| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 585,420 | Δ1 bp | coding (214/954 nt) | ompT ← | DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 585,420 | 0 | T | . | 100.0% | 61.0 / NA | 15 | coding (214/954 nt) | ompT | DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (7/8); total (7/8) | |||||||||||
GGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACTAATGTCCGCATTTATGTTGTCAGGAGTA > NC_000913/585299‑585553 | gggTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGaa > 1:165794/1‑139 (MQ=255) atccaGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTtg > 2:402729/1‑139 (MQ=255) tGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAg < 1:321837/114‑1 (MQ=255) tGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAg > 2:321837/1‑114 (MQ=255) ggCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGa > 2:49521/1‑139 (MQ=255) ccagccagCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTg < 2:393157/139‑1 (MQ=255) agcagcCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCgg < 1:368566/99‑1 (MQ=255) agcagcCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCgg > 2:368566/1‑99 (MQ=255) ccccGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTc < 1:402729/139‑1 (MQ=255) tGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACt < 1:49521/139‑1 (MQ=255) cATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGTGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACTCGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACTAATGt > 1:305143/1‑139 (MQ=255) cATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCa > 1:178444/1‑129 (MQ=255) cATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCa < 2:178444/129‑1 (MQ=255) aTCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACCTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACTAATGTc < 1:17196/139‑1 (MQ=255) cTTTAA‑AATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACTAATGTCCGCATTTATGTTGTCAGGAGTa < 2:305143/139‑1 (MQ=255) | GGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACGCTCTTTTGTTTTTCCGCTCAGAGTTCCAAGACTAATGTCCGCATTTATGTTGTCAGGAGTA > NC_000913/585299‑585553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |