| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,776,263 | 0 | T | G | 41.2% | 147.0 / 12.6 | 80 | V226G (GTG→GGG) | ydiF | putative acetyl‑CoA:acetoacetyl‑CoA transferase: alpha subunit/beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/35); new base G (33/0); total (45/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTTG > NC_000913/1776114‑1776412 | cAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTg < 2:347852/151‑1 (MQ=255) aaaGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGc < 2:36311/151‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGaaaa > 1:415352/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGATTC‑AGGGGGAGgaaa > 2:1174411/1‑149 (MQ=255) ccAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTTTGGTGATGG‑AGGGGCAGAAAAAgggt > 2:81570/1‑148 (MQ=255) aGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAg < 1:1045611/151‑1 (MQ=255) aGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAg < 2:311845/151‑1 (MQ=255) tGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGGTaaaaaa > 2:798852/1‑148 (MQ=255) tGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCATTATGGTGATTG‑CGGGGAAGAAAAAGGGTAAGaaaaac > 1:409389/1‑148 (MQ=255) ccTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGC‑CGGGGCCGAAAAAGGGTAAGAAAACCAc > 1:728473/1‑151 (MQ=255) ccTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCAc < 2:813511/151‑1 (MQ=255) cTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTGTTGGGATGATGG‑AGGGGTAGAAAATGGGTAAAAAAACCAc > 1:163721/1‑150 (MQ=255) cTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATTG‑CGGGGGAGAAAAAGGGTAAAAAAGCCAc > 1:184307/1‑150 (MQ=255) ttCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGGAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGc > 1:861436/1‑151 (MQ=255) tCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACg < 1:571895/149‑1 (MQ=255) cATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAGCCAc > 1:1057025/1‑147 (MQ=255) aTTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCTACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGc < 1:10059/151‑1 (MQ=255) aTTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGGAGGAAAAGGGTTAGAAAGGCACGCTg > 2:1153702/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGG‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAGGCACGCTGCAt > 2:316545/1‑151 (MQ=255) tCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGGTTTTGATGAAGC‑CGGGGCAGAAACTTGTTaaaaaaagcaagc > 2:848521/1‑139 (MQ=255) gcTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTa < 2:522161/151‑1 (MQ=255) tACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTTTTTTGATGATTCAAGGGGCGAAAAAGGGTTAGAAAACCCAC‑CTGCCACCTaa > 2:637611/1‑150 (MQ=255) accaccTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTaaa < 2:578258/150‑1 (MQ=255) accTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGAAGAGGC‑AGGGGTAGAAAAAGGGTAAGAAAGACACGCTGCATCCCAAATCt > 1:251747/1‑150 (MQ=255) accTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTAATGTGGTGGTGC‑AGGGGGAGAAAATGGTTAAGAAAACCACGCTGCAGCCTAAATc > 1:309215/1‑149 (MQ=255) cTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGTTAAGAAAACCACGCTGCATCCTAAAACTGt > 1:490815/1‑150 (MQ=255) gCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTcc < 2:762802/150‑1 (MQ=255) gCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCg < 2:230001/151‑1 (MQ=255) aCAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑t < 2:154337/151‑1 (MQ=255) tGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGAAATGTGATGTTTC‑AGGGGAAGAGAATGGATAAGAAAGAGACGCTGGCTACTTAATCTGTCGGGA‑ttt > 2:358656/1‑148 (MQ=255) aGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTTTTGTGATGATTC‑AGGGGCAGAAAAAGGTTAATAAAACCCCCCCTCCGCCTAAATCTGTCAGTA‑TTGCgggg > 2:520648/1‑150 (MQ=255) ggCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGC‑AGGGGCAGGAAATGGGTTAGAAAAGCACGCTGCATCCCAAAACTGTCCGTA‑TTCCggg > 2:258871/1‑149 (MQ=255) gCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTa < 1:597827/151‑1 (MQ=255) cGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCtg < 2:334523/151‑1 (MQ=255) gCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGGTAAGAAAGCCACCCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTTCGGGGTATTtgg > 1:1018332/1‑151 (MQ=255) gCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGGAGAAAATGGGTTAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTTTTCGGA‑TTCCGGGTTAttt > 2:708096/1‑147 (MQ=255) ccACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAACCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTTCGGGGTATCtgg > 1:215893/1‑150 (MQ=255) ccACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTTTGGTGATGC‑AGGTGGAGAAAAAGGGTTAGAAAACCACGCTGCATCCTAAAACTTTTCGTA‑TTTCGGGTTATTtgg > 1:499013/1‑150 (MQ=255) cACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGTTAAGAAAGACCCGCTGCATTCTAAATCTGTTCGTA‑TTCCGGGGTATCtggtg > 2:211777/1‑151 (MQ=255) aCTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAAAGGGTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGGA‑TTCCGGGGTATCtggggg > 1:379963/1‑151 (MQ=255) tttGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAATCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGat < 2:573213/150‑1 (MQ=255) tGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGatat < 2:110853/150‑1 (MQ=255) tGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGatat < 1:150349/150‑1 (MQ=255) gAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATAtt < 2:411485/150‑1 (MQ=255) aGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGTTTTTGT‑CGGGGGAGAAAAAGGTTAAGAAAATCACGCTGCATCCTAAATCTGTACGTA‑TTCCGGGGTATCTTGGGGCTAtttt > 2:1144968/1‑148 (MQ=255) aGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATtgtg < 2:892403/151‑1 (MQ=255) aGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATtgtg < 1:563137/151‑1 (MQ=255) aGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATTC‑AGGGGCAGAAAATTGTTAAGCAAGCCACGCCGGATCCTAAATCTCTCCCTATTTCCGGGTT‑TGtggtggggatt > 2:977845/1‑138 (MQ=255) aGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGtggtgg < 1:668039/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTc < 2:433414/151‑1 (MQ=255) tGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGC‑AGGTGGAGAAAATGGTTAAGAAAACCACGCTGCCTCCTAAATCTGTCCGTG‑TTTCGGGGTTTCTGGTGGAGATTTTGGTGGTCGTTc > 1:146850/1‑150 (MQ=255) aTCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTTATGATGC‑AGGTGGAGAAAAAGGTTAAGAAAACCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGGA‑TTCCGGGGTTTCTGGTGGGTATTGTGGGGGGCGATCCgg > 1:289160/1‑150 (MQ=255) tctcGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGTTAAGAAAACCACGCCGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGGGGATATTGTGGTGGTCGATCCgg > 1:239918/1‑149 (MQ=255) cGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGa < 1:144788/147‑1 (MQ=255) cGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGAt < 2:625963/148‑1 (MQ=255) cGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATc < 1:196955/149‑1 (MQ=255) cGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTTGTGATGC‑AGGGGGAGAAAAAGGGTAAGAAAGCCACCCCGCATCCTAAAACTGTCCCTA‑TTCCCGGTTATTTGGGGGGTATTTTGGTGGTCGCTCCCGATC‑aaa > 2:128884/1‑149 (MQ=255) cGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGGGATGATGG‑AGGGGGAGAAAAAGGTTTAAAAAAGCACCCTGCATTCTAAATCTTTCCCTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGGCGATCCGGGTC‑aaa > 1:1007919/1‑149 (MQ=255) tGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGGTATTGTGGGGGTCGATCCGGATC‑AAACCCaa > 1:499114/1‑149 (MQ=255) gTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGt < 1:182776/151‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGT‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAACCCCCCTGCCTCCTAAATCTGTCCGCA‑TTCCGGGGTTTTTGGGGGATATTGTGGTGGTCGATCCCGGAC‑AAAACCAACTggtt > 2:896241/1‑147 (MQ=255) aTTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATg < 2:821985/151‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGc < 2:297028/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGGCGAAAATTGTTAAGAAAAGCACGCTGCAACCTAAATCTTTCCGGA‑TTCCCGGGTATTTGGGTGGTATTTTGGGGGTCGATTCGGATCAAAACCCAATTgattgcgg > 1:184056/1‑144 (MQ=255) cccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAACCACGCTGCATCCTAAATCTGTTCGTA‑TTCCGGGTTTTCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCgg > 1:536594/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGt < 1:1041048/151‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGGGCAGAAAATGGGTAAGAAAACCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTTCGGGTTATCTGGGGGGTATTTTGGGGGTCGATCCGGATC‑AAAACCCACTGTATGGCgg > 1:43234/1‑148 (MQ=255) ggCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCa < 2:55079/151‑1 (MQ=255) cacaATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTa < 1:972097/151‑1 (MQ=255) caATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAAc > 1:46602/1‑151 (MQ=255) aCGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGGA‑TTCCGGGTTATCTGGGGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGGGCACCGGTTTACCGCtt > 1:321791/1‑151 (MQ=255) ggcggTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCttt > 1:410678/1‑150 (MQ=255) ggcggTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGCTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCttt > 2:339125/1‑150 (MQ=255) gTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTc > 1:419459/1‑151 (MQ=255) gatgatGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGa < 1:630253/150‑1 (MQ=255) gatgatGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGAc > 1:266064/1‑151 (MQ=255) atgatgC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGa < 2:598583/149‑1 (MQ=255) gatgC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTc < 2:1011382/151‑1 (MQ=255) gC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCAcc < 2:77732/151‑1 (MQ=255) gTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTtg > 1:210365/1‑151 (MQ=255) | CAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGC‑AGGTGCAGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCTGTCCGTA‑TTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATC‑AAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTTG > NC_000913/1776114‑1776412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |