| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,001,911 | 0 | G | A | 40.3% | 93.1 / 37.7 | 77 | intergenic (‑122/+199) | fliA/fliC | RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor/flagellar filament structural protein (flagellin) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/8); new base A (0/31); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.31e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGC > NC_000913/2001763‑2002054 | acCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGa > 2:218859/1‑150 (MQ=255)acCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTAGCGGCATGATTATCCGTTGCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGCGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑ATGCAGaa < 1:772474/151‑1 (MQ=255) cAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGaaaaaa < 1:491416/150‑1 (MQ=255) gCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑c > 2:158859/1‑150 (MQ=255) ggTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑cccc > 2:1144799/1‑151 (MQ=255) ataGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCccgcc > 2:1155231/1‑151 (MQ=255) ataGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCccgc < 1:1059090/150‑1 (MQ=255) aaTTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCgg > 1:544615/1‑151 (MQ=255) aTTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCggg > 2:1083861/1‑151 (MQ=255) ttCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCgggg > 1:1002465/1‑151 (MQ=255) cACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGGTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGa > 1:831640/1‑150 (MQ=255) gaaaaaCGGCCCTGTTTTATAGGATTTATGGGAATGTTTATCCTTTTCTGCGGGGTTTTTAATCGGAGGTTAGGGGGGTGAAATGAGGGTTTTTTTGGGGT‑TT‑A‑AG‑GATAAATT‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGc < 1:490696/147‑1 (MQ=255) aaaaaGAGCCCGGTGTTATATGATTAAGCGATATTTTTACCCTTTTCGGGGCGTTTTTTAACCGGACTTTTAGTGGGTGAAATGAGGGGTAGTGGGGGGG‑TG‑A‑CA‑GCTAAATT‑CA‑AGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCAc < 2:42956/149‑1 (MQ=255) aaaCAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGt > 1:159396/1‑151 (MQ=255) cccTGCTTTATAGGATTTATGGGAATATTTATCCTTTTCTGCGGGTTTTTAAATCGGACGATTGGTGGGTAAAAGGGGGGGTTTTTTGGGGG‑TA‑A‑CA‑GAAAATTC‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGc < 1:79841/148‑1 (MQ=255) atatGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTgcg > 2:675943/1‑151 (MQ=255) atGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCt > 2:159639/1‑151 (MQ=255) tgttttACCGGCATGATTGTCCGTTTCGGCAGGTTTTTTAAGCGGACATTTGGTGGGT‑AAAAGGGGGGTTATTTGGGGG‑GT‑T‑CAGGGAAAATT‑CC‑AGGAAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTg < 2:287932/142‑1 (MQ=255) ttATGGGCTTGATTTCCCTTTTCTGCGGGGTTTTTAACCGGACGTTGAGGGGGTAAAATGGGGGTTTATTGGGGGT‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑GGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTAt < 2:695177/150‑1 (MQ=255) tATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGt > 2:754276/1‑151 (MQ=255) tATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCAAGTTGCTGACAAATTGCGCTTTAt > 1:315964/1‑149 (MQ=255) ggaaTGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGTTTAGTGGGTAAAATGAGGGTTTATTGGGGGT‑TT‑A‑AA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGATTTATGTTg < 2:453514/146‑1 (MQ=255) ggCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGcc > 1:416816/1‑151 (MQ=255) gCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGGGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACACATTGCGCTTTATGTTGcc > 1:693116/1‑150 (MQ=255) cATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCgg > 2:212574/1‑151 (MQ=255) ttATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATgcg > 2:677616/1‑151 (MQ=255) ttATCCGTTTCGGCAGGTTTTTTAATCGGAGGATTAGTGGGTGAAATGAGGGTTTATTGGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGAt < 2:254413/148‑1 (MQ=255) aTCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATgcggc > 1:1185665/1‑151 (MQ=255) aTCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATgcggc > 1:251858/1‑151 (MQ=255) tttCGGCTGGTTTTTTAATCGGACGATTAGGGGGTGAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGT‑TT‑A‑CA‑GGAAAATC‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATgcggc < 1:687240/146‑1 (MQ=255) gcgggttttttAATAGGACGATTGGTGGGAAAAAGGAGGGGTTTTTGGGGGT‑TT‑A‑CA‑GATAATTC‑CC‑AGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGcc < 2:415052/144‑1 (MQ=255) gcggggTTTTTAATCGGACGATTAGGGGGTGAAAGGAGGGTTTATTGGGGGT‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGAAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCt < 2:307954/148‑1 (MQ=255) ggttttttAATCGGAGATTTGGGGGGTGAAAGGAGGGTTTATTAGTGGG‑TA‑A‑AA‑GTTAAATT‑CA‑AACAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt < 2:11924/148‑1 (MQ=255) ggttttttAATCGGACGTTTAGTGGGTGAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGG‑TT‑A‑‑A‑GGGAAATTCCC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAAc < 1:1143985/141‑1 (MQ=255) ttttAATCGGACGATTAGTGGGTAAAAGGAGGGTTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGAAAATT‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:754946/150‑1 (MQ=39) tttAATCGGACGTTTAGTGGGTAAAATGGGGGTTTATTTGGGGT‑TT‑A‑CA‑GGAAAATC‑CC‑AGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg < 2:320852/150‑1 (MQ=38) ttaaaTGGGATGATTAGGGGGAGAAATGGGGGTTTTTTTGGGGG‑TT‑A‑CG‑GATAAATC‑CC‑GGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg < 1:211727/147‑1 (MQ=37) aaTCGGACGATTGGTGGGTAAAATGAGGGTTTTTTTGGGGG‑TT‑A‑GA‑GGTAAATC‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTa < 1:104204/151‑1 (MQ=38) cGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACa > 1:585187/1‑150 (MQ=255) gACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaaa > 2:60106/1‑150 (MQ=255) gATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtg > 1:1087782/1‑151 (MQ=255) taggggggTAAAATGAGGGTTTTTTTGGGGG‑TT‑C‑CA‑‑GTAAATT‑CC‑AAGAAAAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACaa < 1:461889/139‑1 (MQ=25) tAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGc > 2:761135/1‑151 (MQ=255) 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gggaaaaaaggggggTTATTTGGGGT‑TT‑A‑GA‑GGAAAATC‑CC‑GGGAAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCaa < 2:1073020/138‑1 (MQ=37) gggTAAAAGGAGGGTTTTTTTGGGGG‑TC‑A‑AA‑GATAATTC‑CC‑AGGAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACa < 1:294512/138‑1 (MQ=25) tGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTc > 2:466099/1‑150 (MQ=255) aaagggggggTTTTTTGGGGG‑TA‑A‑GA‑GGAAAATC‑CC‑AGGAAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACTCCTTATCCGGCCTACaaaaa < 1:1011171/131‑1 (MQ=37) aaaTGAGGGTTTATTGGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGAAAATT‑CC‑AGGCAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCa < 2:98986/149‑1 (MQ=255) aaaTGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAAt > 2:260017/1‑151 (MQ=255) aaaTGAGGGGTT‑TTTGGGGG‑TTAA‑CA‑GAAAAATT‑CA‑AGGAAAAAAAACC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAAt < 2:302542/151‑1 (MQ=25) aaTGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAAt > 2:11501/1‑150 (MQ=255) aaTGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAAt > 1:475441/1‑150 (MQ=255) aTGAGGGGTTCTTGGGGGG‑TA‑A‑CA‑GAAAAATT‑CA‑ACAAAAAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCGCGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCa < 2:257763/147‑1 (MQ=25) 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ttgggggg‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTc < 2:1159033/147‑1 (MQ=255) tGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAAc > 1:897002/1‑151 (MQ=255) tgggg‑TT‑ATCA‑GGTAATTT‑CC‑AGGGAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCaa < 1:277866/149‑1 (MQ=255) ggggt‑TT‑A‑CA‑GGAAAATC‑CC‑GGGCAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTc < 2:975943/147‑1 (MQ=37) ggggg‑TT‑A‑CA‑GTAAAATC‑CC‑AGAAAAAAAAAAC‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAAc < 1:523914/150‑1 (MQ=37) 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ACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGG‑TT‑A‑CA‑GGTAAATT‑CC‑AGGCAGAAAAAAA‑CCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGC > NC_000913/2001763‑2002054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |