| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,867,926 | (C)6→7 | coding (828/1140 nt) | nlpD ← | activator of AmiC murein hydrolase activity, lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,867,920 | 1 | . | C | 96.8% | 228.7 / ‑0.7 | 63 | coding (834/1140 nt) | nlpD | activator of AmiC murein hydrolase activity, lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); new base C (31/30); total (33/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
CTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑C‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCG > NC_000913/2867783‑2868044 | attaGGTAATTCTTATTTTGTTTGAATATTATCCGAATAACGTAGGCCCGCCACCCCGTAACAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:581724/136‑1 (MQ=255) gTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTGGCGATAATTACCTGTCCTTGGCTGCCTACAATAACAATCCCCTTGTTA‑c‑ccc‑cc > 1:581724/1‑139 (MQ=255) aaTCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c > 1:1274771/1‑132 (MQ=255) aaTCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:1274771/132‑1 (MQ=255) atcatTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCCATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGa > 2:907016/1‑139 (MQ=255) atcatTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGa > 1:1507128/1‑139 (MQ=255) catTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAg > 2:1359663/1‑139 (MQ=255) atTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c > 1:1717002/1‑125 (MQ=255) atTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:1717002/125‑1 (MQ=255) ttATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAgcg > 2:464208/1‑139 (MQ=255) tGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCa < 1:237881/139‑1 (MQ=255) ttGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAg < 2:1400436/139‑1 (MQ=255) tgatgaTAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc < 1:485022/119‑1 (MQ=255) tgatgaTAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc > 2:485022/1‑119 (MQ=255) gatgatAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGt > 1:1138287/1‑139 (MQ=255) gatgatAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGt > 1:189757/1‑139 (MQ=255) gatgatAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c > 2:1089217/1‑116 (MQ=255) gatgatAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 1:1089217/116‑1 (MQ=255) tAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa > 2:1626331/1‑139 (MQ=255) aTCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa < 1:129471/137‑1 (MQ=255) aTCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa > 2:129471/1‑137 (MQ=255) aCCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGcc < 2:1138287/139‑1 (MQ=255) cGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCt < 1:1195975/139‑1 (MQ=255) cGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCt > 1:1288700/1‑139 (MQ=255) tggCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc < 1:1071760/97‑1 (MQ=255) tAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc > 2:1071760/1‑99 (MQ=255) ccGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAg > 1:691937/1‑115 (MQ=255) ccGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAg < 2:691937/115‑1 (MQ=255) ccGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTc > 2:1217741/1‑139 (MQ=255) cgcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGc < 1:907016/139‑1 (MQ=255) gcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCt < 2:382077/130‑1 (MQ=255) gcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTCTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑C‑CCCACCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCt > 1:382077/1‑130 (MQ=255) gcAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGAT‑ATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCa > 2:846226/1‑139 (MQ=255) cAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c > 1:347720/1‑89 (MQ=255) cAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:347720/89‑1 (MQ=255) cgcgTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAgcg < 2:239495/139‑1 (MQ=255) cAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAgcgc > 2:608375/1‑132 (MQ=255) cAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAgcgc < 1:608375/132‑1 (MQ=255) aacaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGaa < 2:815830/83‑1 (MQ=255) aacaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGaa > 1:815830/1‑83 (MQ=255) aacaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGt < 1:1276868/94‑1 (MQ=255) aacaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGt > 2:1276868/1‑94 (MQ=255) acaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACt < 2:55643/103‑1 (MQ=255) acaacGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACt > 1:55643/1‑103 (MQ=255) cgcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTAc > 1:1445931/1‑139 (MQ=255) cgcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTAc > 1:196358/1‑139 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACt > 2:370517/1‑139 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACt < 2:196358/139‑1 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACt < 1:1626331/139‑1 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc < 1:1675851/67‑1 (MQ=255) gcgGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc > 2:1675851/1‑67 (MQ=255) gCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGt < 2:1507128/139‑1 (MQ=255) gCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc > 2:1751380/1‑64 (MQ=255) gCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c‑cc < 1:1751380/64‑1 (MQ=255) ccATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGtt > 2:414871/1‑139 (MQ=255) tCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGt > 2:1536851/1‑117 (MQ=255) tCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGt < 1:1536851/117‑1 (MQ=255) gcgATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c < 2:608136/49‑1 (MQ=255) gcgATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑c > 1:608136/1‑49 (MQ=255) gATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa < 1:831006/75‑1 (MQ=255) gATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa > 2:831006/1‑75 (MQ=255) tGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCgg < 1:137398/139‑1 (MQ=255) tGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTActgct < 1:713744/126‑1 (MQ=255) tGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTActgct > 2:713744/1‑126 (MQ=255) tCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCt > 1:752646/1‑135 (MQ=255) tCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCt < 2:752646/135‑1 (MQ=255) tCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑CGCCC‑CCTCAGCAGCGCCAAAGGTTTCTATCATCTTGCCCTCAGGCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACGGGTTGCTGTGCTGCTGACAGTCGGCTCGGt > 1:1727903/1‑139 (MQ=255) ctgcctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGtgctt < 2:189757/139‑1 (MQ=255) cctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg > 1:619354/1‑92 (MQ=255) cctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAg < 2:619354/92‑1 (MQ=255) cctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTa < 2:35817/109‑1 (MQ=255) cctgcGATATCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTa > 1:35817/1‑109 (MQ=255) tatCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCgg > 2:198199/1‑121 (MQ=255) tatCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCgg < 1:198199/121‑1 (MQ=255) tatCAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTa < 2:1445931/139‑1 (MQ=255) cAATCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCg > 1:356828/1‑139 (MQ=255) tCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGAt < 1:685295/41‑1 (MQ=255) tCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGAt > 2:685295/1‑41 (MQ=255) tCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTgg > 1:552810/1‑131 (MQ=255) tCCCCTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTgg < 2:552810/131‑1 (MQ=255) cTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa > 1:1562773/1‑36 (MQ=255) cTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGa < 2:1562773/36‑1 (MQ=255) cTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGtgct < 2:649926/118‑1 (MQ=255) cTTGTTGCC‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGtgct > 1:649926/1‑118 (MQ=255) | CTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTG‑C‑CCC‑CCTCAGAAGCGCCAAAGGTTTCGATCACTTTGCCCTCAGTCGGCCAGCGCCAGGTGGAGATAGGCGTACTGGTTGATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCG > NC_000913/2867783‑2868044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |