| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,751,537 | 0 | A | C | 47.8% | 82.2 / 15.1 | 67 | V111G (GTT→GGT) | yiaT | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/11); new base C (0/32); total (24/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGG > NC_000913/3751390‑3751684 | aCGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑ccc > 2:541376/1‑151 (MQ=255) gCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑ccccc > 1:946857/1‑151 (MQ=255) cccAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCg < 1:608495/151‑1 (MQ=255) cccAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCg > 2:709675/1‑151 (MQ=255) aGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGcc > 2:26164/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCAATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCAt > 1:396763/1‑150 (MQ=255) gtCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTAc > 1:170323/1‑151 (MQ=255) aCAGACGCCCTTTCTGCTTTTGGTGGAATCCCGAACGCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTGTTACCGAGAC‑CGCCCACGGCTGCAGCGCTTTTCACGGTCCCCCAC‑CG‑CGCG‑TGTTGACACCGGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCAc < 1:769161/150‑1 (MQ=255) aCAGACGCCCTACCTGCATTTTGGGAAATACCGATGGCCCCCCCCCCCAGCCTTTGCTTTTATCCAGAC‑CGTCCGCAGCGGCAGAGGCTTTCCCGGTTCCCCAC‑CG‑CTCG‑GGGTGATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCAc < 1:523222/150‑1 (MQ=255) cagagacccTATCTTCATTTTGGGTAATCCCGATATCCCCCCCCCCCGCCCTTTCCTCTTTCCCAGAC‑CCTCCGCGCCGGCAGAGGCTTTC‑CGGTTCCCCCT‑CC‑CCCGTTGGTGACACCAGACAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCTCg < 1:1054673/143‑1 (MQ=255) acccccTACCGGCATTTTGTGAAATCCGGTAACCCCCCCCACCCAGCGTTTTCTTTTATCCAAAT‑GGTCGGCAGCTCGAGAGCTTTCCCCGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGTGTATGCCGGCCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCtt < 2:170901/146‑1 (MQ=255) cgacCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTAt > 1:237512/1‑151 (MQ=255) acCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATc > 1:5972/1‑150 (MQ=255) ccTTTCTCCTTTTTGTGAAATCCCGAAGGCCCCCCCCCCCCCCCGTTGCTGTTACCAAAAC‑CGCCCGCGGCGGCGGAGCTTTTCCCGTTCCCCCAC‑CC‑CTGG‑TGGTAATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCa < 1:1076334/150‑1 (MQ=255) tCTGCATTTTGTGAAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGc < 2:415086/149‑1 (MQ=255) tGCTTTTTGTGAAATCCCGATAGCCCCCCCCCCCAGCCTTTGCTTTTACCCAGAC‑CGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTAATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATc < 1:431252/143‑1 (MQ=255) aTTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGc > 2:1206913/1‑150 (MQ=255) ttttGTGGAATACGGAAACCCCCCCCCCCCAGCCGTTGCTGTTACCCACAC‑CGTCCGCAGCTGGAGAGCCTTTCACGTTTCCCCAA‑CA‑CTCG‑TGGGGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGc < 2:15793/149‑1 (MQ=255) tttGTGAAATCCCGACAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTCCTGTTATCCAAAC‑CGCCCGCGCCGGCAGAGGTTTTCAGGGTCCCCCAA‑CC‑CTCG‑TGGTAATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGt < 1:996650/145‑1 (MQ=255) ggAATCCCGATACCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTGTTACCCAGAG‑CGTCCGCAGCTGCAGGGGCTTTCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCAt < 2:828554/150‑1 (MQ=255) aaTACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAAt > 1:1075744/1‑151 (MQ=255) aTACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATc > 2:677266/1‑151 (MQ=255) aTACCAATACCCCCCCCCCCCAGCCGTTGCTGTTACCCAGAC‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGTTTCCCCAC‑CC‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAAt < 2:1014451/150‑1 (MQ=255) ccgatgcccccccccccCAGCCGTCGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCGGTGCTTTTCCCGGTTCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCg < 2:508338/140‑1 (MQ=255) ccGATAGCCCCCCCCCCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTc < 2:772263/151‑1 (MQ=255) ccGATACCCCCCCCCCCCAGCCGTTGCTGTTACCCAGAC‑CGCCCGCAGCTGCAGGGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTc < 1:233976/151‑1 (MQ=255) ccGAGAGCTCCCCCCCCCACCCGTTGCTGTTACCCAGAA‑CGCCCGCGGCTGCAGGGGCTTTCACGGTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCGGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTc < 1:476764/151‑1 (MQ=255) cagATACCCCCCCCCCCCACCCGTCGCTGTTATCCAGAT‑CGTCCGCACCTGCGGGGGCTTCCACGGTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGt < 2:1083719/148‑1 (MQ=255) atacccccccccccCACCCGTTGCTGTTACCCAGAA‑CGTCCGCGGCGGCAGAGGTTTCCACGTTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCAtt < 1:1137341/145‑1 (MQ=255) ccccccccCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAC‑CGTCCGCAGCTGCAGAGCCTTTCCCGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGt < 2:350345/151‑1 (MQ=255) ccccACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGt > 2:380293/1‑150 (MQ=255) cccccaCCCGTTCCTGTTACCAAGAC‑CGGCCCCAGCGGCAGGGGCTTTCGCGGTCCCCAAC‑CG‑CTGG‑TGTTGACCCCGGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAggg < 1:376255/149‑1 (MQ=255) cccaGCCGTTGTTGTTATCCAGAC‑CTTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGt < 2:552111/150‑1 (MQ=255) cctttGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGGGGCTTTCACGTTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAAtt < 2:1142754/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCTGTTGTCAAAAT‑CGTCCGCGGGGGCGGAGGCTTTCCGGGTCCCCCAA‑CG‑CTGG‑TGGGGATACCGGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAAtt < 1:241452/151‑1 (MQ=255) ttGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTcc > 2:1006868/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTTACCCAGAC‑CGCCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCGGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTc < 1:162085/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTcc > 2:929231/1‑149 (MQ=255) tcttttATTCAGAACCGTCCCGAGCGGAGGAGTCTTTCAC‑GTTCCCCCA‑CGTCCCG‑TGGTAATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTc < 1:351228/144‑1 (MQ=255) tGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTGTCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCgg > 1:37002/1‑151 (MQ=255) ccaaacctcccccAGCGGCAGAGGTTTTCCCGTTCCCCCAA‑CC‑CTCG‑TGGTGACCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCa < 1:588120/139‑1 (MQ=255) aGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAg < 2:780641/150‑1 (MQ=255) aGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAgg > 1:976319/1‑151 (MQ=255) cGTCCGCAGCTGCGGAGGCTTTCGCGTTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGCCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGAt < 1:8610/149‑1 (MQ=255) tCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCgg > 1:755002/1‑151 (MQ=255) ccccggCTGCGGAGCTTTTCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACC‑GGCAACCCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCg < 2:286841/144‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCGGAGGTTTCCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTc < 1:470293/151‑1 (MQ=255) cGCAGCTCCGGAGGCTTTCCCGTTCCCCCAA‑CG‑CCCG‑TGTGGATACGAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATg < 2:993035/146‑1 (MQ=255) cTGCAGAGTCTTTCACGTTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGCCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAg < 1:26163/148‑1 (MQ=255) cgggggCTTCCACGGTCCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCGGCCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCa < 2:698546/140‑1 (MQ=255) ggggCTTCCCCGCTCCCCCAG‑CG‑CTCG‑TGGTGATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTGTCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGtt < 2:652423/149‑1 (MQ=255) tttCCCGTTCCCCCAC‑CG‑CTCG‑TGGGGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtt < 1:576080/150‑1 (MQ=255) tctcccgTTCCCCAATCG‑CGCG‑TGGAGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTc < 2:1068548/141‑1 (MQ=255) cgcGGTTCCCCAA‑CG‑CTGG‑TGGTGATACCAGACAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAtttt < 1:541350/147‑1 (MQ=255) cGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTc > 1:208664/1‑151 (MQ=255) ggTCCCCCAA‑CG‑CGGG‑GGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCAttt < 2:970526/145‑1 (MQ=255) tcccccAC‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCa < 2:170327/147‑1 (MQ=255) cccAC‑CG‑CTCG‑GGGTGATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTg < 1:84358/151‑1 (MQ=255) ccAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGc < 2:367522/151‑1 (MQ=255) g‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGAc > 2:271010/1‑149 (MQ=255) g‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGAc > 2:1203475/1‑149 (MQ=255) ggtgATCCCAGGCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGaa < 2:557990/147‑1 (MQ=255) aTACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCt > 2:4420/1‑151 (MQ=255) aCCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTa > 1:678504/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAAc > 2:565804/1‑151 (MQ=255) ggCAC‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGt < 2:237518/150‑1 (MQ=255) gCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTgg > 2:415004/1‑151 (MQ=255) | ACGCCCAGCGCAGGTGTCAGCGACAGACGACCTATCTGCATTTTGTGGAATACCGATAGCTCCCCCACCCAGCCGTTGCTGTTATCCAGAA‑CGTCCGCAGCTGCAGAGGCTTTCACGGTTCCCCAA‑CG‑CTCG‑TGGTGATACCAGGCAA‑CCCCCGCCATAGCCGTACTATCACGCTTATCAAGCTGTTGCATGGCATAATCGTCATTATCGGTAGGGTCAAATTCCAGCGGCATCCAGGATGCGGTCAGGCTAAGTTCATTTTTTTCACTTTGCGACAGAATAAAACCTAACGTGG > NC_000913/3751390‑3751684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |