| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2442529 | 57 (0.720) | 6 (0.080) | 6/280 | 6.5 | 10.7% | coding (766/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme |
| ? | NC_000913 | = 2442614 | 47 (0.630) | coding (851/2007 nt) | mnmC | fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine‑forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
ACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGC > NC_000913/2442388‑2442678 | aCATTTACGTCTGCCGGTTTTGTGCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAAc < 2:254443/150‑1 (MQ=255)aCATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAAc < 1:681364/150‑1 (MQ=255)aCATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAAc < 2:103290/150‑1 (MQ=255) cATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCg > 1:535212/1‑151 (MQ=255) cATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCg > 2:379617/1‑151 (MQ=255) cATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCg < 1:1178835/151‑1 (MQ=255) aTTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCg > 1:221700/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTCCGCCGCGGCTTGCAGGCCGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCTGCGCCGTGGTTCAACCGCACGGG‑CAGCAGCaa > 2:32313/1‑151 (MQ=255) tGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACgg < 1:717173/151‑1 (MQ=255) ccgcGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAgcg > 2:731751/1‑151 (MQ=255) ccgcGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCT‑CCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAgcgg < 1:91201/151‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGAt > 1:143268/1‑151 (MQ=255) gTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑AAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGa < 2:1009487/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAATGGCGTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGGGATGGAACAGACATCA‑CCGCTCCCCTGCTTCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTa > 2:1149633/1‑151 (MQ=255) gACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATcggc < 2:883267/150‑1 (MQ=255) ggATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTACCCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCgggggt > 1:1260364/1‑151 (MQ=255) ggATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCggtgggg > 2:487444/1‑149 (MQ=255) cACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGcc < 2:730444/151‑1 (MQ=255) cACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGcc < 2:979359/151‑1 (MQ=255) cACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGcc < 1:1023689/151‑1 (MQ=255) cACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGcc < 1:336480/151‑1 (MQ=255) cACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGcc < 1:190332/151‑1 (MQ=255) aaCGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTGGCcgcgcggtttt > 1:17896/1‑146 (MQ=255) cGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAAGGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAgcgacaacaacg < 1:89927/151‑10 (MQ=255) ggCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGGATTGCCCGCGCGTTGTTGTCGCCgg > 1:29864/1‑151 (MQ=255) cgcAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTAc < 2:484863/151‑1 (MQ=255) cAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGGATTTCCCGCGGGGTGTTGTTGCCGGGGCTTTTATgg > 1:1098416/1‑151 (MQ=255) aaCGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGGGCCGTGGTTTAACCGGACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGgcg < 1:427182/151‑1 (MQ=255) cGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCCGCGCGGTGTTGTCGCCGGCGCTCTTTCGGcgcg > 1:1037318/1‑151 (MQ=255) gggAAATGCTTTTCGGGGTGATTGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGCTGTGCTTGCAGCCGGGTGTTTTCGCTGGCGCTTTTACgggtcgg > 2:665017/1‑146 (MQ=255) ggAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTGTTGCCCGCGCGCTGTTGTCTCCGGGGCTATTACGGCGCggg > 2:1128650/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTTGCGGGGCGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCATCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGAGGTAGTCACAGCGCGCTGTGGTCTGCGGCGCCATTTCGGCGCggg > 2:652648/1‑149 (MQ=255) aaaTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCggagc < 2:266704/151‑4 (MQ=255) aTGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGGATTGCCAGCGGGTTTTTGTCGCTGGGGCTTTTTTGGGGCggggtgg > 1:1131228/1‑146 (MQ=255) cTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCggagcagggg < 2:211516/151‑9 (MQ=255) cGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCggagcaggggagcgg < 1:992605/151‑14 (MQ=255) gggTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGc < 2:221652/150‑1 (MQ=255) gggTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGCTGTTGTCGCTGGCGCTATTTTGGCGCGGCTCGCGGGtgaag > 2:184404/1‑145 (MQ=255) gTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGGATTTCCAGCGCGGTGTTGGCGCCGGGGCTATTACGGCGCGGGTGGGAGGGAAAGCctt > 1:529918/1‑151 (MQ=255) ggAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTTCCAGCCCGGTGTTGTCCCCGGCGCCATTAAGGCGCGGCGGGGCGGGAACGCtttttttg > 2:1073477/1‑149 (MQ=255) gAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGTAATGCCAGCGCGGTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGGTGGCAGGGAAAGCCTttttttg > 2:993736/1‑148 (MQ=255) aaCAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTgcgc < 1:356596/151‑1 (MQ=255) aGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTGCCCGCGCGTTGTTGTCGGTGGCGCTTTTTCGGCGCGGCCGGGGGGTCACGCCTTTTTTCCCggg > 2:597092/1‑150 (MQ=255) gACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGTTTGCCCGCCCGGTGTTGTCGCCGGGGCCATTACGGCGCGGCTGGCCGGGAACGCCTTTTTTCGCgggg > 1:518106/1‑149 (MQ=255) cATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTGCCAGCGCGTTGGTGTCCCCGGGGCTATTACGGCGCGGGTGGGCGGGAACGCCTTTTTTTGCGGGTgg > 1:536639/1‑150 (MQ=255) cATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTGCCAGCGCGGTGTTGTCGCCGGCGCTATTTCGGGGCGGCCGGGGGGGAAAGCTTTTTTTGGCgggggg > 1:1104151/1‑147 (MQ=255) a‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGcc < 2:76289/151‑1 (MQ=255) cTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTTCCCCCGGCTTGGTGTTGCCGGGGCGATTACCGCGCGGCGGGCAGGGAACGCCTTTTTGTCCCGGTGAGGcgccc > 2:950081/1‑150 (MQ=255) cTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGGATTGCCAGCGCGCTGTTGTCGCCGGCGCTCTTTAGGCGCCGGCGGCAGGGAAAGCTTTTTTGTGCGGGGGAGGacccc > 2:812297/1‑150 (MQ=255) tCCCCTGCCCGGCGCCGTGGTTTAA‑CGGACGGGACAGCAGCAACCGGGAGGGGGGGTTTTTCGGCGTTGGTTTGGCCGGCGCGTTGTTGTCGCGGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGGGGCCACCGc < 2:1114131/151‑1 (MQ=255) cccccTGCGCCGCGCCGGGGTTTAACCGCGCGGG‑CAGCAGAAAACGGGAGGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGc < 2:865610/150‑1 (MQ=255) cctgccagccGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGGGGTATTGCCCGCGCGGTGTTGTCGCCGGCGCTATTACGGCGCGGGTGGCAGGGAAAGCTTTTTTGCGCGGGGGAGGGCCCCGCa > 1:660658/9‑151 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCAc < 2:662484/151‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCAc < 1:425080/151‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCAc < 2:504267/151‑1 (MQ=255) cccTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCAc < 1:416589/151‑1 (MQ=255) cTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTGTTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGt < 1:914637/151‑1 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTg < 1:1090063/151‑1 (MQ=255) tCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTg < 2:1076747/151‑1 (MQ=255) tGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGc < 2:29859/150‑1 (MQ=255) | ACATTTACGTCTGCCGGTTTTGTCCGCCGCGGTTTGCAGGACGCCGGATTCACGATGCAAAAACGTAAGGGCTTTGGGCGCAAACGGGAAATGCTTTGCGGGGTGATGGAACAGACATTA‑CCGCTCCCCTGCTCCGCGCCGTGGTTTAACCGCACGGG‑CAGCAGCAAACGGGAAGCGGCGATTATCGGCGGTGGTATTGCCAGCGCGTTGTTGTCGCTGGCGCTATTACGGCGCGGCTGGCAGGTAACGCTTTATTGCGCGGATGAGGCCCCCGCACTGGGTGCTTCCGGC > NC_000913/2442388‑2442678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |