| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_LN832404 | 3,766,256 | C→T | 100% | intergenic (+64/+499) | EK12AG100_RS18690 → / ← EK12AG100_RS18695 | hypothetical protein/HlyD family secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_LN832404 | 3,766,256 | 0 | C | T | 85.6% | 87.1 / 7.8 | 35 | intergenic (+64/+499) | EK12AG100_RS18690/EK12AG100_RS18695 | hypothetical protein/HlyD family secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/1); new base T (12/17); total (17/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATGGAAAAGCACTCCTGCTCTTTTTTGATTAGAGCCGTCGCAGG > NZ_LN832404/3765974‑3766543 | tagaatgCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATtgat < 1:502367/289‑1 (MQ=255) atatGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATATGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGAAAAAAATAAAAAACATCATTGATATAAATTAAGTTAATATTAGAAGTGAATATAAAAATATAACATTAAGAGTAAGAAGTAATATTATGGACATtgaag > 2:758163/1‑293 (MQ=255) ttcGAATTATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATAAAATGAGGTACAAAATAGATTCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCGAGTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCtat < 2:661103/293‑1 (MQ=255) aaCAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATc < 1:290128/295‑1 (MQ=255) aaGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGat < 2:319213/295‑1 (MQ=255) aaGGAAGTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGat < 1:473954/295‑1 (MQ=255) aTTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTAATGATAAAAATATAAAATTGAAAGTTAATAGTAATATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTTCATACatgaaag > 2:767274/1‑293 (MQ=255) tctcACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATa < 1:103654/295‑1 (MQ=255) ctcACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATaa < 1:89929/295‑1 (MQ=255) aTCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTaa > 1:420855/1‑295 (MQ=255) aCAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTAAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATCTATtaata > 2:666720/1‑295 (MQ=255) gCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTcc < 1:520320/295‑1 (MQ=255) aCATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGtt > 1:50939/1‑295 (MQ=255) tttattAATTAAAGGAAAGAGCATAAGACCATAGCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCAGTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATg < 2:439123/295‑1 (MQ=255) agagAAAGATCATAAGACCATATCTTAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAAt < 1:448598/292‑1 (MQ=255) agGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAAt < 1:48124/295‑1 (MQ=255) atatCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAAt < 1:670757/295‑1 (MQ=255) aaaTCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGtata < 1:17633/295‑1 (MQ=255) aTCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATACTTAAAAGTGAAAAAGAAAATAGTTGtataaa > 2:111002/1‑293 (MQ=255) tAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACatat < 1:672700/295‑1 (MQ=255) aTCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTTCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCAAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATATTTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACAAATAtt > 2:660611/1‑295 (MQ=255) aTCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATAtt > 2:468171/1‑295 (MQ=255) aCTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCt < 1:146092/295‑1 (MQ=255) gATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGAt > 2:770634/1‑295 (MQ=255) gCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTAGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCtat > 2:197852/1‑295 (MQ=255) aaataaaataAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATAttt < 2:663074/295‑1 (MQ=255) aaataaaataAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATAttt < 1:493063/295‑1 (MQ=255) aTAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATTACCCTACATTGTGATCTATTAATTAATTATTTTTTAAAttttattg > 2:391604/1‑288 (MQ=255) aaaTCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGa < 1:684603/295‑1 (MQ=255) aTTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGAtaataa > 1:14695/1‑295 (MQ=255) cAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCATTCAGATAATAAAGCCATCATCGCa > 1:495507/1‑295 (MQ=255) atTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATgg > 1:723613/1‑295 (MQ=255) aaTATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTAGGAGGGACATTGGGGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTATGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATGGAACAGCACTCCTGCTCtt > 1:574110/1‑295 (MQ=255) ataAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCAATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCAATCATCGCAATAGATGGAAAAGCACTCCTGCTAttttt > 1:717638/1‑295 (MQ=255) aGTACTATTATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCATACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCATCAGATAATAAAGACATCATCGAAATAGATGAAAAAGCAATCATGCTCTTTTTTGATTAGAGCCGTCGCag > 2:655978/1‑295 (MQ=255) gTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATGGAAAAGCACTCCTGCTCTTTTTTGATTAGAGCCGTCGCagg > 1:44308/1‑295 (MQ=255) | TATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATCATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTT‑AAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTTTAACTTAGTTTTATAATGAATACGATAATTAAAAGTGAAGAAGAAAATAGTTGTATACATATATTCCATGACCCTACATTGTGATCTATAGATTAAATATTTTTTAAATGTGACTGTCATCCTTCAGATAATAAAGCCATCATCGCAATAGATGGAAAAGCACTCCTGCTCTTTTTTGATTAGAGCCGTCGCAGG > NZ_LN832404/3765974‑3766543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |