| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,101,039 | (C)7→8 | coding (585/720 nt) | yggN ← | DUF2884 family putative periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,101,032 | 1 | . | C | 88.5% | 289.7 / 36.2 | 96 | coding (592/720 nt) | yggN | DUF2884 family putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/3); new base C (44/41); total (52/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAA > NC_000913/3100933‑3101123 | ggCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAg < 2:828096/100‑1 (MQ=255) gCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTCTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c < 1:2119621/100‑1 (MQ=255) cTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c > 1:747451/1‑100 (MQ=255) cTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c > 1:746966/1‑100 (MQ=255) tttCTTCCGGAGTCACAATGGGGCTACAAACATCTTTGCCAAGCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c < 2:2106180/98‑1 (MQ=255) aTCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑c > 1:1149654/1‑100 (MQ=255) ttCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑tc‑cc < 1:2032359/100‑1 (MQ=255) tCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑ccc > 1:395088/1‑99 (MQ=255) tCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCCTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑ccc < 1:2510586/100‑2 (MQ=255) ccAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑cccn < 1:1544356/100‑3 (MQ=255) ccAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑ccca > 1:442541/1‑98 (MQ=255) cAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑cccag < 2:2155833/100‑4 (MQ=255) cAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑c‑c‑c‑cc‑cccag < 2:2478223/100‑4 (MQ=255) agagTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTTTTTTTTTTTCTACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑CGCC‑CCAgg > 2:1530675/1‑100 (MQ=255) gagTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCt > 1:885386/1‑100 (MQ=255) tCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTc < 1:2020234/100‑1 (MQ=255) cacaACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTcc > 1:1420701/1‑100 (MQ=255) acaACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTccc < 2:1482139/100‑1 (MQ=255) acaACGCGCCTACACGCATCTTTGCCAAACTGCGGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGCATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTccc < 2:2393931/100‑1 (MQ=255) caAGGCGGCTACAAAGATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTTAGGATTGCAG‑‑C‑CAC‑CC‑CTAGGCtttaca > 2:405946/1‑96 (MQ=255) caACGCGGCTACAATCTTCTTTTCCAATCTGCTGGAAATCTTTTTGCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑CGCA‑CCAGGCGTCCCa < 2:508828/100‑1 (MQ=255) caACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCa > 1:437309/1‑100 (MQ=255) caACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCa > 1:588520/1‑100 (MQ=255) caACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑C‑CCACCAGGCTTCCCa < 2:508800/100‑1 (MQ=255) aCGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGc < 1:652311/100‑1 (MQ=255) aCGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGc < 2:173644/100‑1 (MQ=255) gcgGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGcac < 1:1091283/100‑1 (MQ=255) gcgGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGcac < 2:1874325/100‑1 (MQ=255) gcgGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGcac < 1:1041825/100‑1 (MQ=255) gcgGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGcaca > 2:320835/1‑100 (MQ=255) ngCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACAt > 1:2098269/2‑100 (MQ=255) gCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGATTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACAtt > 2:427483/1‑100 (MQ=255) tACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCt < 1:2438917/100‑1 (MQ=255) aCAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTg > 2:830457/1‑100 (MQ=255) cAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTg > 1:185915/1‑100 (MQ=255) cAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGt > 1:742478/1‑100 (MQ=255) aCATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAAt < 2:35125/100‑1 (MQ=255) aCATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAAt < 2:950457/100‑1 (MQ=255) cATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATg < 2:2279631/100‑1 (MQ=255) aTCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATgg > 2:1749610/1‑100 (MQ=255) tatctGCCAAACTCCCCGAACTCTTTTTCCTGCCCTTTACCCCCGATCTTGATTGAAGATTGCCGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATggg < 2:897568/96‑1 (MQ=255) tCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCCCATTCTGTAATggg > 2:901760/1‑100 (MQ=255) tCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATggg < 1:1614354/100‑1 (MQ=255) tCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATggg < 1:496989/100‑1 (MQ=255) cTTTGCGAAACTGATGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGTTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGt < 2:1981394/100‑1 (MQ=255) cTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTTAGCATTGCAG‑‑C‑CGC‑CC‑CCAGGCTTCCCCGCACATTCTGTAATGGGt > 2:752859/1‑100 (MQ=255) tttGCCAAACTGCTGGCAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGtt > 2:1186694/1‑100 (MQ=255) tttGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAAAGGGtt > 1:2499870/1‑100 (MQ=255) tGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAc > 1:365606/1‑100 (MQ=255) ccAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGATTAAGGATTGCAG‑‑CAC‑C‑CC‑CCAGGCTTGCGAGCACATTCTGTAATTGGTTCccg > 2:1463712/1‑100 (MQ=255) aaaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAccgcc > 1:307411/1‑100 (MQ=255) aaaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAccgcc > 1:1058835/1‑100 (MQ=255) aCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACcgccgc < 2:2308738/100‑1 (MQ=255) tgGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTc > 1:1546923/1‑100 (MQ=255) ggAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCa < 1:1239146/100‑1 (MQ=255) aaTCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCCC‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGc < 2:1439610/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCAc < 1:919852/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCg < 1:1101214/100‑1 (MQ=255) tCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTc > 1:1007203/1‑100 (MQ=255) ccTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcg > 2:789766/1‑100 (MQ=255) ccTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcg < 1:2135799/100‑1 (MQ=255) ccTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcg > 2:1045492/1‑100 (MQ=255) cTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcgc > 1:24485/1‑100 (MQ=255) tGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcgcg > 2:2196497/1‑100 (MQ=255) tGCTTTTTCCACGCGGTGTGGGTTGAGGATTGCGGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcgcg < 2:490899/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGcc < 2:774781/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGcc < 1:275219/100‑1 (MQ=255) tttttCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGccc > 1:904436/1‑100 (MQ=255) ttCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCAtt > 1:2286042/1‑100 (MQ=255) 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cGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTaa < 1:1204409/100‑1 (MQ=255) gTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATg < 1:893392/100‑1 (MQ=255) gTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATg < 1:2323904/100‑1 (MQ=255) gTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑G‑C‑C‑GC‑CCAGGCTTCCCAGCACGTTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGc > 1:1871951/1‑100 (MQ=255) tttGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGc < 1:674179/100‑1 (MQ=255) tttGGATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGc < 1:739978/100‑1 (MQ=255) tGGATTGAGTGTTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTg < 1:1099915/100‑1 (MQ=255) gATTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTc > 2:1086732/1‑100 (MQ=255) aTTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTcc > 2:1543284/1‑100 (MQ=255) aTTGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTcc > 2:84967/1‑100 (MQ=255) aTTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑CGCC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTcc < 1:1572005/100‑1 (MQ=255) ttGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCt > 1:2327335/1‑100 (MQ=255) ttGAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTATGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCTTTAATGCTGTctt > 2:916582/1‑98 (MQ=255) gAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGt > 1:1037805/1‑100 (MQ=255) gAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGt > 2:2433337/1‑100 (MQ=255) gAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGt > 1:1038156/1‑100 (MQ=255) gAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGt > 1:1871859/1‑100 (MQ=255) gAGGATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCCCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATCTCATTAATGCTGTCCTGt > 1:1069378/1‑100 (MQ=255) ggATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAGTGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCGATTTCATTAATGCGGTCCTGTaa > 1:2303902/1‑100 (MQ=255) ggATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTaa > 1:1328489/1‑100 (MQ=255) ggATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTaa > 1:2569164/1‑100 (MQ=255) ggATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTaa < 1:804128/100‑1 (MQ=255) ggATTCCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGCAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTaa > 1:2451682/1‑100 (MQ=255) gATTGCAGC‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCGTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTaaa > 1:2065649/1‑100 (MQ=255) | GGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑C‑C‑C‑CC‑CCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAA > NC_000913/3100933‑3101123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |