| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,270,455 | 0 | G | T | 40.0% | 178.7 / 59.1 | 110 | intergenic (+853/+170) | yhaC/garK | pentapetide repeats‑related protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (14/52); new base T (44/0); total (58/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.44e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTAT > NC_000913/3270310‑3270604 | gTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGctctc < 3:117758/151‑1 (MQ=255) tACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTctct > 1:230159/1‑149 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGGTCTTTGtt > 3:616893/1‑151 (MQ=255) gggCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCTCTGt > 3:779906/1‑150 (MQ=255) gCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGc < 3:27251/151‑1 (MQ=255) ccGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCa < 1:1390080/151‑1 (MQ=255) tACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGccc > 4:423408/1‑147 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCAC‑t > 4:326247/1‑149 (MQ=255) ccTTATGATCCCCGATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCTTTCCACGGACTTTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCTCCCTTTCGCCCTTACCTGTTCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑Tgg < 1:928043/150‑1 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGt < 1:379058/151‑1 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCCCtttt > 1:816536/1‑142 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTTCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑Tg < 3:1065794/146‑1 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTCGCAc > 4:387659/1‑144 (MQ=255) tATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑g < 1:1299037/150‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCACACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGt > 3:1039052/1‑147 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCAC‑TGGT‑C‑gcg > 3:720906/1‑145 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGtt < 2:423412/151‑1 (MQ=255) aCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGtt < 2:413260/151‑1 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCTCTGTTGCAC‑TTGT‑T‑GT‑GGGgtt > 3:1012529/1‑150 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCCCTTGGT‑C‑GG‑GGGtt > 4:431595/1‑149 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCCC‑TGGT‑C‑GT‑ggggt > 1:1080205/1‑146 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCCCTTTTGCAC‑TTGT‑C‑GT‑GGGGTTcccc > 1:673730/1‑151 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTGTCTCTGTTGCAC‑TCGT‑C‑GT‑GGGTTTtcccc > 1:978006/1‑151 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTcccc < 3:819579/150‑1 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTccc < 1:370448/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTcccccc < 1:546316/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCAC‑TTGT‑C‑GT‑GGGTTTtcccccc > 2:178033/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTccccccc < 1:235946/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCCC‑TGGG‑C‑GT‑GGGGTTtcccccc > 3:700537/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAg < 3:1113989/151‑1 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTcccccccc > 2:156509/1‑147 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGc < 4:385424/151‑1 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGc < 4:487556/151‑1 (MQ=255) gCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCAC‑TGGT‑C‑GG‑GGGGTTCCCCCCCCCGCGtt > 3:836250/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGtt < 3:822541/150‑1 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTTTCTCTTTTTCAC‑TGGT‑C‑GTGGGGTTTccccccccgcggtac > 1:1206375/1‑143 (MQ=255) cTCCGGGAGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGCTTTCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑A‑GT‑ATGGTTCCCCCCCACGc > 1:1047010/1‑146 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGTTCTCTGTTTCCC‑CGGT‑C‑GG‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGGTAcc > 1:1178358/1‑151 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTAcc < 3:887751/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCAC‑TTGG‑C‑GG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGCTAcc > 3:87730/1‑149 (MQ=255) ggggTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGTAC‑CGGTCC‑GG‑GGGTTTCCCCCCCGGCCGtacccggccc > 3:620330/4‑141 (MQ=255) ggAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCAc < 2:187220/150‑1 (MQ=255) aGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCt < 4:285467/151‑1 (MQ=255) aGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCt < 3:526687/151‑1 (MQ=255) ccGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCCC‑TCGT‑C‑GT‑GGGTTTTCCCCCCAAGCGGTACCCCGCACCCCGccc > 2:370602/1‑149 (MQ=255) cGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTAt < 3:926001/151‑1 (MQ=255) gTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTGCC‑CGGT‑CGGG‑GGGTTTCCCCCCCCGG‑GGTACCCTGCACCCCGccc > 1:554476/1‑147 (MQ=255) ccACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGG‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTACCCGGCCCCCCGccc > 3:377795/1‑144 (MQ=255) ggACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGTTTCCCGGCACCCCGCCCCATTGAGccc > 2:223407/1‑150 (MQ=255) aCTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGGTACCTGGCACCCCGCCCTATTGAGccc > 2:177495/1‑148 (MQ=255) ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCCGCGTTACCTGGCACCCCCCCCCATGGAGCCCCGGCttttc > 1:62479/1‑148 (MQ=255) ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTg < 2:208788/128‑1 (MQ=255) ccAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTtcct < 3:1377343/151‑1 (MQ=255) 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tCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCAC‑TGGG‑C‑GT‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGTTACCTGGCACCCCGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCCCCGCCCCTCTCCCCCCAAGAgg > 4:379124/1‑146 (MQ=255) cACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacgac < 4:314089/150‑1 (MQ=255) cACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGgacgac < 1:543512/150‑1 (MQ=255) cccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCAC‑TTGG‑C‑GC‑GGGGTTCCCCCCCCGGCGGTTACTCGCCCCCCGCCCCCTGGGGCCCGGGCCTTTCCCGCCCCCCCCCCCCTccccccgacagg > 1:143381/1‑136 (MQ=255) ccTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGGTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGTTTCCCTGCACCCCCCCCCATTGAGGCCCGGCTTTTCTCCCCCCCCCCCCTCTCCCCCCCAGAgg > 3:79803/1‑142 (MQ=255) ttACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCGGGGGTACCTGGCACCCCGCCCTATGGGGCCCGGGGCTTTCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCAGAgg > 1:993465/1‑140 (MQ=255) ttACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTTTC‑TAGT‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCAAGCGTTACCCGGTACCCCTCCCTATGGTGGCCGGGCGTTTCTCCCCTCCCCCCCTCTCCCCCCCAGATGAcgaccacga > 3:660195/1‑150 (MQ=255) tACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTTTTTCAC‑TGGG‑C‑GG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTACCCGGCACCCCGCCCCATTGGGCCCCGGCTTTTCTCCCCCCCCCCCGCCTCCCCCCAAGAgg > 4:543426/1‑139 (MQ=255) aCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTTCAC‑TTGT‑C‑GG‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGTTTCCTGGCACCCCGCCCCATGGGGCCCGGGCTTTTCTCCCCCCCCCCCCTCcccccc > 1:1188696/1‑131 (MQ=255) aCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGG‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGTTAACTGGCAACCCGCCCTATGGAGCCCCGGCTTTCCTCCCCTCCCCCCCTCTCCCCCCCAGAGGACCACGACCaa > 3:332521/1‑149 (MQ=255) ccTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAgcg < 4:341576/151‑1 (MQ=255) tGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTTCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGGTTTCCCCCCCGGCGGTACCTGGCACCCCCCCCCATGGAGCCCCGGCCTTCCTCCCCCCCCCCCGGCTCCCCCCCAGAGGACGACGACGAAacgg > 3:84911/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGATTGCTTTCTCTTTTAC‑TTGT‑C‑CG‑GGGTTTCCCCCCCCGGCGTTAGCCCGCCCCCCGCCCTATGGGGCCCCGACCTTTCTCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCAGAGgacggcgcgggagcg > 3:339648/1‑136 (MQ=255) cGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGt < 4:16477/151‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTgg < 3:55792/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGt < 1:700438/151‑1 (MQ=255) gcgGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCa < 3:191375/151‑1 (MQ=255) ggCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCt < 2:431601/151‑1 (MQ=255) gCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt < 3:1206510/151‑1 (MQ=255) gCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCtt < 3:656229/151‑1 (MQ=255) cggcggTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GC‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgc > 2:152451/1‑150 (MQ=255) cggTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGgcgcgc > 3:394464/1‑151 (MQ=255) gTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAg < 1:1038922/151‑1 (MQ=255) ttGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGt > 1:322534/1‑150 (MQ=255) ttGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGt > 1:298126/1‑150 (MQ=255) ttGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGCCAGCTTCGGCGCGCa > 1:1043869/1‑148 (MQ=255) tGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTTCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGtat > 2:496233/1‑151 (MQ=255) | GTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCAC‑TGGT‑C‑GT‑GGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGAGGACGACGACGAAGCGGCGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTAT > NC_000913/3270310‑3270604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |