| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,111,747 | 0 | G | T | 45.9% | 78.3 / 33.4 | 61 | N156K (AAC→AAA) | yiiQ | DUF1454 family putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/9); new base T (0/28); total (24/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.04e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCC > NC_000913/4111597‑4111892 | caAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACg‑tttg > 2:432625/1‑151 (MQ=255) aaaGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACg‑tttgt < 2:508271/151‑1 (MQ=255) ttgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑c < 2:491265/149‑1 (MQ=255) tgctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑cccc > 1:735993/1‑151 (MQ=255) gctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCccg < 1:543447/151‑1 (MQ=255) ttttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCccgcc < 1:768565/150‑1 (MQ=255) tttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGt > 1:569027/1‑151 (MQ=255) tGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGtt > 1:496674/1‑150 (MQ=255) cATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTtagt > 1:425982/1‑150 (MQ=255) aTTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTtagt > 2:580297/1‑149 (MQ=255) tttATTCAACCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGTTTCAACAGCGAAGGTCACCCCCTTTT‑CGCCTTTGTCCGCGACAACATACCGCAGTGCACCTTCTGTCTGGGTGTAATAACT‑TTTGTTTTC‑CCCCGCCGTtagtag < 1:120946/150‑1 (MQ=255) ttCAACCCTTCAAGCGATTCAGATAGCCCCAGCTAAATCGGTTCAACAGCGAGGGTCCCCCCTTTTC‑CGCCGTTGTCCGCAAAAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCg < 1:769248/148‑1 (MQ=255) aaaCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGc > 1:728622/1‑150 (MQ=255) aaaCCTACAAGCGATTCAGAGAGCGCCAGTTTAATCGGTCCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGAAAACAAAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCa < 2:230553/151‑1 (MQ=255) aaCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGc > 1:334410/1‑149 (MQ=255) ctccAAGCGATCCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACGGCGAAGGTCACCCCTTTTT‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCGGTGCCCTTTCTGTCTCGGTTTAATATCG‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt < 2:82210/147‑1 (MQ=255) aGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCt > 2:251724/1‑151 (MQ=255) atttCAGATGGCACCAGTTAAATCTCTGCAACAGCGAAGGCCGCCCCCTTTC‑CGCTGTTGTCCGGGAAAATATAACGCAGTGCGCTTTATGTATCGGTGTAAAATCT‑TTTGTTTTA‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGttt < 1:14856/141‑1 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGTTAAAGGGGTTAAACAGGGAGGGTAACCCCCTTTT‑CCCCTTTGTCCGCAAAAAAATACCGCTTTCCCCCTTGTGTCCCGGTGTAATACCT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc < 2:255716/149‑1 (MQ=255) aGATAGCGCCATTTTAATCGTTAAAACAGCGAAGGCCCCCCCTTTTG‑CCCTTTTCTCCGCCAAAACATACCGCAGTCCTCCTTCTGTCGGGGTTTAATATTT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt < 1:458492/151‑1 (MQ=255) aGATAGCGCCAGCTTAATCGTTCCAACAGCGAAGGTCACCCCCTTTC‑CGCCGTTGTCCGCGACAAAATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAATG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCttt < 1:263980/149‑1 (MQ=255) atggcgcCAGTTAAACCGGTTAAACAGCGAAGGCCACCCCTTTTT‑CGCCGTTTTCCGCAACAAAAAACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTTTAAT‑ACG‑TTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTgtgt < 2:702709/148‑1 (MQ=255) aTAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTgtgt > 1:680234/1‑151 (MQ=255) aGCACCAGCTTAACCGGTACAACAGGGAAGCCCGCCCCCTTTT‑CGCGGTTGCCCGCAACAAAATAGCGCATTGCGCCTTCTGTCGGGGTGAAATCTCT‑TTTTTTTTC‑CTCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt < 2:595572/147‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTAATCGGTTAAACAGCGAAGGCCACCCCCTTTC‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCGGGGTGTAATAACT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg < 2:590512/146‑1 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTg > 2:322116/1‑151 (MQ=255) cgttaaaaCAGCGAAGGACACCCCCTTTT‑CGCCGTGGCCCGCAACAACATAACGCAGTGCCCCTTTTGTCTGGGTTTAATAATG‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATg < 1:342508/143‑1 (MQ=255) cGGTACAACAGCG‑AGGCCCCCCCCTTTTGCGCCTTTGTCCGCGAAAACATAACGCAGTCCCCCTTCTGTCGCGGTTTAATAGTT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgg < 1:732325/150‑1 (MQ=255) ggTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgggg > 1:595059/1‑151 (MQ=255) ggTCCAACAGGGAAGGCCACCCCCTTTC‑CGCCGTTGCCCGCAAAAACATAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTTTAATAATG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATgg < 2:343349/149‑1 (MQ=255) aaaaGCGAAGGTCACCCCCTTTT‑CTCTTTTTTCCGCGACAACAAAACGCAGTGCCCTTTCTTTCTGGGTTTATTACTG‑TTTTTTTTT‑CTCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAgt < 1:319425/148‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAGGTCCCCCCCTTTC‑CGCCTTTGCCCGCAACAACATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTTTAATATCT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAgg < 2:153013/151‑2 (MQ=255) aCAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAgtg > 1:114976/1‑151 (MQ=255) aggccccccccTTTTCCGCGTTTGCCGGCGAAAACAAAGCGCGTTGCCCCTTTTGTCT‑GGTTAAAAAACGTTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCg < 2:547065/142‑1 (MQ=255) cacccccTTTC‑CTCCGTTGTCCCGAACAACAAACCGCGGTGCCCTTTTTGTTTCGTTTTAATAGCT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCa < 1:198232/146‑1 (MQ=255) ccctTTTG‑CGCGTTTGCCCGCGAAAACATACCGCGGTGCCCCTTTTGTCTCGTTGTAATAGTG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt < 1:113902/151‑1 (MQ=255) ccccTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt > 2:313794/1‑151 (MQ=255) ccccTTTC‑CGCCGTTGTCCGCAACAACATAACGCGTTGCCCCTTCTTTCGGGGTGTAATAACG‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt < 2:736067/151‑1 (MQ=255) cgccttggcccGCAAAAACATAACGCGGTCCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATATTT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTa < 1:314493/142‑1 (MQ=255) ttGCCCGCAAAAACAAACCGCATTCCACTTTTTGCCTGTGTTTAATACCT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGt < 2:194392/145‑1 (MQ=255) tGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTg > 1:766593/1‑151 (MQ=255) gTCCGCAAAAACATAACGCGGTGCACCTTCTGTCTCGGTTTAATATCT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTg < 1:712936/150‑1 (MQ=255) tCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTg > 1:762023/1‑149 (MQ=255) ccGCGACAACATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAGCT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGa < 2:342440/149‑1 (MQ=255) acaacaTACCGCTGTCCACCTTCTGTCTCGGTGTAATATTT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttc < 2:139038/150‑1 (MQ=255) acaacaTAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcg > 1:455023/1‑151 (MQ=255) caTAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgcttt > 1:761433/1‑151 (MQ=255) tAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGctttcgctttcg > 2:348269/1‑151 (MQ=255) cGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCgg > 1:511605/1‑151 (MQ=255) gagttgccctttCTGTCTGGTTGTATTTCGG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTcgcg < 1:498200/139‑1 (MQ=255) gCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGc > 2:169552/1‑151 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCtttt > 2:250125/1‑151 (MQ=255) cACCTTCTGTCTCGTTGTAATACCT‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTg < 1:63139/151‑1 (MQ=255) cctttCTGTCTGTGTTTAATATTG‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttttt < 1:395699/146‑1 (MQ=255) cTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc > 2:479532/1‑151 (MQ=255) tctgtctgGGTGTAATATCT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 2:558546/150‑1 (MQ=255) ctcGGTATAAAATTG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcc < 2:27968/149‑1 (MQ=255) cGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg > 1:156766/1‑151 (MQ=255) taataaCG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATgg > 1:122987/1‑151 (MQ=255) aatatCG‑GTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTGGCTCTGGCCCCTGGAt < 1:489718/148‑1 (MQ=255) aataaCT‑TTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGAt < 2:728696/148‑1 (MQ=255) atatCG‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGAt < 2:687906/147‑1 (MQ=255) aaCT‑TTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa < 2:115008/144‑1 (MQ=255) ttttttttT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGcc < 2:458864/149‑1 (MQ=255) ttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTa < 1:545774/146‑1 (MQ=255) | CAAAGGCTTTGCTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACG‑TTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGCC > NC_000913/4111597‑4111892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |