| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,776,263 | 0 | T | G | 43.2% | 123.1 / 19.8 | 75 | V226G (GTG→GGG) | ydiF | putative acetyl‑CoA:acetoacetyl‑CoA transferase: alpha subunit/beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/33); new base G (32/0); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTTG > NC_000913/1776113‑1776412 | aCAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGt < 2:729290/151‑1 (MQ=255) cGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGaa < 1:521611/151‑1 (MQ=255) gATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGGTGCAGGGGG‑AGaa > 1:439801/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCAATGTGGTGATGGCGGTggtccaaa > 1:1139815/1‑142 (MQ=255) gcgcCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATg < 2:344607/150‑1 (MQ=255) cgcCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGGGC‑AGAAAAAgg > 1:9434/1‑150 (MQ=255) gcCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATTCAGGGGG‑AGAAAAAggg > 1:330576/1‑149 (MQ=255) ccAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGTGC‑AGAAAATgggt > 2:112607/1‑148 (MQ=255) ccAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTa < 2:101846/151‑1 (MQ=255) cAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTTTGGTGGTGCAAGGGG‑AGAAAAAgggt > 1:1111800/1‑147 (MQ=255) aGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTTTGGTGATTGAGGGGG‑AGaaaaatg > 2:168836/1‑143 (MQ=255) atTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCGCTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAg < 2:197241/151‑1 (MQ=255) gCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGTTAAGaaa > 2:849502/1‑147 (MQ=255) cATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCt < 2:978345/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGGTTGAGGTGC‑AGAAAAAGGTTTAAAAAAACACGc > 1:707548/1‑148 (MQ=255) aTTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCCGGGGC‑AGAAAAAGGTTAAGAAAACCACGc > 2:640829/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAGGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGGGC‑AGAAAATGGGTAAGAAAACCACGc > 2:392365/1‑147 (MQ=255) ttCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAACCACGCTg > 2:414370/1‑149 (MQ=255) cgcgCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAACCACGc > 1:431165/1‑145 (MQ=255) cgcgCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCAt < 2:57720/150‑1 (MQ=255) gcTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAAAAAACCACGCTGCATcc > 2:1562/1‑149 (MQ=255) tACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGGAAATGGGTAAGAAAAACACCCTGCCTcc > 1:416547/1‑147 (MQ=255) accaccTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTaaa < 1:493583/150‑1 (MQ=255) ccaccTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGATGGAGGGGC‑AGAAAAAGGGTTAGAAAGACACGCCGCCTCCTaaa > 1:354868/1‑149 (MQ=255) ccaccTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAt < 1:619586/150‑1 (MQ=255) caccTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCt < 1:883105/151‑1 (MQ=255) accTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGTTAAGAAAACCACCCTGCATCCTaaa > 2:183824/1‑147 (MQ=255) cTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGG‑AGAAAAAGGGTAAGAAAACCACGCTGCCTCCTTAATCT‑G‑t > 1:31021/1‑150 (MQ=255) gCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑Tcc < 2:455098/150‑1 (MQ=255) gCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑Tcc < 2:921883/150‑1 (MQ=255) gACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGGCGGGGG‑AGAAAAAGGGTAAAAAAACCACGCCGCAACCTAAATCT‑T‑Tcc > 1:933262/1‑148 (MQ=255) gACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCATTTTTGTGATTTAGGGGG‑GGAAAAAGGTTTAAAAAACCCCCCCGCCTCCTAAATTT‑G‑t > 1:550207/1‑146 (MQ=255) aGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGATTGTGGTGATGTAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAAGCACGCCGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TAtt > 1:755183/1‑150 (MQ=255) gTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTcc < 2:499558/151‑1 (MQ=255) aGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGt < 1:353441/151‑1 (MQ=255) ggCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGTTAAGAAAAACACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTTCggg > 2:893054/1‑149 (MQ=255) cGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCtg < 1:677259/151‑1 (MQ=255) cGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTAATGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAGCCACCCTGCATCCTAAATTT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGGTGTCt > 2:1162717/1‑150 (MQ=255) ccACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCtggt < 1:548607/151‑1 (MQ=255) ccACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGGTATCtgg > 2:751331/1‑150 (MQ=255) aCTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTTGGGATGCGTGAGG‑AGGAAAATGTTTATAAAACCACCCCGGAACCTTAACCT‑G‑TCCG‑tcgttcggggttta > 1:81383/1‑132 (MQ=255) cTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGATGGAGGGGCGGGCAAATGGTTAAAAAAG‑CACGCCGGCTCCCAAAACTGG‑TCCG‑CTTTCCGGGTT‑TCtggggg > 1:552623/1‑150 (MQ=255) tttGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGat < 1:1027901/150‑1 (MQ=255) tGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGatat < 1:474810/150‑1 (MQ=255) gAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAAACACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCCGGGTATCTTGTGGGTAtt > 2:1147318/1‑150 (MQ=255) gATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGTAGGGGG‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACCCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCC‑GATTTCGGGGTTTCTGGGGGGTATTgtgg > 1:373037/1‑151 (MQ=255) gAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGtggtgg < 1:646289/151‑1 (MQ=255) gATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGAt < 2:583277/151‑1 (MQ=255) cGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATc < 2:58242/149‑1 (MQ=255) cGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAAAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑T‑TCCG‑TATTCCGGGGTATCTGGGGGGTATTTTGGGGGGCGATCCGGATCa > 2:891644/1‑150 (MQ=255) cGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAAAGGGTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑GATTCCGGGGTATTTGGTGGGTATTGTGGGGGTCGATCCGGATCaaaac > 2:762455/1‑149 (MQ=255) cATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGAATGAGGGGC‑GGGAAAAGGGTAAGAAAAACACGCTGCCTCCTTAATCT‑GTTCCG‑ATTTCCGGG‑TATTTGGGGGGTATTTTGGGGGGCGGTCCCGGTCAAAacc > 1:1062503/1‑150 (MQ=255) ttGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGGTTTGTGGTGATTCAGGGGG‑CGAAAATGGGTAAGAAAACCACGCTGCGTCCTAAAACT‑T‑TCCG‑TATTTCGGGGTATCTGGTGGGTATTGTGGGGGTTGGTTCGGCTCAAAccc > 1:1132540/1‑148 (MQ=255) gTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGCAGGGGC‑CGAAAAAGGGTAAGAAAACCACCCTGCATCCTAAATCT‑T‑TCCG‑TATTCCGGGGTATTTGGTGGATATTTTGGGGGGCGGTCCGGGTCCAAACCCACTGt > 2:1041020/1‑151 (MQ=255) gTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGt < 2:1080637/151‑1 (MQ=255) tATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGAAGTAGGGGG‑AGAAAAAGGGTAAGAAAAACACGCTGCATCCTAAAACT‑G‑TCCG‑TATTTCGGGGTTTCTGGGGGGTATTTTGGGGGGTGATCCCGGTCAAACCCAAc > 1:1179866/1‑146 (MQ=255) aTTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGGTGATGCAGGGGG‑AGAAAAAGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAAACT‑G‑TCCC‑TATTTCGGGGTATTTTGTGGATATTGTGGTGGGCGGTCCGGGTCAAACCCAAATGTAt > 2:981123/1‑150 (MQ=255) ttGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGCAATTTGAATTTTTAGGGGC‑CGAAAATAGTTAAAAAAACCACGCCTCATCCTTAAACT‑T‑TTCGCTATTCGGGGTT‑TTTGGGGGGTATTTTGGGGGGTGCTCCCGACCAAAccc > 1:944423/1‑141 (MQ=255) gCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGGTGATGCAGGGGC‑AGAAAATGGTTTAAAAAACCACGCTGCATCCTAAATCT‑T‑TCCG‑TATTTCGGGGTATCTGGTGGGTATTGTGGTGGGCGATCCGGGTCAAAACCAACTGTATGGCg > 2:143549/1‑151 (MQ=255) ccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGt < 2:1189528/151‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGt < 2:756699/151‑1 (MQ=255) ggCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCa < 1:620024/151‑1 (MQ=255) gCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCAc < 2:1132740/151‑1 (MQ=255) cGGTGCACAATAACGGCGGTATTTTGATGATGCAGGGGC‑AGAAAATGGTTAAAAAAACCACGCTGCCTCCTAAATTT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGGTATTTGGGGGGTATTGTGGGGGTCGATCCGGATCAAAACCAACTGTATGGCGGGGGAcc > 2:412898/1‑151 (MQ=255) caATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAAc < 2:251883/151‑1 (MQ=255) cggcggTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCttt < 2:790861/151‑1 (MQ=255) ggcggTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTa < 2:430149/151‑1 (MQ=255) ggcggTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTa < 2:910220/151‑1 (MQ=255) ggTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTAttt > 1:379695/1‑151 (MQ=255) aTTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCt < 1:435204/150‑1 (MQ=255) gtgATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTg < 2:448075/151‑1 (MQ=255) atgatgCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACt > 1:355663/1‑151 (MQ=255) gCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCAcc > 2:647596/1‑151 (MQ=255) cAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCAccc > 1:669339/1‑151 (MQ=255) aGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCt < 1:535992/151‑1 (MQ=255) ggTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCtt < 1:153758/151‑1 (MQ=255) tGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTtg > 1:643530/1‑150 (MQ=255) | ACAAAGCGATTGCGCCAGATATTGCCTTCATTCGCGCTACCACCTGCGACAGTGAAGGCTACGCCACTTTTGAAGATGAGGTGATGTATCTCGACGCATTGGTTATTGCCCAGGCGGTGCACAATAACGGCGGTATTGTGATGATGCAGGTGC‑AGAAAATGGTTAAGAAAGCCACGCTGCATCCTAAATCT‑G‑TCCG‑TATTCCGGGTTATCTGGTGGATATTGTGGTGGTCGATCCGGATCAAACCCAACTGTATGGCGGTGCACCGGTTAACCGCTTTATTTCTGGTGACTTCACCCTTG > NC_000913/1776113‑1776412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |