| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,292,458 | 0 | T | A | 46.8% | 96.2 / 52.9 | 77 | intergenic (+93/+51) | galU/hns | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/3); new base A (0/36); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.44e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCCTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGTTTT > NC_000913/1292309‑1292604 | acCCTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAAt > 1:1010292/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATaa > 2:781182/1‑150 (MQ=255) tGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATaaaaa > 2:314465/1‑150 (MQ=255) ggCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAAt < 1:720945/151‑1 (MQ=255) cACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATcc > 2:772648/1‑151 (MQ=255) cACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATcc > 2:1057401/1‑151 (MQ=255) aCGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATccc < 2:1197266/151‑1 (MQ=255) cGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCccg > 1:995441/1‑151 (MQ=255) ggAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCccgc > 1:239018/1‑151 (MQ=255) tGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGAtt > 1:1094535/1‑151 (MQ=255) ggCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGAAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGAttt < 2:127658/151‑1 (MQ=255) aagaagAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGGTTTTaa > 2:975374/1‑148 (MQ=255) aagaagAGAGGGGCTTAAAGAATTAACTTCCGTATCGTTTTTATCCACAAAAGGGCGTTGAGCAATCGACGCGTTTTTTTTATAGTTTATTTTTATAAAATTGT‑ATAAACCGGAAAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTaa < 1:370624/148‑1 (MQ=255) agaagaGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCa > 2:618357/1‑150 (MQ=255) agaagaGAGGGGCTAAAAAAAGAAACATCCGTATGGGTTTTACCCACAAACCGGCGTTGAGAACTCGACGCTTTTTTTTTATAGTTTATTTTTATTAAATTTTCTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGAtttt < 1:1172425/145‑1 (MQ=255) gaagaGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCa > 2:1151351/1‑149 (MQ=255) aagaGATGGGAATAAAGAAGTAACACCCGTATGGGTTTTACCCACGAACCGGCTTGGAGAAACCGACGCTTTTTTTTTATAGTTTTTTTTTATTAAATTGTCTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGt < 2:647228/151‑1 (MQ=255) gggAATAAAGAATAAACATCCTTATCGGTGTTATCCACAAAACGGCTTTGAGCAATCGACGCCTTTTTTTTATAGCTTTTTTTTATTAAATTTTCTTAACCCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCa < 1:301950/147‑1 (MQ=255) ggacATTAAGAAGTAACACCCGTATCGTTGTTCCCCACAAACCGTGGTTGAGCAATCGCCGCCTTTTTTTTATCGCTTATTTTTATAAAATTTTCTAAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGc < 1:500939/143‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACaaa > 1:733443/1‑150 (MQ=255) aagaatTATCACCCTTCTCAGTATTACCCCCAAAACGCGTTTGACAAATCGCCGCTTTTTTTTTATAGCTTTTTCTTATAAATTTTTCTAACCCCGA‑ACAAAAAAAATACCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATc < 1:1244950/143‑1 (MQ=255) aagaagTAACATCCGTATGGGTTTTATCCACGAAACGGCTTTGAGAAACCGACGCCTTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTTTCTAAAACCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACaaaa < 2:1008996/150‑1 (MQ=255) aaCATCCTTATGGTTGTTATCCAAAAAACGGCGTGGAGAAACCGCCGCTTTTTTTTTATAGTTTATTCTTATTAAATTGTCTAAACCCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTg < 1:825142/151‑1 (MQ=255) aaCATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGattatt > 2:731229/1‑150 (MQ=255) aCATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGc > 1:969230/1‑151 (MQ=255) cATCCTTATGGTTTTTACCCACGAAAGGGCTTTGACCAACCGACGCCTTTTTTTTATATTTTTTTCTTATTAAATTGTGTTAAACCGG‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGc < 2:191082/150‑1 (MQ=255) ccttttCGGTGTTACCCCAAAAACGGTGTGGAGAAATCGCCGCCTTTTTTTTATAGCTTATTCTTATAAAATTGTCTAAACCGGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGa < 1:295624/146‑1 (MQ=255) ccttATGGGTGTTACCCACGAACCGGTGTTAAGCAACCTACGCCGTTTTTTTATACCTTATTCTTATAAAATTTTCTCAACCCGA‑ACAAAAAAAATTCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCtt < 2:1112402/146‑1 (MQ=255) ccttATCGGTTTTTCCCACAAAACGGCGTTGAGAAATCGACGCCGTTTTTTTATAGTTTTTTCTTTTAAATTTGTCTAAACCCGC‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCtt < 1:280777/146‑1 (MQ=255) gTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGAt > 1:571611/1‑150 (MQ=255) tttcgttttttaccACGAAACGGCGTTAAGCAATCGACGCTTTTTTTTTATAGCTTTTTCTTATAAAATTTTCTTAACCGGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGAt < 1:781138/137‑1 (MQ=255) taggggTTTTATCCACGAAAGGGCTTTGACCAATCGACGCGTTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTg < 1:315335/143‑1 (MQ=255) cGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAgg > 1:310568/1‑150 (MQ=255) gttgtTATCCACGAAAGGGCGTTGACCAATCCACGCTTTTTTTTTATAGTTTATTTTTAATAATTTTTCAAAACCCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAgg < 1:1111458/147‑1 (MQ=255) gttgtTACCCACAAAAGGGCTTTGAGCAATCGCCGCGGTTTTTTTATAGTTTATTCTTATTAAATTGTCTTAACCCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGa < 2:12990/148‑1 (MQ=255) ggTTTTACCCAGGAAACGGGGTTGAGCAATCACCGCGTTTTTTTTATAGCTTATTTTTATTAATTTGTCTTAACCCGG‑AAAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGaa < 2:678406/151‑1 (MQ=255) tgtTATCCCCGAAACGGCTTGGAGAAAGCTACGCGGTTTTTTTATAGCTTTTTCTTATTAATTTTTCTAAACCCGA‑ACAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGaaa < 2:1239600/150‑1 (MQ=255) tCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtcg > 2:366224/1‑151 (MQ=255) ccACAAAAGGGGGTTGAAAAAGCGAGGCTTTTTTTTTATATCTTTTTTTTATTAAATTGACAAAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGa < 1:815746/151‑1 (MQ=255) ccACAAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCTTTTTTTTATAGCTTATTTTTATTAATTTGTCAAAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAAtcgtc < 1:994705/149‑1 (MQ=255) aaagggggtggaaaaaTCGACGCCGTTTTTTTAGAGCTTATTTTTATTAATTTGTATAAAACGGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAggg < 1:574819/135‑1 (MQ=255) ggCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTa > 1:879008/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTAc > 1:318824/1‑151 (MQ=255) ggCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGGGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTa > 1:545472/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGAAAAAGCGCCGCTGTTTTTTAATAGTTTATTCTTTTAAAATTGTCTTAACCCGC‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGAttt < 2:706901/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCtt > 1:424424/1‑151 (MQ=255) tgagaactggcggCCGTTTTTTAACAGCTTATTCTTATTAATTTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAATTCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTg < 1:300200/138‑1 (MQ=255) gAGCAATCGACGCCTTTTTTTTATAGTTTATTTTTATAAATTTGTCTTAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGc < 1:290350/150‑1 (MQ=255) aGCACTCGTCGCCGTTTTTTAAAACATTATTCTTATAAATTTTTCTAAAAGCGG‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCtt < 2:562778/147‑1 (MQ=255) aGCAATCGCCGCCTTTTTTTTATAGTTTTTTTTTATAAATTTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGc < 1:1243498/149‑1 (MQ=255) cAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCAt > 1:256470/1‑151 (MQ=255) aaTCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATc > 1:605599/1‑151 (MQ=255) accggcGCAGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATAAAATTTTCTTAACCCGA‑ACAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATcc < 1:484148/146‑1 (MQ=255) ccGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtt > 1:808822/1‑151 (MQ=255) cGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGTAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCCTTGAGGGGTTTACCTTGCTCATAAATTGCttt > 1:1016584/1‑151 (MQ=255) tttttttATAGTTTATTTTTTTTAATTTGTTTAAACCCGG‑AAAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttt < 1:688601/150‑1 (MQ=255) ttttttATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTTATCCATTGCtttttt > 2:844131/1‑151 (MQ=255) ttttttATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttttt > 1:67402/1‑151 (MQ=255) tttttATATCTTATTCTTATTAATTTGTCTTAACCCGG‑ACAAAAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttttt < 1:156101/150‑1 (MQ=255) tttttATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGTAATCTACAAAAGATTATTTCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCtttttt > 1:983591/1‑150 (MQ=255) ttATAGCTTATTCTTATTAAATTTTCTTAACCCGG‑ACAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGAt < 2:451001/150‑1 (MQ=255) taGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTa > 2:1141761/1‑149 (MQ=255) taGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTAc > 2:520692/1‑150 (MQ=255) cttattcttattAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCt > 1:471934/1‑151 (MQ=255) cttattcttattAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAAATTATTGCTTGATCAGGAAATCCTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAg > 1:439877/1‑149 (MQ=255) ttatttttataAAATTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCt < 1:941432/150‑1 (MQ=255) ttattaATTTGTCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTa < 1:787025/150‑1 (MQ=255) ttattaAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGACTTTAAGCAAGTGCAATCTACCAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCCTTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAg > 1:352894/1‑148 (MQ=255) taAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGGGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGcc > 1:275578/1‑151 (MQ=255) aaaTTGTCTAAACCCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGc < 1:314457/149‑1 (MQ=255) aTTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCCTCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGGGTACGGCCTTg > 1:1005330/1‑151 (MQ=255) ttGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTgg > 1:4435/1‑151 (MQ=255) tGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAAATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCAACCATTGCTTTTTTGATTACAGCCGGAGGACGGCCt > 1:158859/1‑147 (MQ=255) ttCTAAAACCGA‑AAAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTgg < 1:859442/148‑1 (MQ=255) tCTTAACCCGG‑ACAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGcc < 2:355045/150‑1 (MQ=255) tAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTc > 2:457868/1‑151 (MQ=255) aacccGG‑ACAAAAAAAAACCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTc < 2:499591/147‑1 (MQ=255) aaTAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGtttt > 1:933133/1‑149 (MQ=255) | ACCCTTGGCACGGAATTTAAAGCCTGGCTTGAAGAAGAGATGGGCATTAAGAAGTAACATCCGTATCGGTGTTATCCACGAAACGGCGTTGAGCAATCGACGCCGTTTTTTTATAGCTTATTCTTATTAAATTGTCTTAAACCGG‑ACAATAAAAAATCCCGCCGCTGGCGGGATTTTAAGCAAGTGCAATCTACAAAAGATTATTGCTTGATCAGGAAATCGTCGAGGGATTTACCTTGCTCATCCATTGCTTTTTTGATTACAGCTGGAGTACGGCCTTGGCCAGTCCAGGTTTT > NC_000913/1292309‑1292604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |