| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,143,312 | T→G | T261T (ACT→ACG) | frwC → | putative enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,143,312 | 0 | T | G | 98.9% | 632.0 / ‑2.8 | 176 | T261T (ACT→ACG) | frwC | putative enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (84/90); total (84/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCG > NC_000913/4143216‑4143409 | gATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGaa > 2:3852892/1‑100 (MQ=255) aTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAg > 1:3836438/1‑100 (MQ=255) aTGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAg < 2:3233948/100‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAgg > 2:708694/1‑100 (MQ=255) ggCTGGCGACGCTGATTGGTTGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATTGGCTGTGTT‑GGCGGTACGGAAGGGGc > 2:141059/1‑100 (MQ=255) ggCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGc < 2:5479576/100‑1 (MQ=255) ggCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGc < 2:3410671/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCg < 1:2586692/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCg > 2:1187346/1‑100 (MQ=255) tGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGAt < 1:1326922/100‑1 (MQ=255) tGGCGACGCGGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGAAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCAATGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGAt < 2:2167990/100‑1 (MQ=255) ggCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGAtt > 2:5385898/1‑100 (MQ=255) ggCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGAtt > 1:1055596/1‑100 (MQ=255) cGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTcc > 1:4478979/1‑100 (MQ=255) gACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCt > 1:2166185/1‑100 (MQ=255) aCGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCtt < 2:4144169/100‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCtt < 2:3103976/100‑1 (MQ=255) cGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCttt < 1:3657598/100‑1 (MQ=255) gATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTcgcc < 1:79757/100‑1 (MQ=255) tGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCt > 2:2784604/1‑100 (MQ=255) tGGTCGTAAAAATTACTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGAGGCGATTCCTTTCGCCGCt < 2:5033361/100‑1 (MQ=255) ggTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTg > 2:874212/1‑100 (MQ=255) ggTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTg < 1:2971991/100‑1 (MQ=255) gTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTAATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGc > 2:3739351/1‑100 (MQ=255) tCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGcc < 2:2050832/100‑1 (MQ=255) tCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGcc < 1:2027018/100‑1 (MQ=255) tCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGcc < 1:1441644/100‑1 (MQ=255) cGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCg < 2:3993278/100‑1 (MQ=255) gTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGa > 2:4941030/1‑100 (MQ=255) tAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGAt > 2:468859/1‑100 (MQ=255) aaaaTTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATcc > 2:1236255/1‑100 (MQ=255) aaaTTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGTCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATccn < 2:4730452/100‑2 (MQ=255) ttCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGc > 1:5483235/1‑100 (MQ=255) ctcCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgt > 2:426330/1‑100 (MQ=255) ctcCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgt > 1:1921533/1‑100 (MQ=255) tcCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgtg < 1:2749052/100‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCgtgt > 1:3397723/1‑100 (MQ=255) cGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTCCGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTc < 1:2614278/100‑1 (MQ=255) gCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCa < 2:5211439/100‑1 (MQ=255) agaagaGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGACTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTGCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAtt < 2:5299179/100‑1 (MQ=255) aagaGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttcc < 1:717539/100‑1 (MQ=255) agagCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttcct < 2:1116943/100‑1 (MQ=255) gcgcGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttccttcc < 1:3799561/100‑1 (MQ=255) gcgcGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCAttccttcc > 1:116487/1‑100 (MQ=255) cgAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCcatc < 1:5308560/100‑1 (MQ=255) gAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCcatca < 1:344455/100‑1 (MQ=255) aaaCCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTGATTCCTTCcatcat > 1:3012174/1‑100 (MQ=255) aaCCGGCAAAGCTGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATg < 2:1996725/100‑1 (MQ=255) aaCCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATg > 2:1711583/1‑100 (MQ=255) ccGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGt > 1:1117079/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTc < 2:4592955/100‑1 (MQ=255) ggCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCg > 2:2665483/1‑100 (MQ=255) ggCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCg > 2:2288012/1‑100 (MQ=255) ggCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCg > 2:2288201/1‑100 (MQ=255) gCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCgg < 1:5027131/100‑1 (MQ=255) gCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCgg < 1:3962640/100‑1 (MQ=255) cAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGt > 2:70445/1‑100 (MQ=255) aaaGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGtt < 1:2311735/100‑1 (MQ=255) aaaGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGtt < 1:1203421/100‑1 (MQ=255) aaGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTc < 1:1793006/100‑1 (MQ=255) gCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAg > 1:2156729/1‑100 (MQ=255) gCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAg < 2:2479229/100‑1 (MQ=255) ggCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGtt < 2:3328151/100‑1 (MQ=255) tGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtgg < 2:256361/100‑1 (MQ=255) tGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtgg < 2:2134163/100‑1 (MQ=255) tGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtgg < 1:590567/100‑1 (MQ=255) ggTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtggt < 2:1933275/100‑1 (MQ=255) ggTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtggt < 1:1731625/100‑1 (MQ=255) ggTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTgtggt < 1:3795303/100‑1 (MQ=255) gTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCCGTTTgtggtg > 1:4773462/1‑100 (MQ=255) tggtGGGCT‑TGTTGGGCGTTACGGAAGGGGCGGTTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTAGTGc < 2:4671806/97‑1 (MQ=255) tcttGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGc < 1:2946584/97‑1 (MQ=255) tGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGc > 1:3117768/1‑100 (MQ=255) tGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGc > 2:1351391/1‑100 (MQ=255) tGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGc < 1:4192866/100‑1 (MQ=255) gATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCa < 1:1054240/100‑1 (MQ=255) aTGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAg < 2:1245542/100‑1 (MQ=255) aTGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAg < 2:3299866/100‑1 (MQ=255) aTGGGCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAg < 1:4127937/100‑1 (MQ=255) gggCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTa > 2:5055362/1‑100 (MQ=255) gggCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTa < 2:4435431/100‑1 (MQ=255) gCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAAc < 1:3437273/100‑1 (MQ=255) gCTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAAc < 1:5352011/100‑1 (MQ=255) gCTGTGTT‑GGCATTACGGAAAGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAAc < 1:4321745/100‑1 (MQ=255) cTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACt > 2:91791/1‑100 (MQ=255) cTGTGTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACt < 2:3405740/100‑1 (MQ=255) tgtgTT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTg > 2:82379/1‑100 (MQ=255) gtgtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgc > 2:1209865/1‑100 (MQ=255) gtgtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgc > 1:2426499/1‑100 (MQ=255) tgtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCGTGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgcg > 1:5106597/1‑100 (MQ=255) tgtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgcg > 1:4102567/1‑100 (MQ=255) gtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTACCTgcgg > 2:1449115/1‑100 (MQ=255) gtT‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgcgg > 1:1562868/1‑100 (MQ=255) ggt‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCAGGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgcgg > 2:388991/3‑100 (MQ=255) tt‑GGCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGACGCGTTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTgcggc < 2:5248146/100‑1 (MQ=255) gCGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCt < 2:4334753/100‑1 (MQ=255) cGTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTg < 2:1486762/100‑1 (MQ=255) gTTACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTgg > 2:5282239/1‑100 (MQ=255) tACGGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTc > 1:373882/1‑100 (MQ=255) aCTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCg < 1:3316815/100‑1 (MQ=255) | GATGGGGCTGGCGACGCTGATTGGTCGTAAAAATTTCTCCGCAGAAGAGCGCGAAACCGGCAAAGCGGCACTGGTGATGGGCTGTGTT‑GGCGTTACTGAAGGGGCGATTCCTTTCGCCGCTGCCGATCCGCTGCGTGTCATTCCTTCCATCATGGTCGGTTCAGTTTGTGGTGCAGTAACTGCGGCGCTGGTCG > NC_000913/4143216‑4143409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |