| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,162,120 | 0 | T | G | 40.5% | 119.4 / 14.0 | 74 | G219G (GGT→GGG) | iceT | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/34); new base G (28/2); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTTTCGCTGGGCCTGGC > NC_000913/2161971‑2162266 | aaCATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTa < 2:1361587/151‑1 (MQ=255) tCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAgg < 1:101946/150‑1 (MQ=255) ggTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGgtt > 2:486791/1‑150 (MQ=255) ggggATTATCGGTGCGGTCGCCGCATTGCTGTTAATGGCGAACTACACCATGCAGAGGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCTTGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGACAGTAAAGGTACAGGTTTATcg < 1:921019/151‑1 (MQ=255) ggggATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTTAACCTGGCGCT‑GG‑ACGGGAGGAAAGGGACAGGGTTAt > 2:1286227/1‑149 (MQ=255) gggATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCCGGGGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGgtt > 2:392321/1‑146 (MQ=255) gATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCT‑GG‑GAGGCAGTAAAGGGACAGGGTTATcgcc > 1:720598/1‑150 (MQ=255) ttATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑GACGCAGTAAAGGGACAGGGTTTTcg > 2:1355429/1‑146 (MQ=255) aTCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTg < 2:304863/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCC‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGTTTTTcgcccccg > 2:846444/1‑146 (MQ=255) cGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCCTGGCGGTATTAACCCTGGCGGT‑GG‑ACGGGAGGAAAGGGACAGGGTTCTtgccg > 2:1159739/1‑145 (MQ=255) gCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAAGGACAGGGTTATCGCCGCTGACGAtt > 2:657185/1‑150 (MQ=255) gATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCa < 1:410875/151‑1 (MQ=255) aTCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGGGCT‑GG‑ACGGCCGTAAAGGGACAGGGTTATTGCCGCTGACGAtttctg > 1:941939/1‑147 (MQ=255) aTCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCCGGGGGT‑GG‑ACGGCAGTAAAAGGACAGGGTTTTtgccgcatacggtt > 2:869953/1‑139 (MQ=255) cGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAAACCTGGCGCT‑GG‑GCGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAgg > 2:1293048/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCt < 2:702198/151‑1 (MQ=255) cacaTTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCCTGGCGGTATTAAACCCGGCGCT‑TG‑TCCGCAGTAAAAGGAAAGGTTTGTTGCCCCTTACgggtggcgggct > 2:1147280/1‑139 (MQ=255) cacaTTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑GCGGGCGGAAAGGGACAGGGTTATCGCCGCTTGCGGTTGTAGGcc > 2:677620/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGAAAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTgg > 2:457327/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCCTGGCGGTATTTACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGGAAAGGTAAAGGTTTTTCGGCGCTTACGATTTGCGGCCTGGGCg > 1:132400/1‑150 (MQ=255) tGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTGTTAACCCTGGCGCTGGG‑ACGG‑AATAAAGGGACAAGGTTATAGCCGCTGTCGATTTCAGGGCTGGgcgccg > 2:641472/1‑148 (MQ=255) aaTGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTgg < 2:695071/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAAGTTCTCCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCATTTGGc < 1:914530/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGCACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCgtg < 1:995866/151‑1 (MQ=255) ccGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCgtgg < 2:298249/151‑1 (MQ=255) gAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTTGCATGGCGGAATTAAACCTTGGGCT‑GG‑GCGGTAGTGAAAGTGCAGGGTTATTGCCGCTGAAGATTGCAGGCCTGGGGGCAGTTgg > 2:906793/1‑144 (MQ=255) gAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCgtggtg < 2:344867/151‑1 (MQ=255) aaCTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTa < 2:56096/108‑1 (MQ=255) aaCTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCT‑GG‑GAGGGAGTAAAGGGACAGGgtt > 1:56088/1‑107 (MQ=255) aCTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCCTGGCGGGCTTTAACCTTGGGCC‑GG‑GCGGCAGTAAAAGGACAGGGTTTTCGCCGCTGACGGTTGCCGGCCCGGTCGCCGTTGGCggg > 1:378657/1‑144 (MQ=255) cTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCAAGGCGGTATTAAACCCGGCGCT‑GGCGGGGCCGTAAAGCGA‑AGGTGTTTCGCCGATTGCGATTGTAAGCCTGGTCGGCGTTGGCGtggtgg > 1:1286953/1‑149 (MQ=255) acacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCa < 1:312804/149‑1 (MQ=255) cgccATGCAGACGTGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTAGTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGTCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGctc < 1:1201089/147‑3 (MQ=255) cacCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAAACCTGGCGCT‑GG‑GCGGCAGTAAAAGGACAGGGTTATTGCCCCTGACGATTGCAGGGCCGGGCGCAGGTGGCGgggtgg > 2:634010/1‑146 (MQ=255) tGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGc < 1:613151/150‑1 (MQ=255) aGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTa < 2:732408/151‑1 (MQ=255) gACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGGGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGGTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGGCGCAGGTGGGGGGGGGGGACTGGGGCttt > 2:887340/1‑149 (MQ=255) cgcgGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATct < 1:1019740/151‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATc < 1:1157391/150‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGGTTTTCGCCGGTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGGGCTTTTTct > 1:1306845/1‑150 (MQ=255) ttGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCAc < 1:486643/149‑1 (MQ=255) ttGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACg < 2:40696/150‑1 (MQ=255) ttGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGGCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGGGCTTTAt > 2:797863/1‑140 (MQ=255) tGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAGCCCTCACGCT‑TG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTGTCGCCGCTGACTATTGCAGGCCTAGTCGCAGTTGGCGTGGTGTCAGTGGTGCTTTATCTGCTGCACga < 1:191308/150‑2 (MQ=255) tGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTTACCCTGGCGGT‑GG‑ACGGGAGTAAAGGGACAGGTTTATCGACGCTGACGATTGCAGGCCTTGTCGCAGTTGGGGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGcc > 1:332306/1‑151 (MQ=255) gATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTTCAGGCCTGGGCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGcc > 2:501252/1‑150 (MQ=255) ctcCGGCTTTTTATTGCTGGCGGTTGGCCTGGCGGTATTAACCCCGGCGCT‑GG‑GAGGCCGTAAAGGGACCGGGTTATCGCCGCTGACGGTTGCCGGCCTGGGCGCAGTTGGCGGGGGGGCACTGGGGCTTTTTCTGCTGCACGCCCGaaa > 1:703958/1‑150 (MQ=255) ctcCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCa < 2:1152011/146‑1 (MQ=255) ctcCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGaa < 2:433732/149‑1 (MQ=255) ggATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATaaca < 2:718856/151‑1 (MQ=255) gATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCCGGGGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGGTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGGGGCACTGGGGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATaaca > 2:1266824/1‑150 (MQ=255) ttttATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTTAACCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCAATGGGGCTTTTTCTGCTGCACGCCAGAAATaaaaaac > 2:302411/1‑148 (MQ=255) ttttATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGGATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGGTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGGCTGGTCGCAGTTTGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACCCCCGAAATAAAAAcc > 2:33151/1‑150 (MQ=255) ttATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGGGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGGACAGGGTTTTCGCCGCTGACGATTGCAGGGCTGGGCGCCGGTGGCCGGGGGGCACTGGTGCTTTTTCTTCTTCACCCCCGAAATAACAAACGt > 2:379461/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGc < 1:1291200/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGGCGCAGTTGGCGGGGGGGCACTGGGGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGtt > 2:780515/1‑151 (MQ=255) gCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCCGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGGGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGGGCCCTg > 1:365064/1‑147 (MQ=255) gTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGt < 2:1033741/150‑1 (MQ=255) gTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTc < 1:1062187/151‑1 (MQ=255) gCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACt < 2:1031209/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTc < 1:1285371/151‑1 (MQ=255) ccTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGt > 2:878761/1‑151 (MQ=255) ccTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGt < 2:11669/151‑1 (MQ=255) cTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGATGGCGTGGGGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCAAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTc > 1:200368/1‑148 (MQ=255) ggCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTa < 1:119370/149‑1 (MQ=255) cgcT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCtt > 1:1259435/1‑151 (MQ=255) t‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTTTc > 1:610027/1‑151 (MQ=255) aaggCAGTCAAGGTTCTGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGGCGCAGTTGGCGTGGGGGCACTGGTGCTTTCTCTGCTGCACGTCCGTAATAAATACCGTGCCATCTTCCGTCACGAACTGGTCCGTACTCGTACCTTTTctct > 1:696891/3‑151 (MQ=255) ggCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTTTCGCTgg < 2:1391945/151‑1 (MQ=255) tAAAGGGACAGGTTTATAGCCACTGGCGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCTCTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAATTAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTAACTTTTCGCTGGGcca < 1:179285/150‑2 (MQ=255) aaaGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTTTCGCTGGGCCTg < 2:880511/150‑1 (MQ=255) aaGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTGTCGCTGGGCCTGGc < 1:2255/151‑1 (MQ=255) gTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGCGTCCCTGGTGTTTTATCTGCTTCACGCCAGAAATCACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTGCCTTTTCGATGGGGCTg < 1:340300/146‑1 (MQ=255) | AACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGCTTTGATCTCTCCGGATTTTTATTGCTGGCGGTTGGCATGGCGGTATTAACCCTGGCGCT‑GG‑ACGGCAGTAAAGGTACAGGTTTATCGCCGCTGACGATTGCAGGCCTGGTCGCAGTTGGCGTGGTGGCACTGGTGCTTTATCTGCTGCACGCCAGAAATAACAACCGTGCCCTGTTCAGTCTGAAACTGTTCCGTACTCGTACCTTTTCGCTGGGCCTGGC > NC_000913/2161971‑2162266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |