACA‑TTAAATAATTTTAGTATTACTTTTAACAATATTTTTTCCTTTCTATTTTTTTAGATACTTAGACAACAAAATACCTAAAATTTATATTTCCATTA‑T‑‑A > 2:829975/1‑128 TTTTATGTTTTATTTAAGTTTTAATTAACA‑TTAAATAATTTTAGTATTACTTTTAACAATATTTTTTCATTTCTATTTTTTTATATACTTAGACAACAAAATACCTAAAATTTATATTTCCATTA‑T‑‑AA > 1:3518990/1‑128 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |