| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,942,635 | (T)7→6 | intergenic (‑68/+283) | gcvA ← / ← ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,942,629 | 0 | T | . | 98.6% | 329.3 / ‑1.3 | 70 | intergenic (‑62/+289) | gcvA/ygdI | glycine cleavage system transcriptional activator; autorepressor/DUF903 family verified lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base . (38/31); total (38/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
CTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTG > NC_000913/2942481‑2942775 | ctctTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGttt > 2:273565/1‑151 (MQ=255)ctctTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGttt > 2:30559/1‑151 (MQ=255) tcttctGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGtttt > 1:631152/1‑151 (MQ=255) tcttctGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGtttt > 2:473340/1‑151 (MQ=255) tctGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGtttttt < 2:1216167/150‑1 (MQ=255) tgcGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTg > 2:1154320/1‑151 (MQ=255) gcgcGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGa < 2:818100/151‑1 (MQ=255) cgcgAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTg > 1:226109/1‑149 (MQ=255) gTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCAtt < 2:764208/151‑1 (MQ=255) aaaCTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATtata < 1:32569/151‑1 (MQ=255) ttAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAAtt > 1:587805/1‑151 (MQ=255) tAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAAt < 1:1258437/149‑1 (MQ=255) tAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAAt < 1:584922/149‑1 (MQ=255) tAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTg > 2:1053305/1‑151 (MQ=255) cGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTg < 2:1185978/151‑1 (MQ=255) cGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTg > 1:46137/1‑151 (MQ=255) tgctgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTg > 2:10297/1‑149 (MQ=255) gctgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAg < 2:878672/150‑1 (MQ=255) gctgcGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGc < 2:215846/151‑1 (MQ=255) ggCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCt > 1:673616/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAg < 2:807547/150‑1 (MQ=255) aaaCTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCaaa < 2:1337658/151‑1 (MQ=255) cTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATAc > 1:846831/1‑151 (MQ=255) tCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATAcc > 2:41318/1‑151 (MQ=255) tCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATAcc > 1:1271142/1‑151 (MQ=255) tAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtat > 2:323424/1‑151 (MQ=255) aaGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCtata < 2:1310222/151‑1 (MQ=255) ggCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGt < 2:295035/151‑1 (MQ=255) gCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTg < 2:949711/151‑1 (MQ=255) aTTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTggc > 1:416913/1‑151 (MQ=255) ttAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTggcgg > 2:372843/1‑151 (MQ=255) cGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACt < 1:830424/151‑1 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg < 1:14607/150‑1 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTg > 1:697620/1‑149 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAg < 2:617093/151‑1 (MQ=255) cGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCg > 2:1127626/1‑151 (MQ=255) gTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCgg > 2:349565/1‑151 (MQ=255) gTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCgg < 2:1244551/151‑1 (MQ=255) ttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGa < 1:880664/150‑1 (MQ=255) ttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGa > 2:1053027/1‑150 (MQ=255) ttAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGa < 2:1285153/150‑1 (MQ=255) tAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGaa < 1:1294006/150‑1 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAAc < 2:1027400/150‑1 (MQ=255) aGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACg > 2:872726/1‑151 (MQ=255) aCATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGa > 2:1329532/1‑150 (MQ=255) aTGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGaaa > 1:805202/1‑150 (MQ=255) ggCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGt > 2:509850/1‑151 (MQ=255) aaaCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCg < 1:473357/151‑1 (MQ=255) aaCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCgg > 2:758718/1‑151 (MQ=255) aCTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGa < 2:237638/151‑1 (MQ=255) ttGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATg > 2:299901/1‑151 (MQ=255) tGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATg < 1:739542/150‑1 (MQ=255) gAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGt < 2:587781/150‑1 (MQ=255) aaTTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTg > 2:803915/1‑150 (MQ=255) aaTTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTg > 2:93037/1‑150 (MQ=255) aTTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGa > 2:1223222/1‑150 (MQ=255) tAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACtt > 1:1272807/1‑151 (MQ=255) aaCAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACttt < 1:663374/151‑1 (MQ=255) aCAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACtttt < 1:1127119/151‑1 (MQ=255) cAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTg < 2:1313108/151‑1 (MQ=255) aaTTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTgg > 2:1327462/1‑151 (MQ=255) aaTTAGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTgg > 1:750997/1‑151 (MQ=255) aGATCACACTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCtt > 1:1136659/1‑150 (MQ=255) 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acTATGTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTtgt > 1:394107/1‑151 (MQ=255) gTAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgt < 1:758136/151‑1 (MQ=255) tAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAGATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgtt > 2:281135/1‑151 (MQ=255) tAACCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgtt > 1:245770/1‑151 (MQ=255) aaCCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgttg > 2:545610/1‑151 (MQ=255) aCCTATTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgttgt < 1:1281599/151‑1 (MQ=255) aTTAG‑TTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGAtgttgtgttg < 2:918726/151‑1 (MQ=255) | CTCTTCTGCTGCGCGAGTGAAACTTAAATGGCGTGCTGCGGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTG > NC_000913/2942481‑2942775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |