| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,228,275 | 0 | T | C | 50.7% | 53.2 / 82.4 | 67 | pseudogene (335/1287 nt) | mdtQ | pseudogene; putative channel/filament proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/17); new base C (10/24); total (26/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.04e-07 | |||||||||||
TCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTT > NC_000913/2228128‑2228415 | tctTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTTTCGCGTTTCGCCCCCCCGGC‑C‑TTTAACCGCCCCC‑CGG‑GGGCC‑GTAACCTcc > 2:480434/1‑150 (MQ=255) ctTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTGCTCGCGGTTCC‑CCCCCCCCG‑G‑TTTAAACGTACCC‑CGGCGGGGA‑GGAACcccc > 1:1085478/1‑149 (MQ=255) ttttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTGCTCCCGGTCCG‑CCGCCCCCG‑C‑TTTTACCCCACCC‑CGGCGGGGA‑GGAACcccccccc > 2:406211/1‑151 (MQ=255) ttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCg < 1:607729/150‑1 (MQ=255) ttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCg < 2:1278638/150‑1 (MQ=255) ttCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTCTCGCGTTCCG‑CCCCCCGGG‑CTTTTAACCG‑ACCC‑CGGCGGGCA‑GGAACCTcccccc > 1:685465/1‑149 (MQ=255) tCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTCTCGCGGTTCG‑CCCCCCGCG‑CTTTTAACCCAACCC‑AGGCGGGGG‑GAAACCCCCCCCCgt > 2:1242831/1‑150 (MQ=255) aTTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGAtt < 2:630909/149‑1 (MQ=255) aTTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGAt < 2:404564/148‑1 (MQ=255) ctgcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCCGCAATTGGCGGGGTTTGC‑CGCGGTTCC‑CCGCCCCCGCC‑TTTAACC‑TACCC‑CAGCGGGGAGGAAACCCCCCCCCGCTTCTTccc > 2:140088/1‑151 (MQ=255) gcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTcccc < 1:969332/150‑1 (MQ=255) aaGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTAAGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGCTTTTGCTCGTTTCG‑CCGCCCCCG‑C‑CTTTACCCGACCC‑CCGGGGGCA‑GTTACCCCAGCCCGATTCtttttcc > 2:628036/1‑144 (MQ=255) cGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCg < 2:226844/151‑1 (MQ=255) cGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTTTCCCGTTTCG‑CCCCCCCTG‑C‑TTTTACCCTACCC‑CGGGGGGGC‑GTAACCCCCCCCCCCTTTTTTTCCCACatat > 2:916588/1‑149 (MQ=255) gtgtTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCga < 2:374222/151‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGc < 1:1210028/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAg < 1:691275/151‑1 (MQ=255) cgccgcCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTCCCGCGTTCCC‑CCGCCCGCG‑G‑CTTTACCGCACCC‑CCGCGCGGC‑GTAAACCCCGCCCCCTTTTTTCCCCCGATATCGGGATGcc > 2:135789/1‑149 (MQ=255) ccgccTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTCTCGCGGTTCG‑CCGCCCCTG‑C‑TTTTACCGGACCC‑CGGCGGGGA‑GGAAACCCCCCCCGCTTTTTTTCCCCGATTTCGAGATGgccgcc > 2:405183/1‑151 (MQ=255) cgccTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGccc < 1:971808/151‑1 (MQ=255) cgccTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTGCTCGGGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTATCCGTACCC‑AGGCGGGGA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGccc < 1:1102931/151‑1 (MQ=255) cTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGGTTTCTCGCGGTCCG‑CCGCCCGGG‑C‑TTTTACCGTACCC‑AGGCGGGGA‑GTAACCCCCCCCCGATTCTTTTCCCCGATATCGAGATGCCAGcccccc > 1:952141/1‑151 (MQ=255) tGCCACTCCCAGTACAGGCGGGGTACGCTGCCAGCCAGCAATTTGC‑CGGTTTGCTCCCGCTCCC‑CCGCCCCGG‑C‑GTTTACACTGCCC‑CGGGGGGCA‑GGAACCCGCCCCCCCTTCTTTCTCCCCATATCGCGGTGCCACCccgccccgaag > 2:457709/1‑144 (MQ=255) cAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTTCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑CTTAACCCTACCC‑CGGCGGGCC‑GGAACCCCCCCCCCGCTCTTTTCCCAGATATTGCGATGGCACGCCCCCCTTAAGGCCAAAggaac > 2:426519/1‑143 (MQ=255) cAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAAACGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCCCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGGCAGCCCGCCGTTAAGCCCAAAGAACCGtt > 2:653400/1‑150 (MQ=255) gCGGGCTCCGCTGCCGGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTCCCG‑CCCCCCGTT‑C‑TTTACCCGTCCCC‑AGGCGGGCA‑GTACCCTCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGgtg < 2:11938/151‑1 (MQ=255) gCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCCCCCGCTTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGCTGGTGTAcc > 2:200727/1‑151 (MQ=255) tACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGAACCGTTGGTGTAc > 1:948955/1‑148 (MQ=255) ccctccccgccaccAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCTTCCCC‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTCCCC‑AGGGGGGCA‑GTCACCCCCGCCCGATTTTTCCCCCATATCTCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAcc < 2:170177/139‑1 (MQ=255) cGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGGTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAAACGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCCGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGGACCGTTGGTGTACCACgg > 1:58106/1‑151 (MQ=255) cGCTGCCACCCAGCAATGGGG‑GGGTTTGCTCGCTTCCCC‑CCGCCCGTT‑T‑TTTACCCGTCCCC‑AGGCGGGCA‑GTACCCCCCGCCCGTTTCTTCCCCCAGATTTCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCa < 2:808163/148‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGCG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCCCCCCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCCTTGGTGTACCACggg > 2:934896/1‑151 (MQ=255) cTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCC‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCCTAACC‑AGGCGGGCA‑GTAAACTCCGCCCGAATCTTTTCCCCGATATCCAGATGCCAGCCCGCCCTTAAGCCCAAAGTACCGTTGGTGTACCACcgg > 2:782351/1‑150 (MQ=255) ccagccagCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTACCCGTCCCC‑GGGCGGGCA‑GTACCCCCCGCCCTATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGcc < 1:344561/149‑1 (MQ=255) cggccgacAATTGGC‑GGTTTTCTTCGCGTTCC‑‑CCGGCCATGTC‑TTTAACCTTCCCC‑TGGAGTGCG‑ATTACTCCGGCTCGATTATCGCGCAATTTCTCGAGACGCAGGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCg < 2:911859/142‑1 (MQ=255) agcccccAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTCCCG‑CCGCCGGTG‑G‑TTTAACGGCACCC‑CGCCGGTAG‑GTACCACCCGCCGAATTCTTGCCCCAAATACGGAGATGCCCGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGc < 1:311383/140‑1 (MQ=255) caagcAATTGGC‑GGTTTTGCGCGCTTTCCC‑CCGCCCGTG‑C‑TTAACCCGTACCC‑GGGCGGGTA‑TTACCCCCCGCCCGTTTTTTTCCCCAGATATCGAGATCCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGc < 2:937582/142‑1 (MQ=255) tgggC‑GGTTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑T‑TTTACCCGTCCCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCCCCCCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGc < 1:128426/148‑1 (MQ=255) tGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCgg > 1:995675/1‑151 (MQ=255) ggC‑GGGTTGCCTCGGGTTCCC‑CGGCCGGTC‑C‑TTTACCCTTACCC‑AGGGGGGCG‑GTACCCCCCGCCGGTTTTTTCCCCCGGATACCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCg < 1:492526/149‑1 (MQ=255) gggggttttGCTCGCGTCCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTACCCGTCCCC‑GGGCGGGCA‑GTACCCCCCGCCCGTTTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCGGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCgg < 2:165186/144‑1 (MQ=255) gC‑GGGTTCGCCCGCGTCCCC‑CCGCCCGTG‑T‑TTTACCCGTCCCA‑GGGGGGGCA‑GTACCCCCCGCCCGTTTCTTTCCCCAGATAACGAGAGGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGcc < 2:989269/151‑1 (MQ=255) c‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCg > 2:711665/1‑151 (MQ=255) gggTTTGCCCGGTTCCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTACCCGTCCCC‑GGGCGGGCA‑GAACCCTCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCgg < 1:197255/151‑1 (MQ=255) gttttGCTCGCGTCCCC‑CCGCCCGTG‑T‑TTTACCCGTCCCA‑GGGCGGACA‑GAACCCCCCGCCCTTTTTTTCCCCCAGATATCGGGGTCCCACCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCgg < 2:191536/148‑1 (MQ=255) tttGCTCGCTTCCCG‑CCCCCCGTG‑T‑TTAACCCGTACCC‑GGGCGGGAA‑GTAACCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGAt < 1:753510/150‑1 (MQ=255) tttGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTATCCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGCGATGCCAGCCCGCCGTTATCCCAAAAGTACCGATGACGTCCCTCGCGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGa > 2:975839/1‑149 (MQ=255) cccgcgTCCCC‑CCGCCTTTC‑T‑TTTAACCGTCCCA‑GGGCGGGCA‑GCACCCTCCCCCCGATTCTTGCCCAAGATATGGATATCCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATc < 2:790102/145‑1 (MQ=255) gctttCCC‑CCCCCTGTG‑T‑TTTACCCGTCCCC‑GGGCGGGTA‑GTACCCCCCGCCCGATTTTTCCCCCAGATATGGAGATCCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGt < 1:369751/143‑1 (MQ=255) gcgTTCCG‑CCG‑CCGGG‑G‑TGTAACCCTTCCCGCGGCGGGAG‑GTACCCCCCGCCGGATTTTTTCCCCAGATAACGAGACGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGtt < 1:1248511/147‑1 (MQ=255) gTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc > 2:1267427/1‑151 (MQ=255) ccg‑ccgCCCGTG‑T‑TTTAACCGTCCCC‑AGGCGGGCA‑TTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAGAGGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc < 2:1251360/148‑1 (MQ=255) ccg‑ccgCCCGTG‑C‑TTTAACCGTCCCC‑GGGCGGGCA‑GTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCa < 2:203447/149‑1 (MQ=255) ccg‑ccgCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCaa > 1:344259/1‑150 (MQ=255) ccgccCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACgg > 2:960347/1‑151 (MQ=255) cccGTG‑T‑TTTACCCGTCCCC‑GGGCGGGCA‑GTACCCCCCCCCCGTTTTTTCCCCCGGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAAc < 2:683883/146‑1 (MQ=255) cccGTC‑C‑TTTAGCCGTCCCG‑GGGCGGAAA‑GTGACCCCCGCCCGTTTTTTCCCCCAAATGTCGAAAGCCCAGGCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATc < 1:1165899/133‑1 (MQ=255) tG‑C‑TTAAACCGTACCG‑GGGCGGGGA‑GTAACCTCCGCCCGATTTTTCCCCCAAATACAAAGAGGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCTCCAt < 1:879550/150‑1 (MQ=255) ttAACCGTCCCG‑AGGAGGGCA‑TTACCCCCCGCCAGATTTTTTCCCAAGATATCGAGGTGCCGGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAg < 1:1226809/150‑1 (MQ=255) accctaaCCC‑GGGGGGGGA‑TTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCAAAATAGCGAGATGCCGCCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTa < 1:295523/140‑1 (MQ=255) acccGTCCCC‑AGGGGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGcc < 1:1257026/148‑1 (MQ=255) cggtcccc‑AGGGGGGAA‑GTACCCCCCGCCCGTTTCTTCCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt < 1:533625/145‑1 (MQ=255) cctcaCCC‑GGGCGGGCG‑ATACCCCCCCCCCGATTCTTCCCCCAGATAGCGGGAGGCCGGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt < 2:304077/146‑1 (MQ=255) ccGTCCCC‑AGGCGGGCA‑GAACCCTCCCCCCGTTTCTTTCCCCAGATACCGAGATGCCACCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGcc < 1:480454/148‑1 (MQ=255) cGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTc > 1:579096/1‑150 (MQ=255) gTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTg > 1:829407/1‑151 (MQ=255) gTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTg > 2:977701/1‑151 (MQ=255) gggCA‑TTACCCCCCCCCCGTTTTTTTCCCCGGATATGGAGATGCCCGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttt < 1:1012241/150‑1 (MQ=255) ggta‑GTACCCCCCGCCCGTTTCTTTCCCGACATATGGGAAGCCCATCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttttt < 1:628060/148‑1 (MQ=255) | TCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGC‑GGGTTTGCTCGCGTTCCG‑CCGCCCGTG‑C‑TTTAACCGTACCC‑AGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTT > NC_000913/2228128‑2228415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |