| Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGCCG > NC_000913/213192‑213491 | gATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGaa < 1:82695/151‑1 (MQ=255) cTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGGAgtg > 2:412151/1‑149 (MQ=255) cTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGGCGGGGAGGGGACAGCtt > 1:1933922/1‑151 (MQ=255) 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tCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGc < 2:580390/149‑1 (MQ=255) tCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCt < 2:334841/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTa < 1:1067546/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAg < 2:1168809/151‑1 (MQ=255) ccGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGAGTACAGCTTAATGCGGGGGGCGATATTTGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGGCAGC‑GGGCGTTTTAAAGCGGCAGGGATTG‑TGCGTATTGTTGGGCGGAACGGCGGGCGGAAACTaaa > 2:759238/1‑149 (MQ=255) gCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGaaa < 1:248621/151‑1 (MQ=255) gCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGaaa < 1:1195824/151‑1 (MQ=255) aaTTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTg < 1:1677586/151‑1 (MQ=255) aCCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCaa < 2:865587/151‑1 (MQ=255) ccGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCa > 1:840001/1‑149 (MQ=255) cggc‑ggGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTgg > 2:1011382/1‑146 (MQ=255) gc‑ggGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGc < 1:647612/151‑1 (MQ=255) gggCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTgg > 1:71295/1‑151 (MQ=255) cTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCg > 1:93101/1‑151 (MQ=255) gggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGt < 2:1021500/150‑1 (MQ=255) gggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTg > 1:684096/1‑151 (MQ=255) ggAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTgc < 1:1670609/151‑1 (MQ=255) | GATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAATCCGTCACCGGGCAAAGCGAAAACATTGTGCCGTGGCAGACGTGGCTTCAACCGCTGGAATTACCGGC‑GGGGCTGGGAAGTGTACAGCTTAATGCGGGAGGCGATATTCGCCCTCCGCGTGCAGACGAAGC‑GGTCAGC‑GTGCGTTTCAAAGCGCCA‑GGATTGCTGCATATTGTCGGGCGTAACGGCGGACGTAAGCTAAAGAAAATCTGGCAAGAGCTGGGCGTGCCG > NC_000913/213192‑213491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |