| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 150459 = | 213 (2.080) | 3 (0.030) | 3/458 | 9.7 | 1.6% | coding (495/1239 nt) | yadC | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| ? | NC_000913 | 150584 = | 161 (1.610) | coding (370/1239 nt) | yadC | putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCATTTTCAATAGTTATTGGACCAGGATTCGCTCTGCCAGATGTATTGCAGTAAAGAATACCACCACCGGTACCTGTATCCAGGTATGACCAGTACATTTTTACCCCAGTCGGGCCGAGCTGCGTGGGTTTATAAAAAACCAAGTTGCTTGCTGTTGATGTGTAATTAAAGGTCATCTGTGCGGCAGTGGAG > NC_000913/150339‑150834 | tgtAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATAGTAACATGGTGTAATACAGACCAGGaa > 1:967111/1‑251 (MQ=255) aaaaTTCACCGGTTATGTTCTGTACTATACCCCCCATAGCCCAAAGCTTATCGTAGTCATCGGCTTTGTTGCAGCCCTTAGTTTGTAGATCGCTTTCTGTGACGTAAAAGAACAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGCTATAGATTCCTGGCGCTTGAATGTTAGTTATTGTATCGTATGCAGAGCAGACCCTTTATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGTTGTATTAAATAGTTTATGTCCg < 2:250784/251‑1 (MQ=255) aaaaTTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GTAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCg < 1:306911/251‑1 (MQ=255) aaTTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGCCTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGCAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCTTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATg > 1:579558/1‑229 (MQ=255) ttatttttggtACTTTACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTATTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTa < 2:708292/242‑1 (MQ=255) tttgtGTACTATACCACCAATAGCACAAAATTTATTGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTAtt < 1:955283/218‑1 (MQ=255) gttgtGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTAtt < 1:208149/219‑1 (MQ=255) agagacagcTATACCACCAATATCCCAAAACTTGTCGTAGTCGTCTTCTTTTTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGGTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTg < 2:749850/243‑1 (MQ=255) tgtACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAATCGTCTACTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGACCGCTATCTGTGACGGAAGAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGCTCTCAGATATGGATTCCTGGCGAATGAATGACAGTCATTGTAACGTATGCAGACCAGACCCTTAATATTAACATGGTGTAATACAGACAAGGAACTGATGTATTAAATAGTTTATGTAGGCCATATTCTTTACCTGAAtt > 2:561739/1‑250 (MQ=255) gtACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCg < 1:377968/230‑1 (MQ=255) cTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTTTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCg < 2:858884/227‑1 (MQ=255) tataCCACCAATAGCCCAAACCTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCa < 2:218184/251‑1 (MQ=255) tataCCACCAATAGCCCAAAACTTAGCGTAGTCGTCTGATTTTTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCTATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCGGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATATTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCa < 2:420779/251‑1 (MQ=255) ataCCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCg < 1:627187/225‑1 (MQ=255) accaccAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAg < 2:366693/213‑1 (MQ=255) cactactatccgatatcTTTTCGTGTTCGTCTGCTTTATTGCAACCCTTAGTTTGTGGATCGCTGTCTGTGACGGAAAATAAAAGTTCTTTGTT‑GGAGGGATCTCCTGTATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCa < 2:324976/235‑1 (MQ=255) caATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCTGACACTTGATATTAACATGGTGTAATACAGAACAGGAACAGATGTATCAAATAGTTTATGTGCGCCATAATCTTTACCTGAATTGAACATGGCAttt > 2:662850/1‑251 (MQ=255) caATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCAttt > 1:1105298/1‑251 (MQ=255) caATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCAttt > 1:68574/1‑251 (MQ=255) aTAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCATTTTc > 1:412927/1‑251 (MQ=255) ccAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTa > 1:523917/1‑196 (MQ=255) ccAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAg > 1:430551/1‑201 (MQ=255) ccAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATc > 2:208199/1‑219 (MQ=255) 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aCTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTAATGTCCGCCATAATATTTACCTGAATAGACCCTgtctattaaaaacatctga > 2:378044/1‑233 (MQ=255) ttttCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑GGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTTTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCATTTTCAATAGTTATTgg < 1:708437/248‑1 (MQ=255) tcttcttAGTTGTCGGCTTTTTTGCCACCCTTTGTTTGTAGATCTCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTT‑TGAATGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTATATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCATTTTCAATAGTTATTgg < 2:290167/245‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |