| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NZ_LN832404 | 3,643,941 | T→C | 75.9% | V377A (GTG→GCG) | gorA → | glutathione‑disulfide reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_LN832404 | 3,643,941 | 0 | T | C | 75.9% | 145.9 / 48.6 | 79 | V377A (GTG→GCG) | gorA | glutathione‑disulfide reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/9); new base C (33/27); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
TATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCAC‑CGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACC‑GTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGA > NZ_LN832404/3643661‑3644227 | tacatcgcgagctaTAAGTTTCAAAACCCCAAGATTAAATGTAGTTACGTGGGGGGGGTTAACACGTGTGGAGTGGGGCTGACACCGGTGGCAGTTGAAGCGGGTCGCTGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATGACAGCAACATGCCGACAGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATAc < 2:1047194/277‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |