| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,423,290 | 0 | A | C | 43.8% | 50.8 / 29.3 | 73 | intergenic (+96/+133) | yhdZ/rrfF | putative amino acid ABC transporter ATPase/5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (15/26); new base C (30/2); total (45/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423141‑3423438 | gcgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCa < 1:288928/150‑1 (MQ=255) cgcATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTGCCTCCCCCCAcc > 2:724345/1‑151 (MQ=255) ccTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCg < 2:49117/151‑1 (MQ=255) ccTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGCCCCaccccccacccccc > 1:922915/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTGCCCGCCCCCCCCCcgg > 2:551791/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCggg < 1:359449/150‑1 (MQ=255) cAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGGCTGCCCCCCCCCCTCCCGGCCGt > 2:1093235/1‑150 (MQ=255) agagCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGTGGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGcc > 1:662483/1‑147 (MQ=255) aCGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTTCCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGGTTcccc > 2:862598/1‑148 (MQ=255) aCGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑Gc < 2:583623/150‑1 (MQ=255) aCGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCCCCCCCCCCCCCCCGCGCCGGTGCtt > 1:288109/1‑147 (MQ=37) cGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGtt > 2:26421/1‑142 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCCGCGGCTGCTTC‑TC‑aa > 2:991633/1‑150 (MQ=255) aGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCCCCCCCCCCCGGGCCGtttcctttcaa > 2:396369/1‑140 (MQ=255) aTTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTGCCCGCCACCCCCCCGGGCGTTGCTTC‑CC‑CACGtt > 1:546102/1‑148 (MQ=255) aTTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCGGCCCCCCCCCAACCGGGGCggggga > 1:1000527/1‑133 (MQ=25) tttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTTCTTCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTC‑TC‑AACCTTcta > 1:1035614/1‑148 (MQ=25) ttttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACCCTCaaa > 1:26654/1‑150 (MQ=25) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAAt < 2:236969/150‑1 (MQ=255) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCCCCCGGCCGGTTCTTC‑GC‑CACGGTCaaa > 1:486046/1‑149 (MQ=25) ttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCTTCCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTT‑GC‑CACGtttcaa > 2:374790/1‑144 (MQ=255) cGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTCCCCCCCCCCCCCCCGGGCGCTGCTTT‑TC‑AACGATCTAATCCGc > 1:22116/1‑149 (MQ=255) cAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTTGCCGCCCCCCCCCGGGGCCTTGTTTC‑GC‑AACGGTTAAAttccccccc > 2:100915/1‑143 (MQ=255) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGTGTCCTGCCCGCCCCCCCCCGCGCCGTCGCTTC‑CC‑AAAGATCAAATcccccccc > 1:114738/1‑150 (MQ=255) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGTCCCCCCCCCCCCCGGCCCTTGCTTC‑GC‑CACGTTCAAAACCCCCCCccgc > 1:858905/1‑150 (MQ=21) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTC‑GC‑AACGTTCAAAACCTCCCCccgc > 1:28308/1‑150 (MQ=21) ccATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGAtt < 2:785342/151‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCCCCCGGCCGTTTCTTT‑GC‑CACATTCCAATCCCCCCCCCGC‑CGGttt > 2:534834/1‑151 (MQ=18) aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCGGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCt < 1:402058/151‑1 (MQ=255) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCCCCACCCTCCCCGGCGTTTCTTCTGC‑AA‑GATCCAAACCGCCCCccgc‑ggggtttttct > 1:352165/1‑140 (MQ=18) gAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTC‑TC‑AACCTTTAAATCCGCCCCCCGC‑GGGGTTTTCCTa > 1:829708/1‑149 (MQ=18) tAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTT‑GC‑AACGTTCAAAACCGCCCCCCGC‑GGGTTTTTTCTACTCcgg > 1:1108460/1‑149 (MQ=17) gAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGtt < 1:667920/151‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCGCCCCCCCCCCGGGCGGTTCTTC‑GC‑AACGCTCAAAACCGCCCCCCGC‑GGGTTTTTCCTCCTCCGGA‑GAGTGtt > 1:531552/1‑150 (MQ=17) aGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCGGGCCGGTGCTTT‑GC‑AACGTTTAAAACCCCCCCCCGC‑GGGGTTTTCCTACCCCGGG‑GAGGGTTTAcc > 1:157171/1‑151 (MQ=14) aaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTGCTCCCCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCCTC‑CC‑AAACCTCAAAACCCCTCCCCGC‑GGGTTTTTTCTTCCCCGGA‑GGGGGTTCACCCac > 1:1015384/1‑149 (MQ=255) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAg < 1:862650/151‑1 (MQ=255) aTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTT‑CC‑AAAGGTCAAATCCCCCCCCCGC‑GGGATTTTCCTACTCCGGG‑GAGGGTTCCCCCacaaacaa > 1:53739/1‑148 (MQ=9) ccTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGa < 2:845207/150‑1 (MQ=255) tttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTTCCCCCCACCCCCCGGGCCGCTTCTTC‑GC‑AACCTTCAAATCCGCCCCCCGC‑GGGGTTTTCCTCCTCGCGG‑GAGGGGTCACCGacaa > 1:779334/1‑140 (MQ=14) gtcaggATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGGCGTTTCCTC‑CCAAACTTTTAAACCCCTCCCCGGG‑GGATTT‑TTCTACCCCCGA‑GGGGGGTCACCCacaaa > 1:200950/5‑141 (MQ=0) ttCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTT‑GC‑AACATTCAAAACCGCTCCCCGC‑GGGGTTTTTCTTCTCGGGG‑GGGGGTTTACCGACAAaaaacaaaaaa > 2:442156/1‑145 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAAc < 1:555303/150‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACa < 1:667981/151‑1 (MQ=255) tGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCGCCCGGCCCGTGTTTC‑CC‑CAATATTAATTCCCCCCCCCCC‑CGATTTGTTCTTCTCGCGG‑CGGGGTTTTCCCACCAACAACCGATaaaaaaaa > 2:166305/1‑150 (MQ=9) ccTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCGCCACCCCCCGGGCCGTTGCTTT‑GC‑CAAGTTCAAAACCCCCCCCCGCGGGGTTTTTCCT‑CTCGGGG‑GAGTGGTTCCCGACCAACAACAGATAaaaaaaaa > 1:216895/1‑148 (MQ=9) ttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGTTTC‑TC‑AACCTTCAAATCCGCTCCCCGC‑GGGTTTTTTCTCCTCGGGG‑GAGTGGTTACCGACAAACAACAGATAAAAAAAAAAGcc > 1:486736/1‑149 (MQ=14) ttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGcc < 1:148442/149‑1 (MQ=255) ttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCGCCCCCCTCCCGGCCGGTGCTTC‑TC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCCGC‑GGGGTTGTTCTTCTCCGGA‑GAGGGTTCACCGACAAACAACAGATAAAAAAAAAAGccc > 1:48902/1‑150 (MQ=14) cGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAg < 2:804130/150‑1 (MQ=255) cGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAg < 1:314452/150‑1 (MQ=255) gCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCCCCCCCCTCCCCGCCGCTTCTTT‑GC‑AACCTTCAAATCCCCCCCCCGC‑GGGTTTTTCCTACTCGCGG‑GAGTGTTCTCCGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGccccaac > 1:634688/1‑147 (MQ=255) ttaatttgatGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCCCCCCGCCGGTGCTTT‑CC‑AACGTTCCAATCCCCTCCCCGC‑GGGGTTTTTCTTCTCCAGAGGGGGGTTCCCCCCCAAACAAAAAAAAAAAAAAAAGGccccacct > 2:875560/4‑146 (MQ=0) tgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGTCCCCCCCCCCCCGGGCCGTTTGTTT‑GC‑CAAGTTTCAATTCGCGCCCCGC‑CGCTTTTTTCCTCTCCGGG‑GAGGGTTTACCCACAAAAAACAAAGAAAAAAAAAAGACCAgg > 2:819625/1‑146 (MQ=2) gatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCTCCGGGCCGGTGCTTC‑GC‑AACGTTTAAATCCCCCCCCCGC‑GGGTTTTTCCTCCTCCGGG‑GAGTGTTCACCGCCAAACAACAGATAAAAAAAAAAGCCCAGTCTTcc > 1:550781/1‑151 (MQ=11) atttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCCGGGCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAAACCGCCCCCCGC‑GGGGTTGTCCTACTCCGGA‑GAGTGGTTACCGACAAACAACAGATAAAAAAAAAAGACCAGTCTTcc > 1:549387/1‑150 (MQ=11) tttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCg < 2:367559/150‑1 (MQ=38) tgatTTCTGGGAGTTTATGGCGGGCCTCCGGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGAc < 2:962306/150‑1 (MQ=255) tgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCCCCACCCCCCGGGCCCGTGCTTT‑GC‑AAAGTTTCAATACCCCCCCCGC‑GGGATTTTTCTACTCCGGA‑GGGGGTTCACCCACAAACAAAAAATAAAAAAAAAAGccccagctt > 1:1155593/1‑139 (MQ=2) tGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCCCCCGGGCGTTGCCTC‑GC‑AACGTTCAAAATCGCCCCCGGC‑GGGGTTTTTCCCCTCGGGA‑GAGGGGTTTCCCACCAAAAACAGATAAAACAAAAAGCCCAGTCTTTCCGCCGAGCCtt > 1:202411/1‑151 (MQ=2) ggCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGcc < 1:529954/148‑1 (MQ=35) cAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTg < 2:367996/151‑1 (MQ=37) gTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGt < 1:1160488/150‑1 (MQ=38) aTGGCGGGCGTCCTGCCCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGtttt < 2:831493/149‑1 (MQ=38) ggcgggcgTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTAtt < 2:2541/150‑1 (MQ=38) gcgggcgTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTg < 1:333076/151‑1 (MQ=38) cgggcgTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCATTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTg < 2:713749/150‑1 (MQ=38) gggcgTCCTGCCCGCCCCCCCCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGAt < 1:484659/151‑1 (MQ=255) gggcgTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGAt < 1:551811/151‑1 (MQ=38) gcgTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGt > 2:1066078/1‑151 (MQ=39) tCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTg > 1:28788/1‑151 (MQ=40) ccTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTg < 2:183991/150‑1 (MQ=40) tGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGc > 1:608085/1‑150 (MQ=40) cccGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGACTTTTGTTTTATTTGATGCCTGGc < 2:31342/148‑1 (MQ=25) ccACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTccc < 1:633273/151‑1 (MQ=40) | GCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTC‑GC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGA‑GAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCC > NC_000913/3423141‑3423438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |