| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,594,256 | (C)8→9 | pseudogene (3732/3861 nt) | yneO ← | pseudogene, AidA homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,594,248 | 1 | . | C | 97.1% | 241.1 / ‑0.4 | 69 | pseudogene (3740/3861 nt) | yneO | pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (34/32); total (36/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
CGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAGTG > NC_000913/1594113‑1594379 | cGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTGATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑ccc < 1:745534/139‑1 (MQ=255) cacGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑cccccc > 1:200699/1‑139 (MQ=255) gCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑ccccccc‑cc < 1:10171/139‑2 (MQ=255) cAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑ccccccc‑cca < 1:434183/139‑3 (MQ=255) tGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTAAGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑CCCCCCCGCACGa > 1:686933/1‑139 (MQ=255) gCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGat < 1:607189/139‑1 (MQ=255) ccccAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCcg < 2:287944/139‑1 (MQ=255) cAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCcgtcg < 2:845272/139‑1 (MQ=255) cAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCcgtcg < 2:149803/139‑1 (MQ=255) ggCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTa < 1:1025150/139‑1 (MQ=255) aaCGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTg > 2:1034390/1‑139 (MQ=255) aCGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGa > 2:105026/1‑139 (MQ=255) aCCTGCCGTGGTGACCTTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATCTTAATGGCAGAGTAGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGa > 2:999279/1‑139 (MQ=255) ccTGCAGTGGTGACATTTCCCGACTACACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGCCTTGCCATATTAATGGCAGATTCGGAACCGAAACCAATTCC‑‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 2:626613/139‑1 (MQ=255) ccTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 1:105026/139‑1 (MQ=255) tGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATc < 1:475988/139‑1 (MQ=255) ggtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTGATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt < 1:1034390/139‑1 (MQ=255) gtgACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTACTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTa > 1:626613/1‑139 (MQ=255) gACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAag < 1:968724/139‑1 (MQ=255) aCATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAaga > 2:374923/1‑139 (MQ=255) cccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAgg < 2:200699/139‑1 (MQ=255) ccGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATAGTAAGGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGa > 2:468013/1‑139 (MQ=255) acCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTAcc < 1:468013/139‑1 (MQ=255) cGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:571807/1‑108 (MQ=255) cGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 1:571807/108‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TCCCCCCCCC‑CCCGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGGTTCAGGATCCCGGTACCCAg > 2:721155/1‑139 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGatat < 2:253609/80‑1 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGatat > 1:253609/1‑80 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGt > 1:793904/1‑139 (MQ=255) cTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGt > 1:735293/1‑139 (MQ=255) tGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TCCCCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATATGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGt < 1:721155/139‑1 (MQ=255) atTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATc > 2:432855/1‑139 (MQ=255) atTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑ccccccc < 2:73653/60‑1 (MQ=255) atTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑ccccccc > 1:73653/1‑60 (MQ=255) ttAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCa < 2:735293/139‑1 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac < 1:864889/139‑1 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac > 2:539658/1‑139 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac > 2:443589/1‑139 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCac > 1:402367/1‑139 (MQ=255) tAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTT‑TCACATCacc > 2:516042/1‑139 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgc < 2:928884/139‑1 (MQ=255) tgtgTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTT‑TCACATCaccgct < 1:516042/139‑1 (MQ=255) gtgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 2:402367/139‑1 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt < 2:700384/96‑1 (MQ=255) tgtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCgttgtt > 1:700384/1‑96 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac > 2:86249/1‑139 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 2:133215/139‑1 (MQ=255) gtTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctac < 1:86249/139‑1 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGa > 1:880128/1‑105 (MQ=255) ttGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGa < 2:880128/105‑1 (MQ=255) tcTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TG‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCACGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgctaccgct > 1:680231/2‑139 (MQ=255) ccATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATAc > 1:1046785/1‑139 (MQ=255) aTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa < 1:933323/70‑1 (MQ=255) aTGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGaa > 2:933323/1‑70 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg < 1:97607/71‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCg > 2:97607/1‑71 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCAt > 1:924909/1‑139 (MQ=255) ggCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCAt > 2:784882/1‑139 (MQ=255) agagTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGTTACCGCTGATACTGTGCGTAATCGc > 1:761542/1‑139 (MQ=255) gagTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGcc > 2:898361/1‑139 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGCTATCCGTCGTACCCTGATCCGCCGCGGAATCCTTGTTAAGAGCCAGTTTCCCGGTACCTAGTTTTGTTAGATCCCCGCTACCGCTGATTCtgtgtggagtcgtcc > 2:35643/1‑128 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCcgtcg > 2:229234/1‑43 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCcgtcg < 1:229234/43‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct > 2:334581/1‑113 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCaccgct < 1:334581/113‑1 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGccc > 2:1026443/1‑139 (MQ=255) agTCGGAACCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGccc > 2:211243/1‑139 (MQ=255) aCCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACg > 2:127537/1‑139 (MQ=255) aCCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACg < 2:924909/139‑1 (MQ=255) aCCGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACg < 2:793904/139‑1 (MQ=255) cGAAAGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGCAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCGCGGTACCCAGTTTTGCCACATCACCGTTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCt < 1:703924/139‑1 (MQ=255) aaaGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGcc < 2:904797/127‑1 (MQ=255) aaaGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGcc > 1:904797/1‑127 (MQ=255) aaaGCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCGACCGCTGATAGTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCa > 2:703924/1‑139 (MQ=255) gCAATT‑TC‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAGTg < 1:999279/139‑1 (MQ=255) | CGACACGCAGTGCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATT‑T‑‑CCCCCCC‑CACGATATCCGTCGTACCCTGATACGCCGCGGAATCGTTGTTAAGAGTCAGGATCCCGGTACCCAGTTTTGTCACATCACCGCTACCGCTGATACTGTGCGTCATCGCCCAGCTACGCTCAGTG > NC_000913/1594113‑1594379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |