| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,067,745 | 0 | A | G | 47.2% | 33.8 / 10.5 | 36 | L511P (CTG→CCG) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (10/9); new base G (0/17); total (10/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAA‑GGCGCTGAAATCG‑CACCA‑GCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTT > NC_000913/4067600‑4067890 | ggCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAA‑GGCGCTGAAATCG‑CACCA‑GCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggt < 2:25225/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAA‑GGCGCTGAAATCG‑CACCA‑GCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 2:997610/151‑1 (MQ=255) aaaTGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAA‑GGCGCTGAAATCG‑CACCA‑GCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 2:202415/151‑1 (MQ=255) 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gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcccg > 1:857304/1‑150 (MQ=255) cgcTTCATCACAAACGGGGTGGTGAAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtgg < 2:158992/151‑1 (MQ=255) ctttaaTCCCAAAGGGGGTGGTGTACCCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 2:256136/146‑1 (MQ=255) aTCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGt > 2:29895/1‑151 (MQ=255) aTCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGt > 1:778701/1‑151 (MQ=255) aTCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCCGGTCGCCCGCCCACATCATGGGGGAGt > 2:1052554/1‑151 (MQ=255) cAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGCCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGGCCCCCGCCCACATCATGGCGGAGTAttt > 2:510083/1‑151 (MQ=255) | GGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAA‑GGCGCTGAAATCG‑CACCA‑GCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTT > NC_000913/4067600‑4067890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |